⚗️ biochemistry

Beyond the surface: plasmalogens are dispensable for retinal integrity and fertility in the mouse

تُظهر هذه الدراسة أن دهون البلاسمانيل في الفئران كافية لمنع إعتام عدسة العين والحفاظ على الخصوبة، مما يشير إلى أن الفوسفوليبيدات البلازموجينية ليست ضرورية لسلامة الشبكية والوظيفة التناسلية رغم دورها الحاسم في نقص الإيثر ليديد الكلي.

Dorigatti, I., Juric, V., Blumer, M. J., Kummer, D., Kokot, J., Golderer, G., Dorninger, F., Berger, J., Keller, M. A. (…)2026-04-12
⚗️ biochemistry

Proteomics-Based Discovery of Symmetry-Specific Readers and Antireaders of 5-Formylcytosine in Mammalian DNA

تقدم هذه الدراسة أول تحليل على مستوى البروتين يكشف أن البروتينات الثديية، بما في ذلك عوامل النسخ وإنزيمات إصلاح الحمض النووي (DNA)، تُظهر أنماط تعرف متنوعة ومحددة تماثلياً لتعديلات 5-فورميل سيتوسين في ثنائيات CpG، مما ينظم اختيار الهدف والتنظيم الكروماتيني.

Cakil, Z. V., Engelhard, L., Seidel, N., Eppmann, S., Bange, T., Summerer, D.2026-04-12
⚗️ biochemistry

Structural Basis of Mitochondrial Transcription Regulation via Interactions of PolRMT and TFAM with Upstream Promoter DNA

توضح هذه الدراسة كيف يؤدي انحناء المحفز الناجم عن بروتين TFAM إلى إنشاء واجهة محفزة للنسخ بين PolRMT والحمض النووي العلوي، بينما يعمل لولب ربط PolRMT كعنصر مثبط ذاتياً لضمان نوعية المحفز، مما يحدد الآليات الهيكلية التي تحكم تنظيم النسخ الميتوكوندري.

Sharkey, R. E., Schroeder, C., Deng, X., Smith, J., Hernandez, A. J., Gao, Y.2026-04-12
⚗️ biochemistry

Mechanism of GPR84 allosteric modulation at a helix 8-proximate site

توضح هذه الدراسة الآلية الهيكلية للتعديل الخيفي المنحاز لبروتين Gi في مستقبل GPR84 من خلال تحديد موقع ارتباط جديد قريب من اللولب 8 للمعدل الخيفي الإيجابي PSB-16671، والذي يعمل على تثبيت هيئة محددة للمستقبل لتعزيز البلعمة في الخلايا البلعمية مع تجنب فقدان الحساسية.

Zhang, X., Guseinov, A.-A., Jenkins, L., Zhou, J., Gossen, F., Wang, P., Al Mahmud, Z., Li, Y., Mahardhika, A. B., Mulle (…)2026-04-12
⚗️ biochemistry

TCF25 emerges as a cytoplasmic regulator of GPRASP2 stability

تحدد هذه الدراسة بروتين TCF25 كبروتين مرتبط بالغشاء ويتواجد بشكل أساسي في السيتوبلازم، حيث ينظم استقرار GPRASP2، وهي علاقة يختل توازنها بسبب المتغيرة L415P، مما يؤسس دوراً جديداً لـ TCF25 في التوازن البروتيني الخلوي.

Hardy, L. J. E., Grzegorzek, L., Khoronenkova, S. V.2026-04-11
⚗️ biochemistry

Beyond thermal unfolding: urea-gradient nanoDSF approach for thermostability analysis of kinetically stable hyperthermophilic proteins

تُظهر هذه الدراسة أن نهج التدرج اليوريا في تقنية nanoDSF يتغلب على قيود الاستقرار الحركي للبروتينات شديدة الألفة للحرارة، مما يتيح التحديد الموثوق لدرجات حرارة انصهارها من خلال تحفيز انتقالات عدم الطي القابلة للكشف والتي تغيب في الظروف الطبيعية.

Rusinek, W., Dorawa, S.2026-04-11
⚗️ biochemistry

Machine Learning Models Reveal the Role of Ionization-Dependent Partitioning in Condensate Formation

تُظهر هذه الدراسة أن نماذج تعلم الآلة تحدد كره الدهون المعتمد على الرقم الهيدروجيني (logD) كعامل مهيمن يحكم توزيع الجزيئات الصغيرة في المكثفات البيولوجية الجزيئية، مما يثبت أن التوزيع المقترن بالتأين هو محرك ميكانيكي رئيسي لسلوك الفصل الطوري.

Ozmaian, M., Vaezzadeh, S. S.2026-04-10
⚗️ biochemistry

Comprehensive study on ferredoxin isoforms in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803

تُوصّف هذه الدراسة بشكل شامل اثني عشر نوعاً من نظائر الفيريدوكسين في بكتيريا *Synechocystis* sp. PCC 6803 من خلال التحليلات الطيفية، والكهروكيميائية، والتعبيرية، كاشفةً عن مجموعة متنوعة من البروتينات ذات جهود أكسدة واختزال وأنماط تنظيمية متفاوتة تعمل مجتمعة على الحفاظ على التوازن الاختزالي الخلوي عبر دعم كل من انتقال الإلكترونات الضوئي الأساسي والوظائف الأيضية المتخصصة.

Boehm, M., Svedruzic, D., Lubner, C. L., Appel, J., Mulder, D. W., Kisgeropoulos, E., Hueren, V., Spengler, K., Bharadwa (…)2026-04-10
⚗️ biochemistry

Isoprenoid quinone profiling in complex biological samples using a novel semi-quantitative HPLC-MS/MS method

تقدم هذه الدراسة طريقة جديدة وسريعة وحساسة لتقنية الكروماتوغرافيا السائلة عالية الأداء المرتبطة بمطياف الكتلة المتوالي (HPLC-MS/MS) شبه كمية، قادرة على كشف أوسع نطاق من الكينونات الإيزوبرينويدية حتى الآن، حيث نجحت في كشف التحولات النوعية في المجتمعات الميكروبية المرتبطة بكل مرحلة في عينات معالجة مياه الصرف الصحي.

Roger-Margueritat, M., Reveillard, A., Filimon, A. O., Boumendjel, A., Wendisch, V. F., Plazy, C., Cunin, V., Abby, S. S (…)2026-04-10
⚗️ biochemistry

Discovery of dihydroxy-enone-type protein-bound ceramides as the dominant type in human stratum corneum

تكشف هذه الدراسة أن السيراميدات المرتبطة بالبروتين من نوع "ثنائي هيدروكسي-إينون" (dihydroxy-enone)، وليس أنواع "إيبوكسي-إينون" (epoxy-enone) التي تمت دراستها سابقاً، هي الفئة السائدة في الطبقة القرنية البشرية، ومن المرجح أنها تتولد عبر عملية تحويل يتوسطها إنزيم إبوكسيد هيدرولاز EPHX3، مما يسلط الضوء على اختلاف بنيوي جوهري بين دهون الحاجز الجلدي لدى البشر والفئران.

Kojima, A., Sugiyama, T., Ohno, Y., Kihara, A.2026-04-10