🧬 الأحياء

Polymorph-Independent Resistance to Generative Protein Design Across Five Tau Fibril Folds: A Cross-Tauopathy Benchmark

تُظهر هذه الدراسة أنه، على عكس أنظمة الأميلويد الأخرى حيث يتباين نجاح التصميم باختلاف التعدد الشكلي البنيوي، فإن جميع طيات ليفات بروتين "تاو" الخمس المتميزة عبر اعتلالات "تاو" المختلفة مقاومة بشكل موحد لتصميم روابط البروتين التوليدية، مما يشير إلى أن المقاومة هي خاصية محددة بالعائلة وليست سمة عالمية للهندسة الأميلويدية.

Siddhardha Nanda2026-09-22
🧬 الأحياء

Beyond Accuracy: Benchmarking the Reproducibility and Robustness of Single-Cell Embeddings

تقدم هذه الورقة BioBench، وهو إطار عمل يتحدى الافتراض القائل بأن قابلية التكرار ترتبط بفئة النموذج من خلال إثبات أن الحلّال الخوارزمية، وليس ما إذا كانت الطريقة خطية أو عميقة، هي المحددات الأساسية لاستقرار تضمين الخلية الواحدة عبر درجة الاستقرار البيولوجي.

Advika Jain2026-09-22
🧬 الأحياء

Cell-free DNA profiling for cancer detection and monitoring in dogs: a cross-study benchmark

تُرسخ هذه الدراسة إطار عمل موحد للتقييم المرجعي باستخدام 896 عملية تسلسل للبلازما من 341 كلباً لإثبات أن مجموعة سمات جديدة قائمة على طول الشظايا (FlowTail)، عند دمجها مع مقدرات عبء الورم الحالية، تتيح كشفاً عن السرطان، وتمييزاً للأنواع، ومراقبة طولية قوية وقابلة للنقل ودقيقة عبر دراسات مستقلة للكلاب.

Bin Li, Ming-shan Tsai, Floryne O. Buishand2026-09-22
🧬 الأحياء

Multi-omics analyses reveal hypoxia-induced CHD2 as a key driver of malignant progression and microenvironment remodeling in HCC via the TGF-β/SMAD axis

تحدد هذه الدراسة بروتين CHD2 الناجم عن نقص الأكسجة كعامل مسبب للأورام في سرطان الخلايا الكبدية، حيث يعزز التطور الخبيث والتهرب المناعي من خلال تنشيط مسار TGF-β/SMAD، مما يجعله مؤشراً حيوياً محتملاً وهدفاً علاجياً.

YICHEN YANG, Ren Bingyi, Sheng Kai, Bai Zhiyuan, Ren Yang, Yi Lv, Liu Kang2026-09-22
🧬 الأحياء

In Vivo Evaluation of the Efficacy, Biosafety, and Bioavailability of Potential NBC Probiotic Strains

تُظهر هذه الدراسة أن خمس سلالات محددة من بكتيريا حمض اللاكتيك (NBC99، وYEA81، وSA74، وNBC5527، وNBC2255) تقلل بفعالية من الإجهاد التأكسدي، وتعزز سلامة الحاجز المعوي وحاجز الدم في الدماغ، وتخفف من الالتهاب الجهازي لدى الفئران دون التسبب في سمية، مما يدعم إمكانية اعتبارها معززات حيوية آمنة لتعديل المحور المعوي الدماغي.

Elvan Anadol, Ateş Kara, Hasan Tezer, Şaban Cem Sezer, Zeynep Yığman, Deniz Billur, Beyza Aydoğan Kara, Sibel Söylemez (…)2026-09-22
🧬 الأحياء

A Visual Metric for Biological Membrane Instability: Geometric Coupling of Lateral Expansion and Acyl Chain Splay as a Geometric Precursor Signature of Packing Defects in Glutamate Transporter Splice Variant Self-assemblies

تقدم هذه الدراسة مخطط هندسة عيوب التعبئة (PDGP)، وهو أداة قائمة على لغة بايثون تربط بين مساحة فورونوي المحلية وتفرع السلسلة الأسيل لتحديد عيوب التعبئة الكارهة للماء، كاشفةً أن متماثلات ناقل الغلوتامات المبتورة تسبب اضطراباً في الغشاء وإشغالاً للعيوب أكبر من التجمعات الأكبر حجماً، وهو ما يخالف التوقعات الأولية.

Alper Karagöl, Taner Karagöl2026-09-22
🧬 الأحياء

A Reproducible Meta-Analytic Pipeline for Quantifying Ecological Bottlenecks, Alpha Diversity Decay, and Core Biomarker Fluctuations in Ex Vivo Human Gut Microbiota Fermentations

تقدم هذه الورقة مساراً إحصائياً قابلاً لإعادة الإنتاج يعتمد على لغة R، يعمل على قياس الانجراف البيئي الفوري في عمليات تخمير الميكروبيوتا المعوية البشرية خارج الجسم (ex vivo)، مما يكشف عن انهيار حاد بنسبة 87.9% في الثراء التصنيفي وإعادة هيكلة مجتمعية كبيرة عند الانتقال من بيئات داخل الجسم (in vivo) إلى بيئات المفاعل الحيوي الاصطناعية.

Ismael Akala2026-09-22
🧬 الأحياء

Brainana: an end-to-end preprocessing framework for macaque neuroimaging

إنّ Brainana هو إطار عمل مؤتمت، ومُحوى (containerized)، ومتاح سحابياً، صُمم لتوحيد وتبسيط المعالجة المسبقة الشاملة لبيانات التصوير العصبي لقرود المكاك عبر دمج نماذج التعلم العميق، والتحسينات التشريحية، وضبط الجودة لضمان نتائج قابلة للتكرار، وقابلة للتوسع، وقابلة للمقارنة عبر الدراسات.

Xingyu Liu, Yijun Zhang, Zi Yin, Zonglei Zhen, Michael Arcaro2026-09-22
🧬 الأحياء

ATP5PB suppresses colorectal cancer progression by restraining the Galectin-3/PI3K/AKT signaling axis

تُظهر هذه الدراسة أن ATP5PB يعمل ككابح للأورام في سرطان القولون والمستقيم من خلال التفاعل مع Galectin-3 لتثبيط مسار إشارات PI3K/AKT، مما يؤدي إلى كبح تطور الورم ويعمل كعلامة بيولوجية إنذارية محتملة وهدف علاجي.

Min Chen, Binbin Ding, Lin Tan, Qiongjia Ai, Qian Wang, Liye Zhu, Jiean Huang2026-09-21
🧬 الأحياء

Podocyte-specific CerS6 Drives Renal Aging via C16 Ceramide-mediated p53-p21 Senescence

تحدد هذه الدراسة إنزيم CerS6 الخاص بالخلايا القدمية كعامل محرك رئيسي لشيخوخة الكلى، حيث أظهرت أن ارتفاع مستواه يؤدي إلى تراكم السيراميد من النوع C16، وتنشيط مسار p53-p21، وما يعقب ذلك من شيخوخة الخلايا القدمية، في حين أن حذفه يحمي بفعالية من تدهور وظائف الكلى المرتبط بالعمر.

Guanshi Zhang, Qingwei Zhao, Yitong Ding, Nagarjunachary Ragi, Naulle Lee, Qinyue Wang, Hak Joo Lee, Shiqi Zhang, Falgun (…)2026-09-21