🧬 biology

CHRFAM7A-assigned transcript detection is enriched in a LAMP3+CCR7+ dendritic-cell state in esophageal squamous cell carcinoma

تُظهر هذه الدراسة أن النسخ المنسوبة لـ CHRFAM7A مدعومة تقنياً ومثرية بشكل كبير في حالة محددة من الخلايا التغصنية LAMP3+CCR7+ ضمن سرطان الخلايا الحرشفية المريئي، مع توضيح أن هذه النتائج لا تؤكد تعبير CHRNA7 أو نشاط الإشارات المبهمية.

Zhao-wei Gao, Xue-li Gao, Shu-min Lun, Li-juan Duan, Xiao-xiao Wang, Fang Zhao, Sha-sha Cao, Yao-wen Zhang2026-08-12
🧬 biology

Molecular Characterization of Colistin Resistance Determinants in Clinical and Patient-Environmental Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii

تُوصّف هذه الدراسة مقاومة الكولستين في بكتيريا الراكدة البومانية (Acinetobacter baumannii) متعددة المقاومة للأدوية من خلال الكشف عن أن الطفرات الكروموسومية هي آلية المقاومة السائدة مقارنة بجينات mcr الوسيطة بالبلازميد، بينما تسلط الض light أيضاً على تعقيد المقاومة من خلال اكتشاف عزلات ذات محددات جينية غير معروفة.

Monisha B, Rashmi P Mahale, Morubagal Raghavendra Rao, Suchitra Shenoy M2026-08-12
🧬 biology

GraphTransformer-CoGNN: A two-stage dynamic graph learning framework for label-scarce cell-type annotation in spatial transcriptomics

تقترح الورقة البحثية GraphTransformer-CoGNN، وهو إطار عمل لتعلم الرسوم البيانية الديناميكية يتكون من مرحلتين يجمع بين Graph Transformer مع ترميز مسافة المقاومة وCooperative GNN لتحقيق أحدث ما توصل إليه العلم في تصنيف أنواع الخلايا في علم النسخ المكاني تحت ظروف ندرة الملصقات من خلال تحسين هياكل الرسوم البيانية بشكل تكيفي وكبح الاتصالات الزائفة.

Yuanyuan Dang, Xinyi Han, Bing Liu2026-08-12
🧬 biology

XG-PUL: A Network-Based Framework for Disease Gene Prioritization Using Graph Representation Learning and Positive-Unlabeled Learning

تقترح الورقة البحثية إطار عمل XG-PUL، وهو إطار تعلم آلي قوي يجمع بين تعلم تمثيل الرسوم البيانية القائم على Node2Vec ومصنف (positive-unlabeled) قائم على تقنية الـ bagging لتحديد أولويات الجينات المرتبطة بالأمراض بفعالية من خلال معالجة تحدي عدم اليقين في التسميات ضمن الشبكات البيولوجية.

Mahdiyeh Ayouman, Zahra Narimani2026-08-12
🧬 biology

Characterization of corneal epithelium and endothelium with scanning electron microscopy in three avian species

تستخدم هذه الدراسة المجهر الإلكتروني الماسح لتوصيف المورفولوجيا البنيوية الدقيقة، وكثافات الخلايا، والمعالم السطحية للخلايا الظهارية والبطانية القرنية في ثلاثة أنواع من الطيور (السنونو الأزرق والأبيض، والحمام الشائع، والسمنة حمراء البطن)، مما يوفر أول وصف من هذا النوع لرتبتي الحماميات والعصفوريات.

Clarissa Machado Carvalho, Rosélia LS Araújo, Paula Diniz Galera2026-08-12
🧬 biology

Multiple species of native mosquitoes may be involved in Usutu virus circulation and maintenance in temperate zones

تُظهر هذه الدراسة أن أنواعاً متعددة من البعوض الأصلي في إنجلترا المعتدلة، ولا سيما نوع *Culex pipiens* s.l.، تلعب دوراً هاماً في تداول فيروس أوسوتو واستمراريته، حيث يؤكد التحليل الفيلوجيني (التحليل العرقي) التعايش في الدورة بين سلالات فيروسية متميزة، مما يشير إلى أن الطقس الأكثر دفئاً قد يسهل عملية الانتقال.

Robert Calam Bruce, Anthony J. Abbott, Bathsheba L. Gardner, Amy C. Edwards, Harrison Hardy, Mirjam Schilling, Andra-Mar (…)2026-08-12
🧬 biology

Peripheral blood transcriptomic reanalysis prioritizes a neutrophil– matrix metalloproteinase axis and doxycycline in adult tuberculous meningitis

تعيد هذه الدراسة تحليل بيانات النسخ المتماثل للدم المحيطي لمرضى التهاب السحايا الدرني البالغين لتحديد محور "العدلات-ميتالوبروتيناز المصفوفي" كسمة مرضية رئيسية، مما يعطي الأولوية لعقار الدوكسيسيكلينين كعلاج واعد موجه للمضيف من أجل التحقق التجريبي.

Shuaijia Zeng, Xiaodong Zhang, Xing Cao, Quansheng Liu, Xue Chen, Aili Jia, Xing Chen, Jinhu Wen, Junhao Chu2026-08-12
🧬 biology

Comparative benchmarking of AI research agents for omics data interpretation

تقدم هذه الدراسة معياراً كمياً شاملاً لثلاثة وكلاء بحث ذكاء اصطناعي متخصصين (K-Dense وFinch وBiomni) مقابل ChatGPT في تفسير البيانات الأومية، كاشفةً عن عدم هيمنة أي وكيل منفرد على جميع الأنماط، وأن بنية الوكيل، وليس قدرة النموذج الأساسي، هي المحدد الرئيسي لجودة المخرجات ومدى ملاءمتها لمسارات العمل البيوانفورماتية المحددة.

Nikita V. Basov, Yosef K. Tirta, Zihan Li, Huan Zhou, Kiryl D. Piatkevich2026-08-12
🧬 biology

MSI-stratified analysis of TREM2 and HAVCR2 expression in mucinous colorectal adenocarcinoma: a structured analytical workflow with signature de-circularization

تُظهر هذه الدراسة أن الارتباط النسخي القوي على مستوى الكتلة بين TREM2 وHAVCR2 في سرطان القولون والمستقيم مدفوع بشكل أساسي بحالة عدم استقرار الساتل الدقيق المرتفع (MSI-H) وليس بالنسيج المخاطي، مما يسلط الضوء على ضرورة التحليلات المصنفة حسب MSI وإزالة تدوير التوقيعات لتجنب الارتباطات المضللة في أبحاث النسخ المناعي.

Qiwen Duan2026-08-12
🧬 biology

Whole-Genome Characterization of Carbapenem Resistance Determinants in Multidrug- Resistant Acinetobacter baumannii from Clinical and Patient-Environmental Isolates

تُوصّف هذه الدراسة السمات المظهرية والجينومية لـ 110 عزلات من بكتيريا الراكتة البومانية (*Acinetobacter baumannii*) متعددة المقاومة للأدوية، المستخلصة من مصادر سريرية وبيئية في مدينة ميسورو بالهند، حيث كشفت عن الوجود العالمي لجين الكاربابينيميز *blaOXA-23* إلى جانب التكرارات العالية لجيني *blaOXA-66* و *blaNDM-1*، مما يؤكد الحاجة الماسة لتعزيز المراقبة الجينومية وتدابير مكافحة العدوى للحد من انتشار مقاومة الكاربابينيم في مرافق الرعاية الصحية.

Monisha B, Rashmi P. Mahale, Morubagal Raghavendra Rao, Suchitra Shenoy M2026-08-12