🧬 biology

A Hepatic Compartmental Model of Herbicide Bioconcentration in Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)

تُطوّر هذه الدراسة نموذجاً كبدياً حيزياً لتفكيك معامل التركيز الحيوي لأربعة من مبيدات أعشاب قصب السكر في سمك البلطي النيلي إلى ثوابت معدل فسيولوجية قابلة للتفسير، مما يكشف أنه بينما يتوافق تقسيم الكبد إلى العضلات بشكل عام مع البيانات المستقلة، فإن اعتماد النموذج على أخذ عينات محدودة ومعدلات تحول حيوي محددة يسلط الضوء على الحاجة إلى تحسين القيود لتقييم المخاطر الغذائية وأنماط التخلص المعتمدة على الخليط بدقة.

LOURIVAL COSTA PARAÍBA, Claudio Martin Jonsson2026-08-14
🧬 biology

Entropy of Age Distribution as a Causal Driver of System Dysfunction: A Bristlebot Swarm Model of Mosaic Aging

تقترح هذه الورقة نموذجًا لسرب من الروبوتات ذات الشعيرات (bristlebot) لاختبار الفرضية القائلة بأن التباين في العمر (المُقاس كإنتروبيا عمر المكونات) يعمل كمحرك سببي لخلل النظام، مع رسم أوجه تشابه بين تدهور النظام الجماعي للروبوت والشيخوخة الفسيفسائية البيولوجية لتأسيس إطار فيزيائي لفهم كيفية تعطيل التباعد الزمني المنظم للأنظمة المعقدة.

Jaba Tqemaladze2026-08-14
🧬 biology

Long Non-Coding RNA XIST and TSIX Modulate TGF-β-Mediated Cellular Transdifferentiation and Fibrosis in Systemic Sclerosis

تُظهر هذه الدراسة أن الحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر XIST وTSIX يرتفع مستواهما في تصلب الجلد الجهازي، حيث يعملان كمنظمين علويين للتليف بوساطة عامل النمو التحويلي بيتا (TGF-β)، مما يشير إلى إمكانية استخدامهما كعلامات حيوية للمرض وأهداف علاجية.

Dipanjan Bhattacharjee, Sanchaita Misra, Sudipta Chatterjee, Pradyot Sinhamahapatra, Madhurima Basak, Suchandrima Ghosh (…)2026-08-14
🧬 biology

Supervised Learning-Driven Prediction of Small-Molecule Modulator Bioactivity Against Protein-Protein Interactions

تقدم هذه الدراسة إطار عمل للتعلم الخاضع للإشراف يستخدم نماذج الغابة العشوائية مع واصفات RDKit للتنبؤ بفعالية النشاط الحيوي للمعدلات ذات الجزيئات الصغيرة ضد التفاعلات بين البروتينات، محققة أداءً قويًا في مجموعات البيانات الداخلية والعمياء مع تسليط الضوء على تحديات التعميم على المركبات الخارجية متنوعة البنية.

Tanmoy Jana, Joy Karmakar, Raja Banerjee, Sudipto Saha2026-08-14
🧬 biology

Oscillatory Modulation of Tumor Microenvironment pH Enhances Simulated Therapeutic Response in Breast Cancer

تقدم هذه الدراسة إطاراً حوسبياً هجيناً يجمع بين التعلم متعدد المثيلات ذي الانتباه المبوّب ونموذج الانتشار التفاعلي لإثبات أن التعديل التذبذبي للأس الهيدروجيني خارج الخلية يعزز بشكل كبير الاستجابة العلاجية المحاكات وتقليل العبء الورمي في سرطان الثدي مقارنة بالعلاج الكيميائي وحده.

Josias Mauricio Marques Minghin2026-08-14
🧬 biology

An End-to-End Reproducible RNA-Seq Workflow from Raw Sequencing Reads to Differential Expression, Pathway Enrichment, and Biological Interpretation

تقدم هذه الورقة سير عمل لبيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) متكاملًا، ونهاية إلى نهاية، وقابلًا للتكرار بالكامل، وذو وحدات نمطية، ومتحكمًا في إصداراته، يدمج أدوات من معالجة البيانات الخام وصولًا إلى إثراء المسارات، وتُبرز فائدته من خلال دراسة حالة لسرطان الثدي تكشف كيف تقود طفرات ESR1 والعلاج بمثبطات BET التغيرات النسخية المتبادلة في المسارات البيولوجية الرئيسية.

Fairuz Y. Nasir, Monira Obaid, SM Udden2026-08-14
🧬 biology

Brain as Language: Neuro-Semantic Modeling of Glioblastoma Radiogenomics

تقترح هذه الورقة إطار عمل عصبي-دلالي للراديوجينوميات يقوم بترجمة سمات التصوير بالرنين المغناطيسي متعدد المعلمات إلى تسلسلات رمزية (tokens) قابلة للتفسير ومرتبطة بالأدلة لنمذجة خصائص الورم الأرومي الدبقي، محققاً دقة تنبؤية عالية لحالة مثيلة محفز جين MGMT مع سد الفجوة بين بيانات التصوير الكمية والاستدلال البيوطبي القابل للتحقق.

Mariya Miteva, Mariya Nisheva-Pavlova2026-08-14
🧬 biology

Evidence for Reactivation of Embryonic Cytoskeletal Remodeling Programs, silenced decades earlier, in Amyotrophic Lateral Sclerosis

تُظهر هذه الدراسة أن التصلب الجانبي الضموري (ALS) يتميز بإعادة تنشيط منسقة لبرامج إعادة تشكيل الهيكل الخلوي الجنينية، وتحديداً من خلال زيادة تنظيم ديناميكيات الأكتين بوساطة Arp2/3، وانقباضية MYH10 المرتبطة بها، والمسارات الدبقية التنموية، مما يشير إلى أن هذه الآليات الصامتة هي مفاتيح ممرضة للمرض وأهداف علاجية محتملة.

Steven Lehrer2026-08-14
🧬 biology

Small molecules targeting HDAC6: indirect microtubule assembly modulators.

تحدد هذه الدراسة سبعة مثبطات جديدة وانتقائية لإنزيم HDAC6 البشري من خلال الفحص الحسابي والتحقق التجريبي، مما يكشف عن آليات ربط فريدة من نوعها لتنسيق الزنك وتثبت قدرتها على الاستهداف عبر الممالك لإنزيمات نزع الأسيتيل من التوبولين النباتي.

Mariia Stykhylias, Oksana Rybachuk, Alexey V Raevsky, Samofalova Dariya, Spivak Svetlana, Ozheredov Sergey, Platonov Mak (…)2026-08-14
🧬 biology

Integrated Pan-Cancer Multi-Omics Analysis Reveals TMEM45A Associated with DNA Hypomethylation, Immune Exclusion, and Drug Response

تكشف هذه الدراسة المتكاملة متعددة الأوميات لجميع أنواع السرطانات أن التعبير المفرط لـ TMEM45A يحدث بشكل متكرر نتيجة لنقص مثيلة الحمض النووي، ويرتبط بسوء الإنذار وبيئة ورمية مجهرية ذات مناعة مستبعدة، ويعمل كعلامة حيوية محتملة للتنبؤ بالحساسية تجاه فورينوستات والمقاومة تجاه دوسيتكسيل.

Md. Shakawat Hossain2026-08-14