⚗️ biochemistry

Impact of viral membrane oxidation on SARS-CoV-2 spike protein transmembrane anchoring stability

تستخدم هذه الدراسة محاكاة الديناميكا الجزيئية لتوضيح أنه في حين أن الأكسدة الجزئية لليبيدات غشاء فيروس سارس-كوف-2 لها تأثير ضئيل على تثبيت بروتين سبايك، فإن الأكسدة الشاملة تضعف هذا الاستقرار بشكل كبير من خلال تعطيل الترتيب الليبيدي وتجمعات الكوليسترول، مما يشير إلى أن بيروكسيد الدهون يعمل بشكل تآزري مع القوى الميكانيكية لتسهيل تعطيل الفيروس.

Ghasemitarei, M., Gyursanszky, C., Karttunen, M., Ala-Nissila, T.2026-03-27
⚗️ biochemistry

Uncovering Functional Distant Mutations by Ultra-High-Throughput Screening of Dehalogenases

من خلال توظيف تقنية فرز القطيرات المنشطة بالفلورة ذات الإنتاجية الفائقة العالية باستخدام ركيزة فلورية ضخمة، نجح الباحثون في تحديد طفرات بعيدة في إنزيم LinB تعمل على تعزيز الكفاءة التحفيزية وتغيير النوعية عبر تعديل الديناميكيات التشكيلية والوصول إلى الركيزة، مما يبرهن على نهج قوي للكشف عن التكيفات الوظيفية التي يصعب التنبؤ بها من خلال التصميم العقلاني.

Faldynova, H., Kovar, D., Jain, A., Slanska, M., Martinek, M., Jakob, A., Sulova, M., Vasina, M., Planas-Iglesias, J., M (…)2026-03-26
⚗️ biochemistry

Chiral methionine oxidation reagents reveal stereospecific proteome modifications

تقدم هذه الدراسة كواشف الأوكسيزاريدين المتماثلة مرآتياً لرسم خرائط لمواقع أكسدة الميثيونين النوعية فراغياً عبر البروتيناتوم، مما يوضح أن التنظيم الكيرالي لهذه التعديلات يمكن أن يثبط وظيفة البروتين خيفياً ويعزز استجابات إجهاد تأكسدي محددة.

Gonzalez-Valero, A., Page, A. C. S., Bertoch, J. M., Alsarhan, F., Kim, J., Alazali, A. A., Srinivas, R. R., Xie, X., Re (…)2026-03-26
⚗️ biochemistry

Integrative Structural Modeling of Intrinsically Disordered Regions in a Human HDAC2 Chromatin Remodeling Complex

تتغلب هذه الدراسة على القيود التي تفرضها الأدوات الحسابية القياسية مثل AlphaFold في نمذجة المناطق غير المنظمة ذاتياً من خلال توظيف نهج تكاملي يجمع بين الربط المتقاطع التجريبي وتقنيات نمذجة متعددة لتوضيح التجميع الهيكلي لمعقد إعادة تشكيل الكروماتين البشري HDAC2:MIER1:MHAP1.

Nde, J., Kempf, C., Zimmermann, R., Cesare, J., Zhang, Y., Workman, J., Florens, L., Washburn, M.2026-03-25
⚗️ biochemistry

Multi-Objective Engineering of Fibrin-Selective Thrombolytic Proteases with Enhanced Biocatalytic Efficiency and Inhibition Resistance

تقدم هذه الدراسة إطاراً هندسياً متعدد الأهداف نجح في تصميم برونوتيبلاز (Brnoteplase)، وهو إنزيم بروتياز مذيب للخثرات من الجيل التالي يتميز بانتقائية معززة للفيبرين، ومقاومة للتثبيط، وكفاءة تحفيزية، مما أظهر فعالية علاجية وسلامة فائقتين داخل الجسم الحي مقارنة بالمتغيرات الحالية المعتمدة من قبل إدارة الغذاء والدواء الأمريكية.

Toul, M., Slonkova, V., Mican, J., Thalerova, S., Peskova, M., Kittova, P., Scheer, P., Hlozkova, J., Brhelova, E., Aksu (…)2026-03-25
⚗️ biochemistry

Structural dynamics between Argonaute-2 and CK1α promote target RNA release in microRNA-mediated silencing

تكشف هذه الدراسة أن الاقتران التدريجي للقواعد بين الـ miRNA والـ RNA المستهدف يحفز تغيرات تشكيلية في بروتين Ago2 البشري، وتحديداً عبر تحريك نطاق PAZ لإنشاء واجهة ارتباط لبروتين CK1α، الذي يقوم بفسفرة منطقة EI لفك التفاف معقد الدليل-الهدف وتسهيل عملية دوران معقد RISC بكفاءة.

Garg, A., Braviner, L., Axhemi, A., Bibel, B., Joshua-Tor, L.2026-03-25
⚗️ biochemistry

c-di-AMP inactivates a K+/H+ antiporter in Bacillus subtilis

تكشف هذه الدراسة أن الرسول الثاني c-di-AMP يعمل على تعطيل مضخة التبادل الأيوني (K+/H+) المسماة CpaA بشكل مباشر في بكتيريا *Bacillus subtilis* من خلال الارتباط بنطاق RCK الخاص بها، مما يتحدى الافتراضات السابقة حول بساطة تنظيم c-di-AMP للتوازن البوتاسي في البكتيريا.

Figueiredo-Costa, I. R., Lorga-Gomes, M. M., Sousa-Moreira, S. C., Matas, I. M., Morais-Cabral, J. H.2026-03-25
⚗️ biochemistry

A human cell-free translation screen identifies the NT-2 mycotoxin as a ribosomal inhibitor that binds the peptidyl transferase center

تؤسس هذه الدراسة منصة فحص عالية الإنتاجية خالية من الخلايا البشرية لتحديد سم "إن تي-2" (NT-2) الفطري كمعطل ريبوسومي جديد يرتبط بمركز نقل الببتيديد ويحفز حالة خمول في تخليق البروتين في الثدييات.

Schwaller, N., Andenmatten, D., Luginbuehl, J., Rabl, J., Baur, H., Chambon, M., Vesin, J., Turcatti, G., Karousis, E. D (…)2026-03-24
⚗️ biochemistry

Tracing Siderophore Precursors to Primary Metabolism for Ecological Applications

تضع هذه الدراسة إطاراً منهجياً يربط بين التخليق الحيوي للسيدروفور والتمثيل الغذائي الأولي، مما يثبت أن المكملات المستهدفة لسلائف محددة تعزز قدرات التهام الحديد والنشاط المثبط لمسببات الأمراض للبكتيريا النافعة *Bacillus amyloliquefaciens* ضد *Ralstonia solanacearum*.

He, R., Xu, J., Shao, J., Wu, Y., Tian, S., Yang, Z., Li, X., Chen, H., Qian, L., Wei, Z., Gu, S., Li, Z.2026-03-23
⚗️ biochemistry

Cryo-EM structures and structure-guided design of Atlas virus capsids

تحدد هذه الدراسة عائلة فيروس أطلس (Atlas virus) في النيماتودا، وتُوصّف خصائصها الهيكلية والوظيفية الفريدة عبر المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM)، وتُثبت إمكاناتها كمركبات هندسية قابلة للتوسع لتوصيل الحمض النووي الريبوزي (RNA) إلى أنسجة محددة.

Zhai, H., Liu, Y., Beechey-Newman, O., Modis, Y.2026-03-23