🦠 microbiology

Temporal dynamics of microbiome communities within urban compost piles undergoing the heat process

تستخدم هذه الدراسة الميتاجينوميات ذات القراءة الطويلة لإثبات أن التعاقب الميكروبي المدفوع بدرجة الحرارة في أكوام السماد الحضري يقلل بفعالية من مسببات الأمراض المنقولة بالغذاء وجينات مقاومة مضادات الميكروبات، مع الكشف عن مستودع متنوع من العاثيات المرتبطة بتلك البكتيريا.

Montes, A., Klopmanbaerselman, D., Lee, B., Quinones, B., Shim, H.2026-02-11
🦠 microbiology

Choice of host model and manipulated transcription regulator dictates T6SS effector-mediated toxicity

تُظهر هذه الدراسة أن سمية مؤثرات نظام الإفراز من النوع السادس (T6SS) لبكتيريا *Vibrio proteolyticus* تعتمد على المضيف وتخضع لرقابة تنظيمية معقدة، حيث يمكن لمنظمات نسخ مختلفة أن تحفز تنشيطاً جزئياً فقط لمجموعة المؤثرات.

Cohen, H., Elias, E., Bar Yaacov, D., Salomon, D., Gerlic, M.2026-02-11
🦠 microbiology

Development, field-testing and optimization of tools to quantify soil-transmitted helminths in fecal sludge from school pit latrines in Ethiopia

طورت هذه الدراسة واختبرت ميدانياً طريقة فعالة من حيث التكلفة لمراقبة برامج الديدان الطفيلية المنقولة بالتربة من خلال قياس كمية بيوض الديدان في الحمأة البرازية من مراحيض الحفر المدرسية، ووجدت أن أخذ عينات من عدة فتحات قرف (مراحيض) أكثر فعالية من حيث الدقة من التحليل المتكرر لعينة واحدة.

Tiruneh, A., Mekonnen, Z., Roose, S., Ayana, M., Velde, F. V., C. Mrimi, E., Gilleard, J., R. Templeton, M., Birhanu, Z. (…)2026-02-11
🦠 microbiology

M1 protein expression determines niche-specific spread of Streptococcus pyogenes

تُظهر هذه الدراسة أنه في حين أن بروتين M الموجود على سطح الخلية ضروري للاستعمار التنفسي، فإن بروتين M المفرز (الذائب) هو المحرك الرئيسي للبقاء في اللمف والانتشار الجهازي أثناء عدوى الأنسجة الرخوة الغازية، مما يشير إلى أن دور بروتين M في الضراوة يعتمد على النوع النوعي للمكان (النيش).

Huse, K. K., Jauneikaite, E., Lynskey, N. N., Reeves, L. C., Reglinski, M., Siggins, M. K., Turner, C. E., Tajadura-Orte (…)2026-02-11
🦠 microbiology

Defence systems drive accessory genome interactions in Pseudomonas aeruginosa.

من خلال تحليل مجموعة بيانات عالمية تضم ٢٩٤٠ جينومًا لبكتيريا الزائفة الزنجارية (*Pseudomonas aeruginosa*)، تكشف هذه الدراسة أن أنظمة الدفاع البكتيرية هي المحركات الأساسية لتفاعلات الجينوم الإضافي، حيث تُظهر توزيعات إيكولوجية متميزة وعلاقات تعاونية أو تنافسية معقدة تشكل بشكل كبير تطور الجينوم البكتيري ومرونته.

Chong, C. E., Weimann, A., Agapov, A., Fothergill, J. L., Brockhurst, M. A., Parkhill, J., Floto, R. A., Szczelkun, M. (…)2026-02-09
🦠 microbiology

Ecological Filtering is a Better Predictor of Microbiome Assembly than Coevolution in Marine Sponges

تُظهر هذه الدراسة أن الترشيح البيئي المدفوع بفسيولوجيا ترشيح المضيف (الأنماط الظاهرية HMA مقابل LMA) في إسفنجات البحر الأحمر البحرية هو مؤشر أقوى لتجمع الميكروبيوم من التطور المشترك بين المضيف والميكروب، مما يتحدى الرؤية التي تعتبر الكائنات المتكاملة (holobionts) للإسفنج وحدات متطورة بشكل مشترك بدقة.

van der Sprong, J., Tirumalasetty, V., Schaetzle, S., Voigt, O., Erpenbeck, D., Woerheide, G., Vargas, S.2026-02-09
🦠 microbiology

Efficient replication of influenza D virus in the human airway underscores zoonotic potential

تُظهر هذه الدراسة أن فيروس الإنفلونزا د (Influenza D) يمكنه التكاثر بكفاءة في أنسجة المجاري التنفسية البشرية من خلال التملص من الاستشعار المناعي الفطري، مما يشير إلى إمكانات كبيرة وغير مقدرة كفاية للانتقال من الحيوان إلى الإنسان تستوجب تعزيز المراقبة ومزيد من الاستقصاء.

Sanders, C. G., Liu, M., Fusco, J. A., Ohl, E. M., Tarbuck, N. N., King, E. M., Huey, D., Fabrizio, T. P., Chen, P., Pan (…)2026-02-08
🦠 microbiology

Quantitative RNA pseudouridine landscape reveals dynamic modification patterns and evolutionary conservation across bacterial species

تقدم هذه الدراسة أول رسم خرائط كمي شامل للترانسكريبتوم لتعديلات البسودوريدين عبر خمسة أنواع بكتيرية باستخدام طريقة BID-seq المحسنة، كاشفةً عن ديناميكيات تعتمد على مرحلة النمو، والتحفظ التطوري، والتأثيرات الوظيفية على استقرار الحمض النووي الريبي (RNA) والترجمة، مع تأسيس إطار عمل للتعلم العميق (pseU_NN) للتنبؤ بمواقع التعديل.

Xu, L., Shen, S., Zhang, Y., Guo, Z., Lu, B., Huang, J., Li, R., Shen, Y., Zhang, L., Deng, X.2026-02-07
🦠 microbiology

Orion Microbiome Database: mapping constellations in the microbiome universe

تعالج قاعدة بيانات أوريون للميكروبيوم (Orion Microbiome Database) مشكلة التجزئة وعدم الاتساق في بيانات الميكروبيوم العامة من خلال توفير منصة معيارية وقابلة لإعادة الإنتاج تدمج مجموعات بيانات تسلسل الجينوم الكامل (whole-genome shotgun) مع بيانات وصفية منسقة وأدوات تفاعلية لتسريع البحث والتعليم.

Wu, G., Tang, Y., Du, G., Heibeck, N., Scaliogtti, J., Francis, W., Tang, S.2026-02-06