360 ورقة بحثية
أدت الطفرة G23S في إنزيم بيتا-جلوكوسيداز B من بكتيريا *Paenibacillus polymyxa*، والتي تم التنبؤ بها عبر نمذجة Foldit وقاعدة بيانات Design to Data، بنجاح إلى تعزيز الكفاءة التحفيزية والسرعة القصوى للتفاعل بمقدار ضعفين وأربعة عشر ضعفاً على التوالي، مع وجود تراجع طفيف فقط في الاستقرار الحراري.
تحدد هذه الدراسة إنزيمات نزع أسيتيل التاكسان الجديدة (T13dA1 وT13dA2 وT79dA) التي تعيد رسم مسار التخليق الحيوي للباكليتاكسيل كشبكة معقدة، مما يتيح إعادة تكوين ناجحة لإنتاج الباكيتين III عالي المردود في نبات *Nicotiana benthamiana* من خلال مسارات متكاملة مكونة من 18 و19 جيناً.
تكشف هذه الدراسة أن الفوسفاتاز PPM1B يستخدم مركزاً معدنياً ثلاثي النوى، حيث يقوم أيون معدني ثالث (M3) بالتنسيق مباشرة مع الركيزة وتثبيت المجموعة المغادرة لدفع عملية التحلل المائي، مما يمثل استراتيجية كيميائية تقاربية مع فوسفاتازات PPP توظف بنية تحفيزية متميزة.
تُظهر هذه الدراسة أن البروتينات المصغرة (C6-DPC) المصممة بواسطة الذكاء الاصطناي يمكنها التغلب على حواجز الإشارات لتمكين إعادة البرمجة العضلية البشرية الوظيفية والفعالة، وذلك من خلال التنشيط المتزامن لمسارات FGFR المحفزة لتكوين العضلات وتثبيط إشارات ALK1/TGFBR2 المضادة لتكوين العضلات وإشارات gp130 الالتهابية، مما يؤدي إلى توليد أنسجة عضلية عالية القوة من الخلايا الليفية.
طوّر باحثون نظاماً للثنائية المستحثة كيميائياً باستخدام ببتيد حلقي مصمم حديثاً، ونفاذ عبر الغشاء، ومتماثل ثنائي مع بروتين متوافق، مما يتيح تحكماً شرطياً دقيقاً في العمليات الخلوية مثل التعبير الجيني وإعادة تشكيل اللوسيفيريز.
تُوصّف هذه الورقة الخصائص الكيميائية الحيوية والبنية الثنائية لبروتين LpiA، وهو نظير لبروتين MprF من بكتيريا *Agrobacterium fabrum*، باستخدام المجهر الإلكتروني فائق التبريد (cryo-EM) للكشف عن السمات الهيكلية المحفوظة والأنماط المحتملة لارتباط الركيزة المشتركة مع الأنواع البكتيرية ذات الصلة.
تُظهر هذه الدراسة أن مدة سمية خلايا بيتا الناتجة عن بروتين (IAPP) يمكن التنبؤ بها كمياً من خلال طول مرحلة التأخر في التجمع، مما يشير إلى أن الوسائط ما قبل الليفية العابرة، وليس الألياف الناضجة، هي المحركات الأساسية للاختلال الوظيفي الخلوي في مرض السكري.
تُثبت هذه الدراسة أن الحمض الأميني غير التقليدي الفلوري 7-HCAA يعمل كمسبار حساس ومحدد الموقع لمراقبة التغيرات التشكلية في الوقت الفعلي أثناء تكوين البريون، مما يبرهن على قدرته على تتبع التحولات الهيكلية في المختبر مع الحفاظ على القدرة الإنتانية لبروتين PrPSc في الكائن الحي.
تقدم هذه الورقة dEVA، وهو إطار عمل لخوارزمية تطورية متعددة الأهداف يتيح التصميم من الصفر وبدون معرفة مسبقة (zero-shot) لإنزيمات معدنية وظيفية دون الاعتماد على قوالب طبيعية، حيث نجحت في إثبات القدرة على ابتكار إنزيم ثنائي الزنك بكفاءة تحفيزية تضاهي الفوسفاتاز الطبيعية.
تقدم هذه الورقة استراتيجية تصوير إلكتروني مبرد بالتوموجرافيا متعدد التكبير ومتداخل، تلتقط في آن واحد التنظيم الخلوي واسع النطاق والبنى الجزيئية عالية الدقة ضمن نفس سلسلة الإمالة، مما يجسّر الفجوة بفعالية بين البيولوجيا الخلوية والبيولوجيا البنيوية.