⚛️ biophysics

Fuel-driven catalytic molecular templating

تقدم هذه الورقة نظاماً للحمض النووي (DNA) يعتمد على الوقود وخالياً من الإنزيمات، يتغلب على تثبيط المنتج لتحقيق قوالب جزيئية حفزية، مما يتيح انتشار المعلومات محددة التسلسل والتجميع المنضبط للمنتجات البوليمرية المشتركة.

Mitra, M., Mukherjee, R., Jurinovic, K., Ouldridge, T. E.2026-02-19
⚛️ biophysics

Membrane Environment Sets the Functional pKa of Ionizable Lipids

تستخدم هذه الدراسة محاكاة الديناميكا الجزيئية ذات الأس الهيدروجيني الثابت بمقياس الميكروثانية لتوضيح أن بيئة الغشاء، وتحديداً تركيب الدهون وسلوك الطور، تخفض بشكل كبير قيمة الـ pKa للدهون القابلة للتأين وتقود إعادة ترتيبات هيكلية متميزة تعتمد على الأس الهيدروجيني، مما يوفر مبادئ تصميم كمية لتحسين أداء توصيل الجسيمات النانوية الدهنية.

Trollmann, M. M. F., Rossetti, P., Böckmann, R. A.2026-02-19
⚛️ biophysics

The magnetic field-dependent fluorescence of MagLOV2 in live bacterial cells is consistent with the radical pair mechanism

تُظهر هذه الدراسة أن الفلورة غير الرتيبة المعتمدة على المجال المغناطيسي والملاحظة في بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) التي تعبر عن البروتين الفلافيني المهندس MagLOV2 تتوافق مع آلية الزوج الجذري، والتي تتميز بتأثير إيجابي يبلغ ذروته عند حوالي 1 مللي تسلا، وانعكاس في الإشارة عند 2 مللي تسلا، وتشبع فوق 70 مللي تسلا.

Ross, B. L., Lodesani, A., Aiello, C. D.2026-02-19
⚛️ biophysics

Ratiometric signaling produces robust temporal integration for accurate cellular gradient sensing

تُظهر هذه الدراسة أن الإشارات النسبية، حيث تقوم بروتينات G بدمج المعلومات من كل من المستقبلات المرتبطة وغير المرتبطة لإنشاء إشارة غير منحازة ومتوسطة زمنياً، تُمكّن الخلايا من التغلب على الضجيج الناتج عن انخفاض أعداد المستقبلات وتجاوز الحدود النظرية لاستشعار التدرج بدقة.

Ghose, D., Nolen, J., Guan, K., Elston, T., Lew, D. J.2026-02-18
⚛️ biophysics

HXMS: a standardized file format for HX-MS data

تقدم هذه الورقة HXMS، وهو تنسيق ملف معياري وخفيف الوزن يحافظ على أطياف الكتلة النظائرية الكاملة والبيانات الوصفية التجريبية الشاملة لبيانات مطيافية كتلة تبادل الهيدروجين/الدوتيريوم (HX-MS)، إلى جانب PFLink، وهي أداة بلغة بايثون لتحويل مخرجات البرمجيات الحالية إلى هذا التنسيق لتمكين المزيد من التحليل الكمي، وتحسين مشاركة البيانات، وتطبيقات تعلم الآلة المستقبلية.

Weber, K. C., Lu, C., Alvarez, R. V., Pascal, B. D., Glasgow, A.2026-02-18
⚛️ biophysics

Bifunctional Architecture Enables Substrate Catalysis and Channeling in Paracoccus TMAO Demethylase

تكشف بنيات المجهر الإلكتروني المبرد (Cryo-EM) والتحليلات الكيميائية الحيوية أن إنزيم ديميثيل TMAO في بكتيريا *Paracoccus* يعمل كإنزيم ثنائي الوظيفة يقوم بتوجيه وسائط الفورمالديهايد غير المستقرة من لبه التحفيزي إلى موقع بعيد مرتبط بالتتراهيدروفولات، مما يربط بين تحلل TMAO وأيض الكربون الواحد لتعزيز الكفاءة ومنع السمية.

Thach, T., Dhanabalan, K., Maurya, S., Han-Hallett, Y., Quan, S., Allison, J., Ramanathan, G., Subramanian, R.2026-02-18
⚛️ biophysics

In-cell cryo-electron tomography reveals differential effects of type I and type II kinase inhibitors on LRRK2 filament formation and microtubule association

تستخدم هذه الدراسة التصوير المقطعي الإلكتروني بالتبريد داخل الخلايا لتوضيح أن مثبطات الكيناز من النوع الأول (MLi-2) تعزز تكوين وتكتل خيوط LRRK2 المرتبطة بالأنيبيبات الدقيقة على نطاق واسع، مما يتيح بناء نموذج هيكلي كامل الطول، بينما تمنع مثبطات النوع الثاني (GZD-824) مثل هذه التجمعات.

Basiashvili, T., Hutchings, J., Chen, S., Karasmanis, E. P., Flaherty, W. A., Leschziner, A. E., Villa, E.2026-02-18
⚛️ biophysics

Bringing calorimetry (back) to life

يضع هذا البحث إطاراً مفاهيمياً لقياس السعرات الحرارية في حالات عدم التوازن لدراسة الأنظمة البيولوجية، مبرهناً من خلال نماذج فيزيائية حيوية لحركة الأهداب والمحركات الجزيئية أن النشاط البيولوجي يمكن أن يؤدي إلى تبعات مثيرة للاهتمام في السعة الحرارية، بما في ذلك القيم السالبة.

Khodabandehlou, F., Maes, C., Roldan, E.2026-02-18
⚛️ biophysics

Mechanism of Gating and Isoform-Specific Inhibition in Renal CLC Chloride Channels

من خلال دمج بنيات المجهر الإلكتروني المبرد (cryo-EM) مع التحليلات الحسابية، توضح هذه الدراسة الآليات الجزيئية لعمل بوابات قنوات الكلوريد CLC-K الكلوية والتثبيط النوعي للنماذج المتغايرة، كاشفةً كيف يُمكّن عروة خارج خلوية ديناميكية واختلافات إلكتروستاتيكية طفيفة في جيب الارتباط من الاستهداف الانتقائي لـ CLC-Ka دون CLC-Kb لعلاج نقص صوديوم الدم.

Chen, C.-T., Sobecks, B. L., Powers, A. S., Kreiter, J., Das, A., Barry, C. N., Chen, M., Hinman, A., Petrakian, C. F. (…)2026-02-18
⚛️ biophysics

Slow spatial migration can help eradicate cooperative antimicrobial resistance in time-varying environments

تُظهر هذه الدراسة أنه في البيئات ذات البنية المكانية والمتغيرة زمنياً، يمكن للهجرة البطيئة ولكن غير الصفرية أن تتآزر مع التقلبات البيئية لتسريع انقراض واستئصال مقاومة مضادات الميكروبات التعاونية، مما يتحدى الرؤية التقليدية التي تفترض أن الانتشار يعزز عموماً تعايش السلالات.

Hernandez-Navarro, L., Distefano, K., Täuber, U. C., Mobilia, M.2026-02-17