311 ورقة بحثية
تُعد VDJdive وECLIPSE طرقاً حوسبية تستخدم خوارزمية توقع تعظيم (expectation-maximization) لفك غموض الأنماط النسيلية (clonotypes) في بيانات تسلسل مستقبلات الخلايا التائية (TCR) أحادية الخلية والناتجة عن حالات سقوط السلاسل (chain dropouts) أو العيوب التقنية، مما يعزز دقة حجم النسيلة ويحسن تتبع النسائل التائية عبر الظروف البيولوجية المختلفة.
تكشف هذه الدراسة أن تفاعلات SLAMF1:SLAMF1 المتجانسة بين الخلايا التائية الفطرية والعدلات تحفز إطلاق عوامل ذائبة تنشط العدلات لقتل الممرض الفطري *Blastomyces dermatitidis* بفعالية.
تستخدم هذه الدراسة النسخ المتماثل المكاني لتوضيح أن محور CCL19-CCR7 هو وسيط رئيسي في استقطاب الخلايا التائية في اختبار الجلد بالليشمانين، مما يوفر مؤشرات حيوية بالغة الأهمية لدعم تطوير ونشر مستضدات الليشمانين لمراقبة الأمراض وتقييم فعالية اللقاحات.
تستخدم هذه الدراسة نموذج فأر معدل جينياً عبر التعطيل الجيني والنسخ الوراثي المكاني لتوضيح أن بروتين الأوستيوبونتينتين (Osteopontin) المشتق من المضيف ومن الورم يلعب أدواراً متميزة ومتعاونة في انتقال سرطان القولون والمستقيم إلى الكبد من خلال تحفيز تكاثر الورم، وتعديل استقطاب الخلايا البلعمية، وتثبيط الخلايا التائية، مما يحدد حصر بروتين الأوستيوبونتين كاستراتيجية علاجية واعدة.
تكشف هذه الدراسة أن السيتوكين IL-22 يعمل كعامل محفز للفيروسات من قبل فيروسات الهربس من نوع غاما عبر تعزيز توسع المراكز الإنتاشية والاعتلال المناعي متعدد النسائل، مما يسهل ترسيخ الكمون الفيروسي مدى الحياة والإمراض.
تكشف هذه الدراسة أن مستقبل الخلايا القاتلة الطبيعية KIR2DL4 يستخدم مفتاحًا ثنائي الكبريتيد خيفيًا (allosteric) بين تكوينات Cys10-Cys28 وCys28-Cys74، والذي ينظمه إنزيم بروتين ثنائي كبريتيد الإيزوميراز (protein disulfide isomerase)، للتحكم في انتقاله من حالة غير نشطة إلى شكل يرتبط بـ HLA-G ويحفز عملية الالتقام الخلوي ويدعم تطور المشيمة.
تحدد هذه الدراسة بروتين PTBP1 البطاني كمنظم حاسم لاعتلال الأوعية الدموية في الطعوم القلبية، حيث تُظهر أن حذفه يحافظ على الوظيفة الميتوكوندرية ويثبط الاستجابات الليفية والمناعية للحد من إصابة الطعم المزمنة.
تحدد هذه الدراسة قمة بروتين S2 المدفونة في بروتين سبايك لفيروس SARS-CoV-2 باعتبارها حاتمة (epitope) سائدة مناعيًا تثير استجابة أجسام مضادة عامة واسعة النطاق وغير محيدة، ومقتصرة على السلالة الجرثومية IGHV3-30، مما يسلط الضوء على عقبة رئيسية أمام تطوير لقاحات شاملة للفيروسات التاجية والحاجة إلى تصميم مستضدات دقيق لتوجيه المناعة نحو أهداف أكثر قدرة على التحييد.
من خلال دمج البيانات متعددة الأوميكس مع التعلم العميق، تكشف هذه الدراسة أن البلاعم السنخية المقيمة في الأنسجة تظهر استجابات التهابية أكثر انضباطاً من الخلايا الوحيدة المستدعاة، وذلك بسبب بنية شبكة تنظيم جيني مستقرة تتمحور حول PU.1 و CEBP{beta}.
تستخدم هذه الدراسة التنميط المتعدد الأوميات أحادي الخلية المتكامل والتحقق الوظيفي لإثبات أن الخلايا البائية البشرية تتبع مسارات تمايز متميزة لتكوين الخلايا البلازمية، مع وجود مسارات مستقلة عن المركز الإنتاجي (germinal center) تتضمن وسيطاً عابراً من نوع CD30+ مدفوعاً بـ MEF2C يؤدي إلى خلايا بلازمية من نوع CD44v9+، بينما تتجاوز المسارات المعتمدة على المركز الإنتاجي هذا الوسيط لتوليد خلايا بلازمية سالبة لـ CD44v9.