🦠 microbiology

Diversity and stability of the gut microbiome of naked mole-rat (Heterocephalus glaber), the longest-lived rodent

تكشف هذه الدراسة أن الميكروبيوم المعوي لخلد النمل فائق الطول مستقر تصنيفياً عبر فترة حياته ومتميز وظيفياً، حيث يتميز بمنتجات ميثان من العتائق فريدة وإنزيمات هاضمة للجدار الخلوي النباتي تشبه تلك الموجودة لدى المجترات، وقد تساهم في انخفاض معدل أيضه وطول عمره.

Rakhimov, A., Yasuda-Yoshihara, N., Arita, M., Okumura, K., Kawamura, Y., Oka, K., Mori, H., Wakabayashi, Y., Baba, Y. (…)2026-02-17
🦠 microbiology

A Python module for programmatic access to TrypTag genome-wide subcellular protein localisation data in Trypanosoma brucei

تقدم هذه الورقة وحدة برمجية بلغة بايثون توفر وصولاً برمجياً إلى مجموعة بيانات التوطن داخل الخلايا على مستوى الجينوم لـ *Trypanosoma brucei* من مستودع TrypTag، مما يمكّن الباحثين من استرجاع الصور، والبحث حسب التوطن، وتحليل مورفولوجيا الخلية للكشف عن عدم التماثل البروتيني القائم على العمر في العضيات السوطية.

Dobramysl, U., Wheeler, R. J.2026-02-17
🦠 microbiology

Characterisation of naturally occurring MERS-CoV Spike mutations and their impact on entry and neutralisation.

تُوصّف هذه الدراسة طفرات بروتين "سبايك" (Spike) لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (MERS-CoV) التي تحدث بشكل طبيعي باستخدام نظام التنميط الكاذب للفيروسات البطيئة، كاشفةً أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة النوعية يعزز دخول الفيروس ويزيد من مقاومته للتحييد بواسطة مصل المرضى، مما يسلط الضوء على الحاجة إلى استمرار المراقبة لتقييم المخاطر المتطورة على الصحة العامة.

Dempsey, R., Goldswain, H., Newman, J., Thakur, N., MacGill, T., Myers, T., Orr, R., Bailey, D., Stuart, J. P., Aljabr (…)2026-02-17
🦠 microbiology

Aurora vent field is a hotspot for microbial hydrogen oxidation in the Arctic Ocean

تستخدم هذه الدراسة الميتاجينوميات للكشف عن أن حقل فوهات "أورورا" الغني بالهيدروجين في المحيط المتجمد الشمالي يدعم مجتمعاً ميكروبياً متنوعاً ومرناً أيضياً، بما في ذلك أنواع جديدة من "الزيتا بروتيوبكتيريا" (Zetaproteobacteria) و"الأكويفيكوتا" (Aquificota)، حيث يمتد إمكان أكسدة الهيدروجين واسع النطاق إلى ما هو أبعد من الكائنات ذات التغذية الكيميائية الإلزامية ليشمل الكائنات غير ذاتية التغذية، مما يعزز كفاءة انتقال الكربون في الشبكات الغذائية في أعماق البحار.

Olesin Denny, E., Hribovsek, P., Pereira, S. I., Argentino, C., Panieri, G., Mall, A., Vulcano, F., Stokke, R., Reeves (…)2026-02-17
🦠 microbiology

A protocol for chemical competence in phytopathogenic Ralstonia

تقدم هذه الورقة بروتوكولاً مفصلاً خطوة بخطوة لاستحثاث الكفاءة الكيميائية في سلالات مجمع أنواع "رالستونيا سولانارساروم" عبر المعالجة بكلوريد الكالسيوم، مدعوماً ببيانات الفعالية الكمية والأساس المنطقي الكامن وراء تطويره.

Cowell, T. C., Guillome, N. R., Cope-Arguello, M. L., Prasad, N. N., Lowe-Power, T. M.2026-02-16
🦠 microbiology

In vitro exposure to non-antipseudomonal antibiotics (NAPA) induces Pseudomonas aeruginosa resistance to antipseudomonal antibiotics (APA)

تُظهر هذه الدراسة أن التعرض بجرعات دون المثبطة للمضادات الحيوية التي تفتقر إلى نشاط ذاتي مضاد للزائفة الزنجارية (NAPA) يؤدي بشكل متكرر إلى اختيار أنماط ظاهرية وراثية متعددة المقاومة للأدوية في بكتيريا *Pseudomonas aeruginosa* من خلال طفرات تقاربية في الجينات التنظيمية التي تتحكم في التدفقات والمضخات وتعبير بيتا لاكتاماز، مما يتحدى الافتراض السريري بأن مثل هذه الأدوية تُعد خيارات آمنة عندما لا تكون الزائفة الزنجارية هي الهدف الأساسي.

Lasry, D., Harrison, L. B., Bamba, R., Corsini, R., Yansouni, C. P., Cheng, M., Lee, T. C., Lawandi, A. L.2026-02-16
🦠 microbiology

Phenotypic diversity of yeasts curated in the 5th edition of The Yeasts: A data-driven visualization approach

تُجمّع هذه الدراسة وتُصور البيانات المظهرية لما يقرب من 1,300 نوع من الخميرة من الطبعة الخامسة من كتاب "الخمائر" (The Yeasts) لتكشف أن الخمائر تُظهر تنوعاً أيضياً وإيكولوجياً أكبر بكثير مما توحي به الكائنات النموذجية، مع وجود أنماط تطورية متميزة في استهلاك الكربون وسمات النمو التي تؤكد إمكاناتها الواسعة خارج الإعدادات المختبرية.

Seike, T., Ide, M., Yamamoto, M., Yurimoto, H., Shiraishi, K.2026-02-16
🦠 microbiology

Environmental filtering drives cryptic diversity and shifting interaction networks across lake, ephemeral pond, and desiccated microbial mat communities in the Untersee Oasis, East Antarctica

تكشف هذه الدراسة أن الترشيح البيئي ومحدودية الانتشار يقودان استراتيجيات تجميع متباينة وشبكات تفاعل متغيرة بين المجتمعات البكتيرية وحقيقية النواة عبر موائل بحيرة أونترسي، حيث تُظهر البكتيريا انتشاراً عالياً عبر الموائل مع تخصص على مستوى السلالة، بينما تُظهر حقيقيات النوى محدودية انتشار قوية وانتقالاً من التفاعلات التسهيلية إلى التفاعلات التنافسية تحت إجهاد الجفاف.

Vimercati, L., Chakrabarti, I., Lindley, A., Greco, C., Andersen, D. T., Jungblut, A. D.2026-02-16
🦠 microbiology

Paired in situ and molecular analyses identify mechanisms of pathogen persistence within environmental communities

تجمع هذه الدراسة بين علم الأوميكس في الموقع (in situ omics) وعلم الجينوم الوظيفي على مستوى العزلات لتكشف أن الممرضات الانتهازية مثل بكتيريا الإشريكية القولونية (*E. coli*) تستمر في النظم البيئية للمياه العذبة من خلال التعبير النشط عن جينات استقلاب الأحماض الأمينية وتكوين الغشاء الحيوي (biofilm) بوساطة بروتين الكيرلي (curli)، مما يعزز قدرتها التنافسية ضد الميكروبات الأصلية.

Nunez, C., Watts, T. D., Nguyen, T. K. N., Solari, J., Jirapanjawat, T., Nguyen, T. N. T., Howells, G., Valentin-Alvarad (…)2026-02-14
🦠 microbiology

Predator avoidance promotes inter-bacterial symbiosis with myxobacteria in polymicrobial communities

تكشف هذه الدراسة أن البكتيريا المخاطية المفترسة تشكل شراكات تكافلية مستقرة مع أنواع من جنس *Microviriga* في النظم البيئية للتربة، مدفوعة بالتكامل الأيضي وتطور آليات محددة تسمح للفريسة بتجنب الافتراس مع الحفاظ على قدرة المفترس على صيد بكتيريا أخرى.

Khanal Pokharel, S., Walsh, S., Shehata, N., Ahearne, A., Belin, D., Larson, B., Tabor, B., Wall, D., Stevens, D. C.2026-02-14