⚗️ biochemistry

SpyTag-Enabled Assembly of Bacterial Microcompartment Trimers into Macroscopic Layered Protein Materials

تُظهر هذه الدراسة أن دمج ثلاثي وحدات المقصورات البكتيرية الدقيقة مع تقنية "SpyTag" يُمكّن من تجميعها ذاتياً بشكل تلقائي إلى مواد بروتينية طباقية عيانية قوية تحتفظ بالسلامة الهيكلية والنشاط الوظيفي في كل من الحالة السائلة والجافة، مما يوفر منصة متعددة الاستخدامات للواجهات الحيوية والهندسة البروتينية المستدامة.

Wang, Y., Zuo, X., Wang, Y., Ashby, P. D., Hausinger, R. P.2026-04-07
⚗️ biochemistry

Rapid protocol for mitochondria isolation from cardiomyocytes employing cell strainer-based procedure

تقدم هذه الدراسة بروتوكولاً سريعاً ولطيفاً لعزل ميتوكوندريا عالية النقاء وسليمة وظيفياً من خلايا عضلة القلب لدى القوارض باستخدام مصفاة الخلايا بدلاً من التجانس الميكانيكي التقليدي، مما يحافظ على السلامة الهيكلية ويسمح بتطبيقات متنوعة لاحقاً مثل تقنية تثبيت الرقعة الكهربائية (patch-clamp) وزرع الميتوكوندريا.

Lewandowska, J., Kalenik, B., Szewczyk, A., Wrzosek, A.2026-04-06
⚗️ biochemistry

A previously unappreciated class of metal-dependent bile salt hydrolases from the human gut microbiome

تكتشف هذه الدراسة وتُوصّف فئة جديدة من إنزيمات هيدرولاز أملاح الصفراء المعتمدة على المعادن (metalloBSHs) في بكتيريا الأمعاء البشرية *Bilophila wadsworthia*، والتي تستخدم آلية تحفيزية متميزة عن الإنزيمات المعروفة، مما يعيد تشكيل فهم استقلاب أحماض الصفراء في الميكروبيوم المعوي.

Cui, Z., Meng, C. J., Irwin, S. M., Augustijn, H. E., Papageorgiou, P. P., Nguyen, A. T. P., Yu, R., Aguilar Ramos, M. A (…)2026-04-06
⚗️ biochemistry

Structure, biosynthesis, and bioactivity of nostolysamides

توضح هذه الدراسة بنية وتخليق النشاط الحيوي لمركبات النوستوليساميد (nostolysamides)، وهي فئة جديدة من اللانثي ببتيدات المأسيلة المستخلصة من بكتيريا *Nostoc punctiforme*، كاشفةً عن طوبولوجيا حلقية فريدة، والدور غير الجوهري للمأسلة في أنشطتها المضادة للبكتيريا والفطريات والمسببة لتمزق الغشاء، والخصوصية الواسعة لركيزة إنزيم الـ "أسيل ترانسفيراز" NpuN.

Weir, E., Anterola, I., van der Donk, W. A.2026-04-05
⚗️ biochemistry

Red/near-infrared light activates the mitochondrial large-conductance calcium-activated potassium channel in glioblastoma cells.

تُظهر هذه الدراسة أن الضوء الأحمر والأشعة تحت الحمراء القريبة (620-820 نانومتر) ينشطان قنوات البوتاسيوم المعتمدة على الكالسيوم ذات التوصيل العالي في الميتوكوندريا داخل خلايا الورم الأرومي الدبقي، ويرجح أن يكون ذلك عبر سيتوكروم سي أكسيداز، مما يشير إلى نهج محتمل غير دوائي للحماية الخلوية.

Bednarczyk, P., Lewandowska, J., Kulawiak, B., Szewczyk, A.2026-04-05
⚗️ biochemistry

DNA methylation and hydroxymethylation quantification using vibrational spectroscopy

تُظهر هذه الدراسة أن مطيافية الأشعة تحت الحمراء بتحويل فورييه بنمط الانعكاس الكلي الموهن (ATR-FTIR)، مقترنة بنمذجة الانحدار، تتيح التقدير الكمي العالمي السريع، وغير المعتمد على الوسوم، وغير المدمر لتعديلات الـ 5-ميثيل سيتوزين والـ 5-هيدروكسي ميثيل سيتوزين في الحمض النووي (DNA)، بما في ذلك في عينات الحمض النووي الورمي الدائر.

Fatayer, R., Sammut, S.-J., Senthil Murugan, G.2026-04-05
⚗️ biochemistry

Structure and activity of a class II lanthipeptide from a thermophilic bacterium

تحدد هذه الدراسة وتُوصّف "ثيرمولانثين" (thermolanthin)، وهو فئة جديدة من اللانثي بيبتيد من النوع الثاني مستخلص من بكتيريا *Thermoactinomyces* sp. DSM 45891 المحبة للحرارة، والتي تتميز ببنى حلقات DL-(methyl)lanthionine فريدة تنحرف عن الانتقائية الفراغية المعتادة وتُظهر نشاطاً مضاداً للميكروبات ضد مسببات الأمراض من فئة ESKAPE سالبة الغرام.

Weir, E., Zhu, L., van der Donk, W.2026-04-04
⚗️ biochemistry

A cyanobacterial adenine prenyltransferase enables longer-chain N6 prenylation

تحدد هذه الدراسة إنزيم TvAPT، وهو إنزيم "أدنين برينيل ترانسفيراز" مستخلص من البكتيريا الزرقاء يتميز بجيب ارتباط متسع يتيح عملية "N6-prenylation" غير مسبوقة لركائز الأدنين باستخدام مانحات "برينيل" ممتدة من نوع C10 وC15، مما يؤدي إلى توسيع الحيز الكيميائي للهندسة الجزيئية الحيوية.

Ichikawa, K., Tamura, K., Fujitani, K., Chisuga, T., Takeda, R., Sato, T., Hayashi, S., Kato, K., Miura, S., Nakano, S. (…)2026-04-04
⚗️ biochemistry

Cryo-EM Structure of Human ATAD2B Reveals a Hexameric Organization Contributes to ATPase Activity and Substrate Coordination

تقدم هذه الدراسة أول بنية عالية الدقة لبروتين ATAD2B البشري باستخدام المجهر الإلكتروني برد التجميد (cryo-EM)، كاشفةً عن بنيته السداسيةية الوظيفية ونشاطه الكيميائي الحيوي لتقديم رؤى ميكانيكية حول دوره كإنزيم AAA+ ATPase مختل في الحالات المرضية.

Malone, K. L., Chua, E. Y. D., Lignos, J. M., Fagnant, P. M., Macfarlane, J. E., Trybus, K. M., Cianfrocco, M. A., Glass (…)2026-04-03
⚗️ biochemistry

The structure-interaction model of polymyxin lipopeptides with human oligopeptide transporter 2

توضح هذه الدراسة العلاقة بين البنية والتفاعل بين بولي ميكسين ليبوبيبتيد وناقل الببتيدات قليلة التعدد البشري hPepT2 من خلال نهج حوسبي وتجريبي متكامل، حيث حددت بقايا الارتباط الحرجة وأثبتت أن نظائر محددة ذات تفاعل منخفض مع hPepT2 تحتفظ بالفعالية المضادة للبكتيريا مع خفض السمية الكلوية بشكل كبير.

Jiang, X., Luo, Y., Azad, M. A. K., Xu, L., Xiao, M., Velkov, T., Roberts, K. D., Thamlikitkul, V., Zhou, Q. T., Zhou, F (…)2026-04-02