📄 bioengineering

Efficient, Few-shot Directed Evolution with Energy Rank Alignment

تقدم هذه الورقة طريقة تطور موجه فعالة تعتمد على التعلم القليل (few-shot) تعمل على تكييف نماذج لغة البروتين مسبقة التدريب واسعة النطاق باستخدام خوارزمية ما بعد التدريب القائمة على الفيزياء الإحصائية لتوليد تسلسلات بروتينية متنوعة وعالية اللياقة من تصنيفات تجريبية متفرقة، مع توفير رؤى قابلة للتفسير حول خصائصها الفيزيائية الحيوية.

Ibarraran, S., Chennakesavalu, S., Hu, F., Rotskoff, G. M.2026-02-06
📄 bioengineering

Microvascular network organization and hemodynamic perfusion protect the brain against hypoxia

تكشف المحاكاة الميكانيكية أن تنظيم الشبكة الوعائية الدقيقة في الدماغ وتروية الدم توفران احتياطيات ذاتية لنقل الأكسجين تحمي الأنسجة القشرية من نقص الأكسجة، رغم أن التراجعات المرتبطة بالعمر في تشبع الشرايين وتوقف تدفق الشعيرات الدموية يمكن أن تضعف هذه المرونة.

Ventimiglia, T. A., Lesage, F., Linninger, A.2026-02-06
📄 bioengineering

A motif-vocabulary model of CAR T-cell intracellular domains identifies determinants of immunophenotype differentiation

من خلال فحص أكثر من 1,200 مجال داخل خلوي طبيعي في الخلايا التائية ذات مستقبلات المستضد الخيمرية (CAR T-cells)، تكشف هذه الدراسة أن التمايز في النمط الظاهري المناعي لا يتحدد من خلال زمر الإشارات الفردية، بل من خلال المخرج التوليفي المتكامل لزمر متعددة داخل مجالات التحفيز المشترك، مما يوفر إطاراً جديداً للهندسة العقلانية لمستقبلات المستضد الخيمرية (CAR).

Kelly, C., Bahr, R., Zhu, W., Keyvanfar, K., Dagur, P., Cordes, S.2026-02-05
📄 bioengineering

Sodium ion-assisted structural lipidomics for sphingolipid profiling

تُظهر هذه الدراسة أن استخدام نواتج إضافة أيونات الصوديوم بالاقتران مع مطيافية الكتلة الترادفية بالتفكك المنشط بالإلكترونات يتغلب على قيود نزع الماء للصور البروتونية لتمكين التوصيف الهيكلي عالي الثقة والمستقر والتحديد الدقيق للمجموعات الوظيفية في مختلف السفينجوليبيدات.

Takeda, H., Asakawa, D., Takeuchi, M., Tsugawa, H.2026-02-05
📄 bioengineering

Comparing metabolic engineering scenarios using simulated design-build-test-learn-cycles

تستخدم هذه الدراسة دورات "التصميم-البناء-الاختبار-التعلم" الحاسوبية عبر أربعة نماذج أيضية لتوضيح أن قدرة الفحص وهيكل مكتبة الحمض النووي (DNA) هما المحركان الحاسمان لنجاح عملية التحسين، بينما يكون لسعة التسلسل تأثير ضئيل، مما يوفر إرشادات قابلة للتطبيق لتصميم سير عمل فعال للهندسة الأيضية.

Paz, S. M., Schmitz, J., van Lent, P., Abeel, T.2026-02-05