360 ورقة بحثية
تُظهر هذه الدراسة أنه بينما يمكن لأساليب متعددة لتحليل البيانات أن تربط بين التثبيط الكيميائي الحيوي والنشاط المضاد للفيروسات لمثبطات البروتياز الرئيسي لفيروس ميرس (MERS-CoV)، فإن نموذج حركية الإنزيم الذي يأخذ في الاعتبار التضاعف ومنحنيات الاستجابة للتركيز ثنائية الطور يوفر التنبؤ الأكثر دقة للفعالية الخلوية.
تكشف هذه الدراسة أن معقد نزع الأسيتيل من الهيستون Rpd3L يعمل كحارس بوابة استقلابي في خميرة *Saccharomyces cerevisiae* من خلال إزالة أستلة H3K9 ديناميكيًا من المحفزات النشطة عند التحولات الغذائية، مما ينسق إيقاف برامج النمو ويضمن الدقة النسخية أثناء الانتقالات الاستقلابية.
تحدد هذه الدراسة مركب 4،5،6،7-رباعي برومو-1H-بنزوتريازول (TBB) كـمثبط جزيئي صغير محدد لإنزيم NADPH فوسفاتاز MESH1، والذي يعمل بفعالية على كبح الموت الحديدي (ferroptosis) في المختبر ويقلل من موت الخلايا العصبية في نموذج لمرض ألزهايمر، مما يؤكد أن MESH1 هدف علاجي واعد.
توضح هذه الدراسة الأساس الهيكلي لتدفق الزرنيخيت من خلال تقديم بنيات مجهرية إلكترونية برديّة عالية الدقة لمضخة ArsB من بكتيريا *Leptospirillum ferriphilum*، كاشفةً عن هيئة مواجهة للداخل حيث يحدث ارتباط العناصر شبه المعدنية عبر الروابط الهيدروجينية ويكون مقترناً بنقل البروتونات عبر بقايا حمض الأسبارتيك المحفوظة.
تحدد هذه الدراسة وتصف بنيوياً وحدة فريدة لربط الأحماض النووية تسمى PXL داخل بروتين PML-1، مما يثبت ارتباطها الانتقائي بزخارف الحمض النووي الريبوزي والحمض النووي الديكسيروزي أحادية السلسلة والغنية بالجوانين، ودورها في تعديل النسخ الجيني لتنظيم التعبير الجيني والتنظيم النووي.
تقدم الورقة البحثية OptiPrime، وهو نموذج تعلم آلي ميكانيكي يحقق تنبؤاً ذا حالة فنية رائدة، وقابل للتفسير، وعام النطاق لنتائج التحرير عبر مختلف استراتيجيات التحرير وأنواع الخلايا، مما يتيح تصميم تعديلات علاجية فعالة مثل التصحيح في الجسم الحي لاضطراب عصبي في الفئران.
تستخدم هذه الدراسة تسلسل الجينوم طويل القراءة ونمذجة البنية باستخدام AlphaFold3 للتغلب على تحديات التجميع الناجمة عن التسلسلات المتكررة، حيث نجحت في تحديد وتوصيف 35 بروتينًا من بروتينات الالتصاق من نوع RTX عبر سبعة أنواع من البكتيريا سالبة الجرام لتوجيه الاستراتيجيات المستقبلية لمنع الاستعمار البكتيري والعدوى.
من خلال تطوير مقايسة GATO-seq واستخدام المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM)، تكشف هذه الدراسة أن تسلسلاً معيناً من الأحماض النووية يحفز حالة "توقف فائق" فريدة ومقاومة لعامل النسخ TFIIIS في إنزيم بلمرة الحمض النووي الريبي الثاني (RNA polymerase II)، مما يعمل على تثبيت حالة "انحراف مسار" (sidetracked) عكسية أحادية النيوكليوتيد ومتراجعة، وذلك عبر جيب مبطن بالثريونين، مما يثبت كيف يقوم التسلسل مباشرة بترميز التحكم في التوقف النسخي.
تقدم هذه الدراسة مجسات كيميائية ضوئية عالية الحساسية وسريعة تستهدف إنزيم ClbP بشكل انتقائي، مما يتيح الكشف المباشر عن بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) المنتجة للكوليباكتين في عينات البراز المعقدة لتطبيقات في أبحاث السرطان والفحص السريري.
يقدم المؤلفون Enzyme-toolkit (Enzyme-tk)، وهو مسار موحد يدمج 23 أداة مفتوحة المصدر وطريقتين مبتكرتين (Func-e وOligopoolio) لاكتشاف إنزيمات غير معروفة سابقاً لتفاعلات محددة، حيث نجح في تحديد مرشحين مستقرين حرارياً قادرين على تفكيك الملوثات من صنع الإنسان مثل DEHP وTPP.