🧬 الأحياء

AminoGrapes: Structure-Weighted Evolutionary Scoring for Viral Protein Fitness Prediction

تقيم هذه الورقة البحثية AminoGrapes، وهو أسلوب تقييم تطوري يعتمد على الوزن الهيكلي وخالٍ من المعلمات للتنبؤ بلياقة البروتين الفيروسي، وتجد أنه رغم تفوقه الملحوظ على نموذج اللغة ESM2-650M في الاختبارات الفيروسية، إلا أنه فشل في مضاهاة أفضل الطرق الحالية أو تحسين أداء النماذج التجميعية، ويرجع ذلك على الأرجه إلى خيارات التصميم المتأثرة بالمعرفة المسبقة بنتائج المعايير المرجعية.

MUHAMMAD Saad2026-10-05
🧬 الأحياء

Deep Ensemble Learning with Graph Attention Mechanisms for Molecular Classification of HIV Inhibitors

تُظهر هذه الدراسة أن نهجاً هجيناً يجمع بين التعلم الآلي القائم على بصمات الأصابع، وشبكات الانتباه الرسومية (Graph Attention Networks)، ونماذج التجميع المتراكمة (stacking ensembles)، يعالج بفعالية عدم توازن الفئات لتحسين تصنيف مثبطات فيروس نقص المناعة البشرية، مما يسلط الض\\الضوء على القيمة التكاملية للتمثيلات الجزيئية المتنوعة من أجل اكتشاف أدوية قابل للتفسير.

Abdul Ahad, Md Mahabube Alahi Atik, Mirza Farhan Shahriar, Md Rahik Redwan, Kazi Tanvir Akter2026-10-05
🧬 الأحياء

TransPrimer: A Web-Based Tool for Automated Transcript-Specific RT-PCR/qPCR Primer Design Across Multiple Species

تُعد TransPrimer أداة قائمة على الويب تعمل على أتمتة تصميم بادئات (primers) تفاعل البوليميراز المتسلسل بالنسخ العكسي (RT-PCR/qPCR) الخاصة بالنسخ أو الشاملة للنسخ عبر أنواع متعددة، وذلك من خلال تحليل بنى النسخ لتحديد الإكسونات أو الوصلات المميزة وتطبيق تقييمات ديناميكية حرارية متقدمة لضمان النوعية.

Junyeop Ahn, Yun H Lee, Donald J Zack, Ping-Wu Zhang2026-10-05
🧬 الأحياء

Understanding single nucleotide polymorphism (SNP) in pyruvate dehydrogenase E1 and E2 component in different bacterial species

استخدمت هذه الدراسة برنامج MATLAB مخصصاً لتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) في مكوني البيروفات ديهيدروجيناز E1 وE2 في بكتيريا كليبسيلا بنيوموني، وسالمونيلا إنتيريكا، وفيبريو كوليرا بالنسبة لبكتيريا الإشريكية القولونية، مما كشف عن أنماط توزيع متميزة لتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة تشير إلى أن هذه الإنزيمات الأيضية تخضع لتكيف تطوري سريع مع الظروف البيئية والغذائية الحديثة.

Wenfa Ng2026-10-04
🧬 الأحياء

Cross-Sectional Associations of Screen Media Use Patterns with Executive Functioning and Emotional Self-Regulation Among U.S. Preschool-Aged Children

تكشف هذه الدراسة المستعرضة للأطفال في سن ما قبل المدرسة في الولايات المتحدة أنه بينما يرتبط إجمالي وقت الشاشة بصعوبات الوظائف التنفيذية، فإن نوع الوسائط المحدد يهم، حيث يرتبط مشاهدة الفيديو بتحديات الوظائف التنفيذية بينما يرتبط استخدام الأجهزة المحمولة بصعوبات التنظيم الذاتي العاطفي.

Soyang Kwon, Bridget Armstrong, Sarah B Welch, Courtney A. Zulauf-McCurdy2026-10-04
🧬 الأحياء

Spatial epithelial and stromal remodeling in isolated human pancreatic intraepithelial neoplasia before invasion

من خلال دمج النسخ المكاني، والتحقق النسيجي، والعضويات المشتقة من المرضى، تكشف هذه الدراسة أن خلل التنسج داخل الظهارة البنكرياسية عالي الدرجة يشكل نظامًا بيئيًا نشطًا بيولوجيًا قبل غزو الخلايا، يتميز بتوسع سدوي كبير حول القنوات، وإثراء في الخلايا العضلية الليفية، وإشارات متبادلة بين الظهارة والسدى تسبق الغزو.

Atsuhiro Masuda, Masahiro Tsujimae, Tetsuhisa Ko, Mika Miki, Kohei Okamoto, Kento Ogawa, Tatsuya Kageyama, Takafumi Toku (…)2026-10-04
🧬 الأحياء

USP13 stabilizes prohibitin 1 to support CD14 turnover and restrain TLR4-NLRP3 inflammatory signaling in sepsis

تحدد هذه الدراسة محور استقرار بروتيني يتكون من USP13-PHB1-CD14 في حالات إنتان الدم، حيث يعمل USP13 على تثبيت البروتين المانع 1 (prohibitin 1) لتعزيز دوران CD14، مما يؤدي إلى كبح إشارات الالتهاب المرتبطة بـ TLR4-NLRP3 وتقليل معدل الوفيات.

Jiahuan Lu, Huixing Dong, Yaru Pan, Wanli Yang, Hengxiang Cui, Feng Hu, Zhongqing Xu2026-10-04
🧬 الأحياء

A Novel ΔNp63α Variant in Fetus with Split Hand/Foot Malformation Disrupts Transcriptional Function and Promotes Apoptosis

تحدد هذه الدراسة متغيراً جديداً محتملاً للممرضية من نوع ΔNp63α (K94E) لدى جنين يعاني من تشوه انقسام اليد والقدم، وهو ما يعيق التنظيم النسخي لـ DLX5 ويعزز الموت الخلوي المبرمج، مما يوضح آلية جزيئية جديدة تكمن وراء هذا الاضطراب.

peisen liu, chunyu li, yingdi liu, yaning liu, jing liu, runyu lv, qimin zhou, qin xing, huimin zhu, juan wen, desheng l (…)2026-10-04
🧬 الأحياء

Interleukin-17 Inhibits Myelin-Related Protein Expression in Human Oligodendrocytes via NF-κB/STAT3 Signaling: Implications for Bipolar Disorder

تُظهر هذه الدراسة أن إنترلوكين-17 يثبط تعبير البروتين المرتبط بالميالين في الخلايا الدبقية قليلة التغصن البشرية عن طريق تنشيط مسار إشارات NF-κB/STAT3، مما يوفر رابطاً ميكانيكياً بين الالتهاب العصبي والخلل الوظيفي في الميالين في اضطراب ثنائي القطب.

Xiajin Ren2026-10-04
🧬 الأحياء

Longitudinal salivary microbial signatures of exacerbations in COPD

تُظهر هذه الدراسة الطولية أن تفاقمات مرض الانسداد الرئوي المزمن ترتبط باضطرابات متميزة ومتكررة في الميكروبيوتا اللعابية، تتميز بانتشار عابر للميكروبات الممرضة وانخفاض التنوع، مما يشير إلى أن اللعاب يمكنه التقاط الديناميكيات الميكروبية لهذه الأحداث التنفسية الحادة بشكل فعال.

Sara Melo-Dias, Catarina R. Almeida, Alda Marques, Ana Sousa2026-10-04