⚗️ biochemistry

Dynamic assembly of malate dehydrogenase-citrate synthase multienzyme complex in the mitochondria

تُظهر هذه الدراسة أن التجميع والتفكك الديناميكي للميتابولون (metabolon) المكون من MDH1-CIT1 في ميتوكوندريا الخميرة يتم تنظيمهما بواسطة النشاط التنفسي، ودرجة حموضة مصفوفة الميتوكوندريا، ومستويات نواتج أيضية محددة، مما يعمل كآلية رئيسية لتكيف دورة حمض الستريك مع المتطلبات الأيضية الخلوية.

Omini, J., Krassovskaya, I., Dele-Osibanjo, T., Pedersen, C., Obata, T.2026-04-01
⚗️ biochemistry

Two Glu/Asp Residues Cooperatively Mediate an Early Step of ATP Hydrolysis in GHKL ATPases MutL and GyrB

تكشف هذه الدراسة أن اثنين من البقايا الحمضية المحفوظة في إنزيمات GHKL ATPase يعملان بشكل تعاوني لتوسط التحلل المائي المبكر لـ ATP، حيث يقوم أحدهما بشكل أساسي بتحديد موضع الماء النيوكليوفيلي بينما يعمل الآخر كقاعدة عامة، وهي آلية يؤكد تعطيلها بواسطة المتغيرات المرتبطة بالأمراض في نظائر MutL البشرية على أهميتها الوظيفية وحفظها التطوري.

Fukui, K., Shibuya, A., Murakawa, T., Yano, T.2026-04-01
⚗️ biochemistry

Supercoiling twists Cas9 off-target discrimination when nicking and cleaving

تكشف هذه الدراسة أن الالتفاف الفائق السلبي للحمض النووي (DNA) يسرع بشكل كبير من عملية القطع غير المستهدف بواسطة بروتين Cas9 ويغير مواقع قطعه، مما يثبت أن طوبولوجيا الحمض النووي تؤثر بشكل حاسم على نوعية Cas9 وتستوجب مراعاة الاعتبارات الطوبولوجية لضمان سلامة التحرير الجيني.

Jaskovikaite, I., Offerhaus, H. S., Vinogradovas, M., Barkauskaite, U., Depken, M., Jones, S. K.2026-04-01
⚗️ biochemistry

Tumour marker analysis using a machine learning assisted vibrational spectroscopy approach

تقدم هذه الدراسة نهجاً يعتمد على مطيافية ATR-FTIR بمساعدة التعلم الآلي، مما يتيح التقدير الكمي السريع للمؤشرات الحيوية للأورام، ولا سيما CA125، في المصل البشري دون الحاجة إلى وسوم أو كواشف وبدقة عالية، مما يوفر بديلاً واعداً للمقايسات المناعية التقليدية في البيئات السريرية محدودة الموارد.

Fatayer, R., Sammut, S.-J., Senthil Murugan, G.2026-03-31
⚗️ biochemistry

In-source fragmentation in mass spectrometry-based proteomics: prevalence, impact, and strategies for mitigation

تكشف هذه الدراسة أن التجزئة داخل المصدر (ISF) تضخم بشكل كبير عمليات تحديد الببتيدات وتخاطر بتفسير البيانات بشكل خاطئ في علم البروتينات، لا سيما بالنسبة للببتيدات شبه التريبية والقصيرة، وتقترح نهجاً يعتمد على زمن الاحتفاظ الكروماتوغرافي للكشف عن هذه العيوب وتصفيتها لضمان دقة البيانات.

Schramm, T., Gillet, L., Reber, V., de Souza, N., Gstaiger, M., Picotti, P.2026-03-30
⚗️ biochemistry

Structure of SARS-CoV-2 spike in complex with its co-receptor the neuronal cell adhesion protein contactin 1

توضح هذه الدراسة الآلية الجزيئية لتوجه فيروس SARS-CoV-2 نحو الجهاز العصبي من خلال حل بنية البروتين الشوكي الفيروسي باستخدام المجهر الإلكتروني المبرد وتحديد التفاعل ذي الألفة النانومولية بين بروتين سبايك الفيروسي والمستقبل المشترك العصبي "كونتاكتين 1"، مما يكشف عن كيفية ارتباط الفيروس بالجهاز العصبي عبر واجهة فريدة تتداخل مع الحواتم الخاصة بالأجسام المضادة المعادلة.

Krepel, S. T., Hurdiss, D. L., Bosch, B. J., Snijder, J., Janssen, B. J. C.2026-03-29
⚗️ biochemistry

Bile-mediated ToxS homodimerization provides a model for ToxRS periplasmic interactions

تكشف هذه الدراسة أن ملح الصفراء غليكوكولات يحفز تضاعف التوكس إس (ToxS) المتماثل من خلال آلية تبادل الخيوط، مما يوفر نموذجاً هيكلياً لكيفية استشعار نظام توكس آر إس (ToxRS) لأملاح الصفراء لتنظيم الضراوة في مسببات الأمراض من نوع "فيبريو" (Vibrio).

Kim, M., Balasubramanian, D., Kull, F. J., Salvador Almagro-Moreno, S., Midgett, C. R.2026-03-28
⚗️ biochemistry

Hydrogen-bonding changes cause differences in imipenem breakdown activity in OXA-48 variants

تستخدم هذه الدراسة عمليات محاكاة متعددة المقاييس للكشف عن أن تغيرات الروابط الهيدروجينية داخل الموقع النشط، والمدفوعة بالطفرات في عروة β\beta5-β\beta6، تغير ديناميكيات وكفاءة نزع الأسيل من الإيميبين والارتباط به، مما يفسر الأنشطة التحللية المتميزة الملحوظة بين متغيرات OXA-48.

Wang, D., Mulholland, A. J., Spencer, J. J., van der Kamp, M. W.2026-03-28
⚗️ biochemistry

Catalytic Efficiency of Conserved Metabolic Enzymes Across Evolutionary Complexity

تكشف هذه الدراسة أن الكفاءة التحفيزية للإنزيمات الأيضية المحفوظة لا تتبع اتجاهاً عالمياً قائماً على التعقيد العضوي، بل تُظهر بدلاً من ذلك تباينات خاصة بالإنزيمات وبالمسارات، مدفوعة بضغوط انتخابية متميزة مرتبطة بالسياق تتعلق بالطلب الأيضي والاحتياجات التنظيمية.

Chauhan, V., Pan, L.2026-03-28
⚗️ biochemistry

Non-fibrillar prion protein oligomers transmit structural information during early assembly

تُظهر هذه الدراسة أن قليل مجمعات بروتين البريون غير الليفية والوسائط التجميعية العابرة يمكنها تخزين ونقل معلومات الطي الهيكلي من خلال آلية نمطية تتضمن سقالة غنية بصفائح بيتا، مما يوسع نموذج البريون بما يتجاوز النموذج الكلاسيكي القائم على القالب بوساطة نهايات الألياف.

Rezaei, H., Prigent, S., Deniset Besseau, A., Mathurin, J., Igel, A., Klute, H., Bohl, J., van der Rest, G., Lecomte, S. (…)2026-03-27