370 ورقة بحثية
توضح هذه الدراسة الآلية الدورانية لمحرك سوط بكتيريا *Campypylobacter jejuni* من خلال إثبات أن التميؤ غير المتماثل والتبديل المتناوب للبرتنة لبقايا D22 المزدوجة، مقترناً بإزالة السدادة والتغيرات في تشكل السلسلة الجانبية، هي عمليات أساسية لتحويل تدرجات الأيونات إلى قوة ميكانيكية.
تكشف هذه الدراسة أن سوء طي البروتين الناتج عن أخطاء التشابك يزيد بشكل كبير من احتمالية التحلل البروتوزومي بوساطة اليوبيكويتين في الخلايا البشرية، بينما يتجنب حوالي ثلث هذه البروتينات سيئة الطي عملية التحلل عبر اتخاذ حالات قريبة من الحالة الأصلية.
باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية طويلة المدى وطرق الذكاء الاصطناعي وتعلم الآلة، توضح هذه الدراسة الآلية الذرية التي يقوم من خلالها بروتين nsp10 المرن بتنشيط nsp16 في فيروس SARS-CoV-2 عبر مزلاج كاره للماء، مما يؤدي إلى تغييرات تشكيلية تفتح موقع ربط الحمض النووي الريبي (RNA) وتنظم تبادل SAM/SAH لتمكين التهرب المناعي الفيروسي.
تستخدم هذه الدراسة محاكاة الديناميات الجزيئية لجميع الذرات لتوضيح أن زيادة تركيزات الليبومانان والليبوارابينومان في الأغشية الداخلية للمتفطرات تحفز انتقالاً إلى حالة تشبه الفرشاة المدمجة التي تقلل من إمكانية وصول المذيب وتُبطئ انتشار الدهون عبر الطبقة الثنائية، مما يضع إطاراً جزيئياً لفهم دور الغشاء كحاجز فيزيائي منظم ومنصة للفوعة.
تكشف هذه الدراسة، باستخدام تصوير الجزيء المنفرد، أن حركة بروتينات G ثلاثية الوحدات في الخلايا الحية تختلف باختلاف النوع وتتحدد أساساً من خلال الوحدة الفرعية Gα، حيث تُظهر البروتينات ثلاثية الوحدات التي تحتوي على G12/13 انخفاضاً ملحوظاً في الحركة الجانبية مقارنة بتلك التي تحتوي على الوحدات الفرعية Gi/o أو Gs أو Gq.
مستوحاةً من الأنظمة البيولوجية، تقدم هذه الورقة شبكة إزاحة خيوط الحمض النووي (DNA) خالية من الإنزيمات تستخدم قوالب من الحمض النووي أحادي الخيط لتجميع متعدِّدات محددة وطويلة العمر غير تساهمية من مجمع أحادي القسيمات بشكل حفزي وذاتي تحت ظروف متساوية الحرارة، مما يتجاوز بفعالية تثبيط الناتج لإنشاء مجموعات بعيدة عن حالة التوازن.
يقدم المؤلفون VULCROM، وهو مجهر ضوئي بردي فائق الاستقرار وخالٍ من الفراغ، يتيح إجراء مجهرية الارتباط الضوئي والإلكتروني فائقة الدقة روتينية (cryo-SR-CLEM) على العينات البيولوجية المجمّدة، حيث نجح في تحليل البنى الخلوية نانوية المقياس في كل من الأنسجة الحيوانية والنباتية من أجل التصوير المقطعي الإلكتروني البردي.
من خلال دمج المجهر الإلكتروني برد التجميد (cryo-EM) والرنين المغناطيسي النووي للحالة الصلبة (solid-state NMR)، توضح هذه الدراسة الأساس الهيكلي وآليات البوابة الديناميكية لقناة MscL في بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli)، كاشفةً عن كيفية قيادة التفاعلات بين الدهون والبروتين والتباين الشكلي للانتقال من الحالات المغلقة إلى الحالات المفتوحة.
لقد سحب المؤلفون هذه المخطوطة بسبب تكرار النشر ولا ينبغي الاستشهاد بها، حيث تتوفر النسخة الصحيحة من العمل تحت معرف كائن رقمي (DOI) مختلف.
توضح هذه الدراسة الآلية الهيكلية والديناميكية التي يثبط بها بروتين Bcl-xL الموت الخلوي المبرمج بشكل غير مباشر، كاشفةً أن المعقد المتباين (heterodimer) المكون من Bcl-xL وtBid يرتكز على الغشاء الميتوكوندري حيث يتم حشر نطاق BH3 الخاص بـ tBid بين الأخدود الكاره للماء لـ Bcl-xL ورؤوس الغشاء، بينما تظل حلزونات طرفه الكربوني (C-terminal) مرتبطة ديناميكياً بالطبقة الثنائية.