🧬 biology

Functional Immunopeptidomics by Characterizing Immunopeptides Against HLAs, TCRs, and Antibodies

تقدم هذه الدراسة منصةً وظيفية لعلم الببتيدات المناعية تعزل الببتيدات المرتبطة بالمستقبلات من عينات سريرية فردية للتمييز بين المستضدات النوعية للأورام واللجينات (ligands) السلبية لـ HLA، مما يكشف عن آليات تنظيمية متميزة بين عرض HLA-I وHLA-II ويحدد أهدافاً ذات أولوية عالية للعلاج المناعي في سرطان الخلايا الكلوية.

Hongyi Liu, Effram Wei, Yingwei Hu, Yuefan Wang, Zhenyu Sun, Hui Zhang2026-10-08
🧬 biology

Genomic characterization and antibiofilm activity of lytic Klebsiella pneumoniae phage FKP03, a member of an unclassified species within the subfamily Studiervirinae

تُوصّف هذه الدراسة العاثية (البكتيريوفاج) المحللة للخلية FKP03، وهي عضو غير مصنف من تحت فصيلة Studiervirinae تم عزلها من مياه الصرف الزراعي، حيث تُفصّل خصائصها المورفولوجية والجينية والفيزيولوجية مع إثبات فعاليتها ضد سلالات الكلبسيلة الرئوية (Klebsiella pneumoniae) وقدرتها على تثبيط وتقليل تكوين الغشاء الحيوي (البيوفيلم).

Weiye Tang, Luyao Wang, Jiaqi Tian, Zhuo Wang, Qing Xu, Daojia Caiwen, Qiucuo Baima, Kailun Zhang, Rongfei Yan, Guoyuan (…)2026-10-08
🧬 biology

Two actinobacterial G protein systems control multicellular mycelial growth and morphology in Streptomyces venezuelae

تُظهر هذه الدراسة أن نظامين محددين من بروتين G في الأكتينوبكتيريا (يُشفران بواسطة أوبيرونات *cvn1-cvn2*) في بكتيريا *Streptomyces venezuelae* ضروريان لتنظيم شكل الخلية، والتجنب الذاتي للخيوط الفطرية، والتنظيم الميسيلي (الغزل الفطري) متعدد الخلايا، لا سيما استجابةً لمحدودية العناصر الغذائية.

Klas Flärdh, Rikard Osgyan, Veronica Ekdahl, Dima Massri2026-10-08
🧬 biology

Leveraging Imputation and Low-Coverage Target Capture Sequencing for Cost-Efficient Genotyping in Cattle

تُظهر هذه الدراسة أن الجمع بين تسلسل التقاط الهدف منخفض التغطية مع الإحلال باستخدام لوحة مرجعية مكونة من 500 فرد وترشيح العمق الأمثل يوفر بديلاً فعالاً من حيث التكلفة، ومرناً، وعالي الدقة لنمط التنميط الجيني لشرائح تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة التقليدية في تربية الماشية.

Yan Ren, Wai Y. Low, Rudi A. McEwin, Tong Chen, Wayne S. Pitchford, Mehar S. Khatkar2026-10-08
🧬 biology

Specific laminin binding to interleukins enhances diabetic wound healing

تكشف هذه الدراسة أن اللامينين والفبرونيكتين يرتبطان بالإنترلوكين عبر مواقع متميزة وغير معتمدة على الهيبارين لتنظيم الاستجابات المناعية، مما يثبت أن هيدروجيلًا وظيفيًا باللامينين يعزز التئام الجروح السكري عن طريق تقوية إشارات IL-10، مع تقديم طريقة مبتكرة للوسم الكيميائي مدعومة بالذكاء الاصطناعي للتغلب على تداخل الأجسام المضادة في رسم خرائط هذه التفاعلات.

Manuel Salmeron-Sanchez, Zonghan Gan, Xiaowei Lin, Juan Gonzalez-Valdivieso, Lipeng Mao, Matthew Walker, Xu Teng, Penelo (…)2026-10-08
🧬 biology

Integrated Multi-omics Links Eph–Ephrin Signaling with Caspase-3 Activation and Hepatic Inflammation in Hypobaric Hypoxia in a Preclinical Model

تُظهر هذه الدراسة أن نقص الأكسجة تحت الضغط المنخفض الحاد يؤدي إلى إصابة كبدية تعتمد على الوقت في الجرذان من خلال إعادة صياغة المسارات الأيضية واختلال التوازن التأكسدي، وتحدد إشارات Eph–ephrin كوسيط رئيسي يربط هذه الاضطرابات بتنشيط كاسباز-3 وموت الخلايا الالتهابي.

Sanju Yadav, Rupinder Kalra, Gaurav Tripathi, Neha Sharma, Sushmita Pandey, Vipul Sharma, Vasundhra Bindal, Yash Magar (…)2026-10-08
🧬 biology

Foldseek-Interface reveals a protein interface universe far from complete

يقدم المؤلفون Foldseek-Interface، وهو طريقة عالية الكفاءة لتجميع واجهات التفاعل البروتيني على نطاق التفاعل الكامل (interactome)، والتي تكشف عن تنوع هائل لم يكن معروفاً سابقاً في أنماط الارتباط وتوفر مورداً متاحاً بحرية لاستكشاف تطور الواجهات والمحاكاة الممرضة.

Katja Luck, Joelle Strom, Sooyoung Cha, Rachel Kim, Harshit Sajal, Cameron Gilchrist, Martin Steinegger2026-10-08
🧬 biology

Rank-based integration identifies convergent disease mechanisms across omics

تقدم هذه الورقة أداة ORBIT، وهي أداة تكامل قائمة على الرتب ومعتمدة على الاتجاه، تحدد بفعالية الآليات المرضية القوية والمتوافقة عبر طبقات الأوميكس غير المتجانسة من خلال التغلب على اختلافات المنصات والمجموعات، كما تم إثبات ذلك من خلال تطبيقها على مجموعات بيانات مرض الكلى المزمن واعتلال عضلة القلب التوسعي.

Yang Luo, Zifeng Qiu, Duncan Palmer, Luke Jostins-Dean, Andrew Lewis, Katherine Bull, Jagdeep Nanchahal2026-10-08
🧬 biology

Alleviation of Oxidative Stress Upregulates Protective Autophagy to Mediate PTX3-Induced Anoikis Resistance and Metastasis in HNSCC

تُظهر هذه الدراسة أنه في سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والعنق، يعمل الالتهام الذاتي الواقي الناجم عن الإجهاد التأكسدي على رفع تنظيم بروتين PTX3 المفسفر عبر مسار EGFR-ATG5/12 لتعزيز تعبير السرفين، مما يؤدي إلى دفع مقاومة الموت الخلوي الناتج عن الانفصال (anoikis) والانتشار الورمي.

Ben-Kuen Chen, Ting-Wei Chang, Wan-Chen Huang, Shih-Hung Chan, Jhih-Peng Tsai, Jing-Ting Chiou, Hsiao-Yu Chang, Ying-Zhu (…)2026-10-08
🧬 biology

One Breed, Different Gene Pools? Country-Associated Genomic Structure Across Pedigree Cat Breeds

تُظهر هذه الدراسة أن التمايز الجيني المرتبط بالبلد يتباين بشكل كبير بين ست سلالات من القطط ذات الأنساب، حيث أظهرت قطط "ديفون ريكس" أعلى درجات التباين وقطط "مين كون" أدناها، مما يشير إلى أن المجموعات الجغرافية الفرعية للسلالة نفسها يمكن أن تشهد تأثيرات مؤسسين وأنماط تدفق جيني متميزة.

Baptiste Dumoulin2026-10-08