🧬 biology

Concordance of Automated ACMG Variant Classification withExpert-Curated Assertions: A Systematic Evaluation Using theClinGen Evidence Repository

تُظهر هذه الدراسة أن VarTriage، وهو مصنف آلي مبسط يستخدم 10 معايير فقط من معايرة ClinGen ودرجات REVEL، يحقق توافقاً ثنائياً شبه مثالي (كابا = 0.98) مع تصنيفات ACMG التي تمت مراجعتها من قبل خبراء، رغم أن انخفاض حساسية الحالات الحميدة يسلط الضوء على الحاجة إلى دمج أنواع من الأدلة غير الحسابية لتحسين الدقة بشكل أكبر.

Muhammad Abiodun SULAIMAN, Bolaji Fatai Oyeyemi2026-08-07
🧬 biology

Gene-resolved CpG and UpA codon-boundary ordering in tick-derived Jingmen tick virus genomes

تحلل هذه الدراسة ٣٨ جينومًا لفيروس جينمين (Jingmen) المستخلص من القراد للكشف عن أن أنماط ترتيب حدود الكودونات الخاصة بـ CpG وUpA المحددة لكل جين، والتي شكلها تاريخ القطع ووظيفة البروتين، تنحرف عن التوقعات العشوائية وتقترح نموذجًا تطوريًا متعدد الطبقات يستوعب بيئات القراد والفقاريات على حد سواء.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-08-07
🧬 biology

Gene-resolved synonymous codon ordering reveals conserved CpG avoidance in cetacean morbillivirus

تكشف هذه الدراسة أن جينومات فيروس موربيلا الحيتانيات تظهر ترتيباً محفوظاً ومحدداً للكرودونات المترادفة، يعمل بنشاط على تقليل ثنائيات نيوكليوتيدات CpG عند حدود الكودونات، مما يشير إلى وجود قيد تطوري على مستوى الحمض النووي الريبوزي (RNA) مستقل عن تباعد تسلسل البروتين أو التكيف مع المضيف.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu, Fang-Hsu Lin2026-08-07
🧬 biology

DuoDose: homotypic-aware doublet detection by integrating identity and dosage evidence

تعد DuoDose أداة قائمة على لغة بايثون تعمل على تحسين الكشف عن الثنائيات المتجانسة في تسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية من خلال دمج أدلة الهوية والجرعة في نموذج غابة عشوائية مُعاير، مما يقلل من الإيجابيات الكاذبة الناتجة عن الخلايا الأحادية ذات الحمض النووي الريبي المرتفع مع التفوق على النماذج المرجعية الحالية.

Yongqi Huang2026-08-07
🧬 biology

Optimisation and application of an ex vivo organ bath model to study contractile function and insulin signalling in intact adult skeletal muscle

تُرسخ هذه الدراسة نموذج حوض عضلي خارج الجسم (ex vivo) مُحسَّنًا بشكل منهجي باستخدام عضلات النعل الساقية (soleus) السليمة لدى الجرذان لتقييم الوظيفة الانقباضية وإشارات الأنسولين في آن واحد وبشكل قابل للتكرار، كاشفةً أنه في حين أن الأنسولين الحاد لا يعزز إنتاج القوة، فإنه ينشط بقوة فسفرة بروتين "أكت" (Akt)، لا سيما عند دمجه مع التحفيز الكهربائي، كل ذلك مع مراعاة التباين الفسيولوجي المرتبط بالجنس.

Maheen Wahid, Graeme Mackenzie, Kirsty Tinto, Euan Hannah, Susan Currie, Gwyn W. Gould, Margaret R. Cunningham2026-08-07
🧬 biology

Microbiome-based tracking of diet shifts in ectotherms: a new approach to monitor effects of global changes on food webs?

تقدم هذه الورقة خريطة أدبية منهجية وتحليلاً تلوياً يثبت أن التحولات في ميكروبيوم أمعاء ذوات الدم البارد الناتية عن النظام الغذائي، ولا سيما إثراء البكتيريا المحللة للكيتين المرتبطة باستهلاك الحشرات، يمكن أن تعمل كمؤشرات على التغير البيئي ومنظمات فسيولوجية محتملة لمرونة المضيف.

Paula Cabral Eterovick, Katharina Ruthsatz, Selma Vieira, Johannes Sikorski, Katharina Wollenberg Valero, Jörg Overmann2026-08-07
🧬 biology

Multi-omics Identifies Hub Genes and Immune Networks in Stroke-CAD Comorbidity

من خلال دمج تحليل الأوميكس المتعدد، تحدد هذه الدراسة الجينات المحورية الرئيسية وشبكة تنظيمية مناعية-أيضية تشمل عوامل نسخ وجزيئات ميكرو RNA محددة والتي تميز الأساس الجزيئي المشترك للمراضة المشتركة بين السكتة الدماغية الإقفارية ومرض الشريان التاجي، مما يقدم مؤشرات حيوية وأهدافاً علاجية جديدة.

Yingna Tian, Qingbin Xu, Shuling Guo, Shuhao Mei, Huaqiang Wang, Weinan Zhao, Yan Zhao, Hanjing Wei, Wei Liu, Lulu Li, T (…)2026-08-07
🧬 biology

Machine Learning–Based QSAR Screening of Natural Product and ZINC Libraries Uncovers Stable BACE-1 Inhibitors Validated by Gaussian Accelerated Molecular Dynamics (GaMD) Simulations

طورت هذه الدراسة إطار عمل متكاملاً يجمع بين علاقة البنية بالنشاط الكمي (QSAR) والديناميكا الجزيئية لفحص مكتبات المنتجات الطبيعية ومكتبة ZINC، مما أدى إلى تحديد مثبطات مستقرة لإنزيم BACE-1 — لا سيما المركب NPC475168 — التي أظهرت ألفة ارتباط واستقراراً هيكلياً فائقين مقارنة بالمركبات المرجعية، مما يقدم مسارات واعدة لعلاج مرض الزهايمر.

Waqar Ahmad, Xinyi Zhu, Shahin Shah Khan, Yi Bai, Pengfei Pei2026-08-07
🧬 biology

Trans-equatorial migration and non-breeding distribution of Wilson’s Storm-Petrels Oceanites oceanicus from King George Island, Antarctica

تقدم هذه الدراسة أول تتبع لدورة سنوية كاملة لتكاثر طيور "جلم الماء ويلسون" في جزيرة كينغ جورج، مما يكشف أن العش المتبع بأكمله يقوم بهجرة عابرة لخط الاستواء في اتجاه عقارب الساعة حصرياً إلى شمال المحيط الأطلسي، مستخدماً بشكل أساسي خليج مين كمنطقة غير موسمية للتكاثر ومنطقة ريو دي لا بلاتا كموقع توقف، مما يشير إلى تعرض أكبر للتغيرات البيئية مما كان مفترضاً سابقاً.

Hwayeon Kang, Hankyu Kim, Hyun-Young Nam, Eun-jeong Kim, Jongbin Go, Min-su Jeong, Hae-min Seo, Chang-Yong Choi2026-08-07
🧬 biology

Genome-wide evidence for differential selection between urban and non-urban habitats in a bird of prey

تُظهر هذه الدراسة أنه على الرغم من التدفق الجيني العالي والتمايز المحدود على مستوى الجينوم، تُظهر صقور العوسق وجود تباعد تكيفي بين الموائل الحضرية وغير الحضرية من خلال الانتخاب على جينات محددة تتعلق بالاستجابة لمسببات الأمراض، والوظيفة العصبية، والتمثيل الغذائي.

Gianluca Damiani, Giulia Gentile, Paolo Franchini, Simone Messina, Giacomo Dell'Omo, David Costantini2026-08-07