⚗️ biochemistry

Dimerization and Threonine-Dependent Stabilization Govern Human YRDC Catalysis

توضح هذه الدراسة أن إنزيم YRDC البشري يعمل كمتماثل ثنائي حيث يعمل الـ L-ثريونين كربيطة حارسة لتثبيت الإنزيم وتعزيز ارتباط الـ ATP، مما يكشف أن الطفرات المسببة للأمراض تعطل هذا التماثل الثنائي والاستقرار التشكلي لتعيق النشاط التحفيزي.

Trinh, N. A. T., Zickuhr, G., Dickson, A. L., Sinowski, S., Hamill, C., Sundaramoorthy, R., Lebl, T., Shirran, S. L., Ha (…)2026-07-31
⚗️ biochemistry

MDA5 multimerization on LINE RNA drives pathogenic extracellular immune complexes in autoimmunity

تكشف هذه الدراسة أنه في حالات التهاب العضلات والجلد المرتبط بـ MDA5، ترتبط الأجسام المضادة ذاتية الاستجابة بخيوط MDA5 التي تشكلها سقالات RNA من نوع LINE لتكوين معقدات مناعية خارج خلوية ممرضة تقود دورة التهابية ذاتية التضخيم من خلال التجمع عالي الرتبة والتنشيط المناعي الفطري القوي.

Hsu, T. Y.-T., Wang, X., Zhang, J., Isayama, Y., Schindler, V., van Gompel, E., Maadadi, H., Torres-Arancivia, C., Shima (…)2026-07-31
⚗️ biochemistry

Distal conformational steering by N-terminal pyroglutamylation enables subtype-selective GPCR activation across Aplysia PRXamide and human Neuromedin U signaling

تكشف هذه الدراسة أن عملية "البرو جلوتاميليشن" (pyroglutamylation) عند الطرف النيتروجيني (N-terminal) تُمكِّن من تنشيط مستقبلات البروتين G (GPCR) بشكل انتقائي للأنواع الفرعية من خلال آلية "التوجيه البعيد" (distal steering)، حيث يعيد هذا التعديل الصلب تشكيل المجموعة التشكلية للرابط (ligand's conformational ensemble) ليتفاعل بشكل تفاضلي مع جيوب المستقبل دون اتصال مباشر، وهو مبدأ تم إثباته عبر كل من أنظمة إشارات "أبليسيا بروكسميد" (Aplysia PRXamide) و"نيوميدين يو" (Neuromedin U) البشرية.

Chang, J.-H., Liu, W.-J., Wu, S.-Q., Romanova, E., Liu, C., Liu, C., Pan, X., Li, F., Ding, X., Mao, R., Wang, H., Xu, J (…)2026-07-30
⚗️ biochemistry

Identifying endogenous substrates of the 26S proteasome through site-specific photocrosslinking

تستخدم هذه الدراسة توسيع الشفرة الوراثية لإدخال حمض أميني غير طبيعي قابل للارتباط الضوئي المتقاطع في بروتيازوم الخميرة 26S، مما يتيح الالتقاط في الجسم الحي والتعرف بكتلة الطيف في رصد ركائز البروتين المتنوعة المعتمدة على ATP، والكشف عن كيفية تحول مشهدها تحت إجهاد الشبكة الإندوبلازمية.

Yori Restrepo, S., Martin, A.2026-07-29
⚗️ biochemistry

Novel Binding Partners of the Vacuolar Transporter Chaperone (VTC) complex in Acidocalcisomes of Leishmania tarentolae

باستخدام تقنية البيوتينلة المعتمدة على القرب (BioID) في طفيلي الليشمانيا تارينتولا (*Leishmania tarentolae*)، تحدد هذه الدراسة ثلاثة شركاء ارتباط جديدين لمركب VTC تتوضع في نفس الموقع وتتفاعل مع مركب VTC في الأكياس الحمضية (acidocalcisomes)، مما يوسع التفاعل البروتيني لهذا العضي ويقترح آليات جديدة للتوازن الفوسفاتي والتنظيم الهيكلي في الطفيليات من الكينيتوبلاستيدات.

Krolak, P., Ribeiro, O., Gehl-Vaisanen, B., Hiltunen, M., Goldman, A., Vidilaseris, K.2026-05-28
⚗️ biochemistry

Direct Injection NanoHILIC/MS/MS Proteomics from Reversed-Phase StageTip Eluate

تقدم الورقة البحثية DiReCT، وهو سير عمل يعتمد على تقنية StageTip، والذي يعالج عدم توافق المذيب بين نواتج الطور المعكوس وnanoHILIC/MS/MS من خلال تمكين الحقن المباشر للببتيدات المذابة، مما يزيد بشكل كبير من حساسية تحديد البروتينات والببتيدات للعينات ذات المدخلات المنخفضة.

Akamatsu, K., Kanao, E., Ishihama, Y.2026-05-28
⚗️ biochemistry

Near-Zero Missed Cleavages with a High-Fidelity Recombinant Arg-C Zero for Mass Spectrometry-Based Proteomics

تقدم هذه الورقة Arg-C Zero، وهو إنزيم أرجينيل إندوبيبتيداز معاد التركيب عالي الدقة مشتق من بكتيريا *Porphyromonas gingivalis*، والذي يحقق انعداماً شبه تام في عمليات الانقسام المفقودة وأداءً قوياً تحت ظروف متنوعة، مما يقدم بديلاً متفوقاً لإنزيم التريبسين في تطبيقات محددة مثل رسم خرائط تعديلات الهيستون ما بعد الترجمة والحفاظ على مواقع ريبوزة الأدينوسين ثنائي الفوسفات (ADP-ribosylation) غير المستقرة.

Hernandez-Rollan, C., Elsborg, J. D., Le Boiteux, E., Lu, Y., Patel, K., Ahel, I., Jensen, O. N., Batth, T. S., Olsen, J (…)2026-05-28
⚗️ biochemistry

A cell type-resolved proteomic atlas of the human body

تقدم هذه الدراسة أول أطلس بروتيومي بشري مفصل حسب نوع الخلية، تم إنتاجه عبر تقنية "البروتيوميات البصرية العميقة" (Deep Visual Proteomics) من متبرعة سليمة، والتي تُحدد كميات آلاف البروتينات عبر 27 نوعاً من الخلايا للكشف عن نواة عالمية وبرامج متخصصة، وتكشف عن مستضدات جديدة لسرطان الخصية، وتوفر مورداً أساسياً لمقارنة وفرة الحمض النووي الريبي (RNA) والبروتين بدقة الخلية الواحدة.

Weiss, C. A., Sjoestedt, E., Debnath, A., Ben-Moshe, S., Diedrich, L., Zwahlen, M., Oeller, M., Wahle, M., Skarwan, E. (…)2026-05-27
⚗️ biochemistry

Functional partitioning of lipoic acid decouples cellular abundance from mitochondrial utilization

تكشف هذه الدراسة أن حمض الليبوئيك يوجد في مجموعات متميزة حرة ومرتبطة بالبروتين داخل الخلايا الثديية، مما يثبت أن الاستخدام الميتوكوندري يعتمد على مسار mtFAS لليبوئلة البروتينية بدلاً من الوفرة الخلوية، وهو ما يتحدى فعالية المكملات الغذائية لحمض الليبوئيك في استعادة الوظيفة الميتوكوندرية في الاضطرابات الأولية.

Norden, P. R., Wedan, R. J., Ellis, A. E., Hart, M. L., Gendjar, M. R., Sheldon, R. D., Nowinski, S. M.2026-05-23
⚗️ biochemistry

Cells Engage Endogenous Malonate Synthesis to Drive Mitochondrial Metabolism

تكشف هذه الدراسة أن الخلايا تقوم بتخليق المالونات بنشاط عبر إنزيم ACC1 لتغذية تخليق الأحماض الدهنية في الميتوكوندريا ودعم الفسفرة التأكسدية، مما يثبت أن المالونات يعمل كوسيط استقلابي داخلي منظم وليس مجرد مثبط لـ المعقد الثاني (complex II).

Wedan, R. J., Norden, P. R., Canfield, M. T., Ellis, A. E., Saxena, S., Longenecker, J. Z., Dykstra, M., Sheldon, R. D. (…)2026-05-23