⚗️ biochemistry

Stable isotope-assisted computational mass spectrometry reveals root-specific alkaloids in Glycyrrhiza species

من خلال دمج قياس الطيف الكتلي الحسابي بمساعدة النظائر المستقرة مع الشبكات الجزيئية على أنسجة نبات العرقسوس الموسومة بنظير الكربون-13 (13C)، تمكن الباحثون من توصيف الأيض النوعي للجذور في النبات واكتشاف قلويدات فلافونويد جديدة مقترنة بحمض الهوموبيبيروليك، مع التحقق من هياكلها واقتراح مسار حيوي فريد لها.

Sawai, K., Todoroki, Y., Nakamukai, S., Matsuzawa, Y., Noguchi, K., Kato, T., Mori, T., Rai, A., Hirai, M. Y., Tsugawa (…)2026-05-08
⚗️ biochemistry

The turn less taken: Investigating patterns in β-turn dynamics using large-scale molecular dynamics data

من خلال تحليل بيانات ديناميكا جزيئية واسعة النطاق من قاعدة بيانات mdCATH، تصنف هذه الدراسة ستة أنواع من التواءات بيتا (β-turn)—بما في ذلك نوع هجين جديد I/I' intermediate—وتوضح كيف تتحكم تسلسلات أحماض أمينية محددة وسياقات هيكلية مجاورة بشكل مشترك في ديناميكيتها وتشكيلها ومرونتها.

Zhang, S., Maddipatla, S. A., Vedula, S., Marx, A., Bronstein, A. M.2026-05-08
⚗️ biochemistry

Hydrophobic pocket engineering of arylmalonate decarboxylase expands its substrate scope towards the synthesis of the (R)-enantiomers of sterically hindered carboxylic acids

من خلال هندسة الجيب الكاره للماء لإنزيم ديكاربوكسيلاز الأريل مالونات (AMDase)، نجح الباحثون في توسيع نطاق ركيزته لتخليق المتصاوغات من النوع (R) للأحماض الكربوكسيلية ألفا-أريل وألفا-ألكينيل ذات الإعاقة الفراغية بنقاء مرآتي فائق.

van der Pol, E., Krammer, L.-M., Eder, J., Gross, D., Fischer, R., Miyamoto, K., Breinbauer, R., Kourist, R.2026-05-08
⚗️ biochemistry

More than an attachment module: covalent inhibitor warheads influence BTK dynamics and function.

تكشف هذه الدراسة أن الطبيعة الكيميائية للرؤوس الحربية التساهمية في مثبطات BTK، وتحديداً 2-بوتيناميد مقابل الأكريلاميد، تعمل بنشاط على تعديل ديناميكيات تشكل البروتين وفعالية الإشارات بدلاً من كونها مجرد مجموعات ارتباط خاملة، مما يؤثر بالتالي على أداء المثبط وآليات المقاومة المحتملة.

Joseph, R. E., Britton, R. G., Lin, D. Y.-w., Roche, J., Purslow, J. A., Fulton, D. B., Fukasem, P., Gleeson, M. P., Dye (…)2026-05-08
⚗️ biochemistry

Evolutionarily Conserved Amyloid Aggregation in the PACAP Peptide Family Is Controlled by Heparin-Sensitive Lys/Arg Gatekeeper Residues

تكشف هذه الدراسة أن التجمع الأميلويدي المحفوظ تطورياً في عائلة ببتيد PACAP يتم التحكم فيه بدقة من خلال بقايا الليسين/الأرجينين الحارسة والحساسة للهيبارين، والتي تعمل كمفاتيح شرطية لتمكين تكوين الليفات الوظيفي داخل الحبيبات الإفرازية على الرغم من التباين التسلسلي الكبير عن عائلة الجلوكاجون.

Horvath, D., Szaniszlo, S., Zsolt, D., Fazekas, Z., Doung, Y. K. H., Perczel, A.2026-05-07
⚗️ biochemistry

ARHGEF7 S-glutathionylation promotes cancer cell migration through Rac1 activation

تكشف هذه الدراسة أن عملية الـ S-glutathionylation لبروتين ARHGEF7 عند البقايا C312 تعزز ارتباطه ببروتين Rac1 وتنشيطه، مما يؤدي إلى دفع هجرة الخلايا السرطانية وغزوها عبر محور الإشارات Rac1-PAK1-LIMK1/MEK1 استجابةً للإجهاد التأكسدي وعامل نمو البشرة (EGF).

Schiff, W. H., Shivamadhu, M. C., Mashhadi Ramezani, F., Kukulage, D. S. K., Padmavathi, R., Ahn, Y.-H.2026-05-06
⚗️ biochemistry

Metabolic glues as a means of purine sensing and chemotherapeutic response

تكشف هذه الدراسة أن نيوكليوتيدات البيورين تعمل كغراء استقلابي داخلي يربط إنزيم PPAT بمثبطه NUDT5 لتنظيم تخليق البيورين من خلال استشعار المغذيات، وهي آلية تستغلها أدوية الثيوبورين الكيميائية لعلاج السرطان لتعزيز فعاليتها من خلال اتخاذ توجهات فريدة داخل جيوب ربط قابلة للتكيف.

Witus, S. R., Kober, M. M., Roh, H., Yang, Z., Choueiry, F., Ghate, A. S., Titov, D. V., Rape, M.2026-05-06
⚗️ biochemistry

Methionine, Not S-adenosylmethionine, Acts as a Primary Metabolic Stress Signal for Chromatin Remodeling

تُظهر هذه الدراسة أن توافر الميثيونين، وليس وفرة S-أدينوسيل ميثيونين (SAM)، يعمل كإشارة استقلابية أولية تحفز تراكم MAT2A النووي وما يتبع ذلك من إعادة تشكيل الكروماتين لدفع مسارات الاستجابة للإجهاد والمناعة الفطرية أثناء الحرمان من العناصر الغذائية.

Leech, C. M., Haws, S. A., Denu, J. M.2026-05-05
⚗️ biochemistry

Co-sedimentation is the key to the structural investigation of wild-type FAT10

تُظهر هذه الدراسة أن الترسيب المشترك مع البروتين المهايئ NUB1L يتيح إجراء تحليل بنيوي عالي الجودة باستخدام رنين المغناطيسي النووي (MAS NMR) للنطاق N لبروتين FAT10 البري غير المنضبط ذاتياً، مما يكشف عن تشكيله لمعقد ضبابي مطابق لمتغيره المستقر ويضع طرفه النتروجيني في وضعية تسمح بالتحلل البروتوزومي.

Weiss, C., Perrone, B., Catone, N., Aichem, A., Mathies, G.2026-05-03
⚗️ biochemistry

Integrin-independent Tie2 activation using de novo designed proteins

باستخدام تصميم البروتين من الصفر، صمم الباحثون محفزًا لمستقبل "Tie2" غير معتمد على الإنتيغرين، مما يؤكد أن ارتباط الإنتيغرين ليس مطلوبًا لتنشيط المستقبل ولكنه ضروري لإطالة مدة الإشارة، بينما أظهر فعالية علاجية قوية في نموذج فأر لمتلازمة الضائقة التنفسية الحادة.

McCurdy, C., Zhao, Y. T., Kumar, S., Coventry, B., Pink, A., Fu, Y., Bohn, P., Zhu, S., Goreshnik, I., Wang, X., Ruth, G (…)2026-05-02