🧬 Category

q-bio

5531 ورقة بحثية

🧬 الأحياء

Graph-Regularised Multi-Omics Autoencoders Improve Stability and Clinical Coherence of Breast Cancer Patient Embeddings

تُظهر هذه الدراسة أن دمج حدّ نعومة لابلاس (Laplacian smoothness) القائم على شبكة التفاعل بين البروتينات في نموذج التشفير التلقائي لإزالة الضجيج المنظم بالرسم البياني (graph-regularised denoising autoencoder) يعزز بشكل كبير من الاستقرار، والتماسك الهندسي، والأهمية السريرية لتمثيلات بيانات الأوميكس المتعددة غير المُشرفة لمرضى سرطان الثدي مقارنة بالنماذج غير المهيكلة القياسية.

Habiba El Keraby, Hamza Zidoum, Maha Bouslimani2026-08-06
🧬 الأحياء

In Silico Analysis of Pathogenic Missense Single Nucleotide Polymorphisms in the Bovine IGF-1 Gene

استخدمت هذه الدراسة تحليلات حاسوبية (in silico) لتحديد تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة من نوع الخطأ في النسخ L105R باعتباره الطفرة الأكثر ضررًا في جين IGF-1 البقري، مما يثبت تأثيره المزعزع على استقرار البروتين وبنيته وارتباط المستقبل، وبالتالي يقترح كعلامة جزيئية قيمة لبرامج تربية الأبقار لإنتاج الحليب.

Ali Forouharmehr, Seyyed Mojtaba Mousavi, Narges Nazifi2026-08-06
🧬 الأحياء

Multivariate soil–microbial covariation and constrained recognition of fungal-dominated community-state extremes using Evidence- Constrained Residual Fusion

تُظهر هذه الدراسة أن الظروف الفيزيائية والكيميائية للتربة متعددة المتغيرات تتغير بالتزامن مع حالة مجتمع ميكروبي يهيمن عليه الفطريات في شمال الصين، وتُقيّم طريقة دمج البواقي المقيدة بالأدلة (ECRF)، التي تحقق دقة متوازنة عالية في تحديد الحالات القصوى للمجتمعات باستخدام مجموعات من المتنبئات المكانية والتربية، رغم أن أداءها المتزايد مقارنة بنموذج مرجعي شفاف يعد متواضعًا ويعتمد على تقسيم البيانات.

Pengyu Zhao, Geng Liu, Yujing Li, Xiaodong Zhao, Donghui Zhang2026-08-06
🧬 الأحياء

Two new species of Trichoderma from agricultural soils in China

تصف هذه الدراسة نوعين جديدين من فطر *Trichoderma*، وهما *T. yunguichuanense* و*T. paramoravicum*، تم عزلهما من التربة الزراعية الصينية، باستخدام تحليلات تطورية متعددة المواقع وتحليلات مورفولوجية لتأكيد تميزهما مع توضيح العلاقة النوعية بين *T. longibrachiatum* و*T. awajun* و*T. bissettii*.

Ke-Lin Li, Li-Juan Mao, Chu-Long Zhang2026-08-06
🧬 الأحياء

EpiNet: A multilayer integrative atlas of the human epigenetic regulatory network reveals principles of complex assembly, domain modularity, and lncRNA scaffolding

تقدم هذه الدراسة EpiNet، وهو أطلس تكاملي متعدد الطبقات للشبكة التنظيمية فوق الجينية البشرية يكشف عن التنظيم الهرمي والنمطي للشبكة ومبادئ التجميع غير العشوائية — مسلطاً الضوء على WDR5 كمركز محوري، وبصمات نطاق Pfam المتكررة، ودعامة الـ lncRNA — من خلال تحليل شبكي شامل لبيانات البروتين، والمعقدات، والنطاقات، والـ lncRNA المنسقة.

Amine BOUGARNE2026-08-06
🧬 الأحياء

Aav Capsid Glycoengineering: Effects of Glycan Type, Density and Conjugation Site on Vector Stability, Delivery and Gene Transduction

تُظهر هذه الدراسة أن الارتباط الكيميائي للسكريات الاصطناعية ببقايا محددة في غلاف الفيروس المرتبط بالأدينو من النوع 9 (AAV9) يمكن أن يعدل استقرار الناقل وكفاءة عملية الانتقال، مما يكشف أنه في حين أن كثافة السكريات العالية تعيق الأداء بشكل عام، فإن عملية المنسنة الاستراتيجية — لا سيّما عند الموقع M471 — تعزز توصيل الجينات بشكل كبير.

Sergio Milagros, Damian Pérez-Martínez, Samuel Salazar-Díaz, Pablo Ramirez-Ruiz de Erenchun, Marina Nicolao, Beatriz Car (…)2026-08-06
🧬 الأحياء

RFX4 maintains excitatory–inhibitory balance through WNT-dependent cortical patterning: implications for neurodevelopmental disorders

تُظهر هذه الدراسة أن عامل النسخ RFX4 ضروري للحفاظ على التوازن بين الاستثارة والتثبيط في العضويات القشرية البشرية من خلال تنظيمه المباشر لإشارات WNT، مما يوفر رابطاً ميكانيكياً بين خلل وظيفة RFX4 واضطرابات النمو العصبي.

Min Young Lee, So Jin Kim, Museog Choe, Won Hee Jung, Ye Seong Jeon, Ju Yeon Lee, Sehwan Park, Murim Choi, Hyo Geun Shin (…)2026-08-06
🧬 الأحياء

CCNIF: A Reproducible Causal-Network Framework for Prioritizing and Characterizing Candidate Cancer Driver Genes in Lung Adenocarcinoma

تقدم هذه الورقة البحثية CCNIF، وهو إطار حوسبي قابل لإعادة الإنتاج يمنح الأولوية لترتيب وتوصيف الجينات المرشحة كعوامل مسببة للسرطان في سرطان الرئة الغدي عبر دمج بيانات الطفرات والتعبير مع ملفات أدلة متعددة المجالات، حيث نجح في التحقق من العوامل المعروفة مثل TP53 وEGFR مع توفير لوحة مرقمة ومصنفة حسب درجة الثقة للمرشحين من أجل مزيد من الاستقصاء التجريبي.

Mohd Sameer, Pankaj Chauhan2026-08-06
🧬 الأحياء

Hepatic injury signals drive proteomic reprogramming of the mesenchymal stem cells secretome to counteract liver damage

تُظهر هذه الدراسة أن تحفيز الخلايا الجذعية الميزنكيمية البشرية لحديثي الولادة بإشارات من خلايا كبدية متضررة بفعل الباراسيتامول يعيد برمجة إفرازاتها لتعزيز حيوية الخلايا الكبدية، وتقليل الإجهاد التأكسدي، واستعادة الوظيفة الأيضية، مما يدعم تطوير علاجات مستهدفة قائمة على الإفرازات لعلاج الفشل الكبدي الحاد.

Ana S. Serras, Sérgio P. Camões, Joana S. Rodrigues, Joel M. Vej-Nielsen, Rui Vitorino, Joana P. Miranda2026-08-06
🧬 الأحياء

Reliance on atmospheric nitrogen increases along a soil salinity gradient and coordinates with ion-regulation and water-use traits in a halophytic desert legume (Halimodendron halodendron)

في حوض تاريم شديد القحولة، تحافظ النبتة البقولية الملحية *Halimodendron halodendron* على مستويات النيتروجين في أوراقها عبر زيادة اعتمادها على تثبيت النيتروجين الجوي مع ارتفاع ملوحة التربة، إلا أن هذه الاستراتيجية التكيفية لا يمكنها منع تراجع النمو لأن التكاليف الفسيولوجية لتنظيم الأيونات والحفاظ على المياه تقيد الكتلة الحيوية في نهاية المطاف.

Chang Kun Ma, Qiuping Fu, Quanjiu Wang, Yan Xu, Xiaoxu Jia2026-08-06