⚗️ biochemistry

Structural Basis for Dual Peptidoglycan Hydrolysis by an E. faecium Minhovirus Tail Spike Lysin

تقدم هذه الدراسة البنية البلورية والتوصيف البيوكيميائي لـ ORF11، وهو ليسين ذو ذيل مدبب ثنائي الوظيفة من فيروس "بودو" (podovirus) مستخلص من بكتيريا *E. faecium*، يجمع بشكل فريد بين نشاطي الـ N-acetylglucosaminidase والـ D,D-endopeptidase لتسهيل تحلل جدار الخلية البكتيرية أثناء العدوى.

MESNAGE, S., Yue, Z., Alrafaie, A., Robertson, M., Smith, E., Evans, C., Jinquan, L., Rafferty, J., Stafford, G.2026-03-12
⚗️ biochemistry

Reverse Proteolysis Uncovers a Hidden Dimension of the Peptidome

تكشف هذه الدراسة أن إنزيمات كاتيبسين السيستين الليزوزومية تحفز التحلل البروتيني العكسي لتوليد ببتيدات اندماج غير متمثلة جينومياً، بما في ذلك المستضدات الذاتية المرتبطة بمرض السكري من النوع الأول، مما يكشف عن مسار غير معترف به سابقاً لتنويع الببتيدات والتنشيط المناعي.

Dakhili, S. Y. T., Panwar, P., Hinse, O., Rogalski, J., Foster, L. J., Bromme, D.2026-03-11
⚗️ biochemistry

In vitro reconstitution of vertebrate Sonic Hedgehog protein cholesterolysis

تُنشئ هذه الدراسة أول مقايسة حركية مستمرة تعتمد على تقنية نقل طاقة الرنين الفلوري (FRET) في المختبر لتوصيف نشاط تحلل الكوليسترول لنطاقات الطرف الكربوكسيلي لبروتين "سونيك هيدج هوج" (Sonic Hedgehog) في الفقاريات، مما يكشف عن خصوصية التوجه الفراغي الصارمة لمواد التفاعل، وظروف المنظفات الزويترونية المثلى، والقدرة على الإنقاذ الكيميائي لطفرة تحفيزية باستخدام ستيرولات مفرطة في النوكليوفيلية.

Seidel, D. C., Wagner, A. G., Pezzullo, J. L., Thayer, K. A., Beadle, S., Olejarczyk, M. L., Giner, J.-L., Callahan, B. (…)2026-03-11
⚗️ biochemistry

Alcohol dehydrogenase-mediated methanol dissimilation increases carbon efficiency in synthetic autotrophic yeast

تُظهر هذه الدراسة أن استبدال أكسيداز الكحول بإنزيم نزع هيدروجين الكحول (Adh2) لتبديد الميثانول في نوع *Komataella phaffii* يعزز بشكل كبير كفاءة الكربون، وإنتاجية الكتلة الحيوية، وعيارات المنتج في السلالات الاصطناعية ذاتية التغذية من خلال ربط أكسدة الميثانول بتوليد NADH.

Moritz, C., Lutz, L., Baumschabl, M., Glinsner, D., Gassler, T., Mattanovich, D., Ata, O.2026-03-11
⚗️ biochemistry

Structural and evolutionary insights into DAF-12 interactions with transcriptional coactivators in parasitic nematodes

توضح هذه الدراسة الآليات الهيكلية والتطورية لتوظيف المساعد المنشط DAF-12 في الديدان الخيطية الطفيلية من خلال مقاربات متعددة التخصصات، كاشفةً عن كل من السمات المحفوظة المشتركة مع المستقبلات الثديية والتفاعلات الخاصة بالطفيليات التي تقدم إطاراً جديداً لتطوير علاجات مضادة للطفيليات تستهدف هذا المفتاح التطوري الحاسم.

Mallet, M., Martin, Y., Carvalho, J., Guchen, E., Betous, R., Bechara, C., Lespine, A., Schubert, M., Bourguet, W., le M (…)2026-03-11
⚗️ biochemistry

Interdependent RNA structural motifs at the 3'-terminus of the West Nile virus genome regulate viral growth

تكشف هذه الدراسة أن أربعة من العُقد الكاذبة المترابطة عند الطرف '3 لـجينوم فيروس غرب النيل تعمل بشكل تآزري لتنظيم النمو الفيروسي وتكوين الـ sfRNA، مع لعب SLIV الدور المهيمن، وتحدد الأنماط الثالثية المحفوظة ضمن هذا التجمع كأهداف محتملة لعلاجات شاملة للفيروسات من فصيلة الفلافيفيروس.

Tsao, L. H., Brackney, D. E., Pyle, A. M.2026-03-11
⚗️ biochemistry

Proteomic study for the prediction of μCT imaging with iodine

تستخدم هذه الدراسة تحليلاً بروتيومياً متعدد المستويات لاستقصاء الأساس الجزيئي لتباين التصوير المقطعي المحوسب الدقيق القائم على اليود، حيث وجدت أنه في حين تزدحم بروتينات هيكلية محددة بالأحماض الأمينية العطرية غير المتجانسة الرابطة لليود، لا يوجد ارتباط معنوي بين الإثراء العام للحلقات غير المتجانسة وكثافة التباين النوعي للأنسجة.

Wesp, V., Barf, L.-M., Stark, H.2026-03-10
⚗️ biochemistry

Global pattern of nitrogen metabolism in marine prokaryotes

من خلال دمج مجموعات البيانات الميتاجينومية البحرية العالمية مع التعلم الآلي، ترسم هذه الدراسة الجغرافيا الحيوية والمحركات التصنيفية لمسارات استقلاب النيتروجين الرئيسية، مما يكشف عن أنماط بيئية متميزة تربط مجموعات ميكروبية محددة بالعمليات الهوائية واللاهوائية لتحسين النماذج الكيميائية الجيولوجية الحيوية.

Schickele, A., Savioz, H., Gruber, N., Guidi, L., Irisson, J.-O., Vogt, M.2026-03-10
⚗️ biochemistry

Mechanistic dissection of a dopamine-gated cation channel from Daphnia reveals key determinants of ligand selectivity and sensitivity

توضح هذه الدراسة المحددات الجزيئية لانتقائية الربيطة وحساسيتها في قناة الكاتيون المبوّبة بالدوبامين في برغوث الماء (*Daphnia magna*) (Dm-DopC1) من خلال تحديد طفرات محددة في حلقات الارتباط التي تحكم الاستجابة للكاتيكولامين وتكشف عن الملف الفارماكولوجي الهجين للمستقبل، مما يوفر رؤى حول المرونة التطورية للقنوات الأيونية المرتبطة بالربيطات خماسية الوحدات.

McRunnel, T. M., Reynoldson, T. E., Zhu, Y., Rahman, T., Hardege, I.2026-03-10
⚗️ biochemistry

A Dimeric Rocaglate Promotes Multivalent eIF4A-RNA Assembly

من خلال دمج المنتج الطبيعي روكاجلاميد (Rocaglamide) في مركب جديد يسمى بيسروكاج (BisRoc)، استطاع الباحثون ابتكار مثبط أكثر قوة وانتقائية يعمل على ربط بروتينات eIF4A بالحمض النووي الريبوزي (RNA)، مما يؤدي إلى تكوين معقدات عالية الرتبة تعمل بفعالية على كبح عملية الترجمة وتعزيز تكوين الحبيبات الإجهادية.

Shokat, K., Liu, J., Moore, M. K., Lou, K., Wassarman, D. R., Arab, A., Ojeda, S., Karakyriakou, B., Koglin, A.-S., Ott (…)2026-03-10