⚗️ biochemistry

Improved sensors for fructose-1,6-bisphosphate enable in vivo imaging of glycolysis

طوّر المؤلفون HYlight2، وهو مستشعر مُحسَّن مشفر جينياً لمركب الفركتوز-1،6-ثنائي الفوسفات، يوفر حساسية معززة بشكل كبير ويسمح بالتصوير الحيوي لتدفق عملية التحلل السكري عبر أنسجة وكائنات متنوعة، بما في ذلك الخلايا العصبية، والجزر البنكرياسية، والكبد.

Tyler, J., Amrapali Vishwanath, A., Menon, T., Duarah, T., Adhikari, R., Koberstein, J. N., Feliciano, D., Espinosa-Medi (…)2026-05-01
⚗️ biochemistry

Design to Data for Mutant of β-Glucosidase B from Paenibacillus polymyxa: G23S

أدت الطفرة G23S في إنزيم بيتا-جلوكوسيداز B من بكتيريا *Paenibacillus polymyxa*، والتي تم التنبؤ بها عبر نمذجة Foldit وقاعدة بيانات Design to Data، بنجاح إلى تعزيز الكفاءة التحفيزية والسرعة القصوى للتفاعل بمقدار ضعفين وأربعة عشر ضعفاً على التوالي، مع وجود تراجع طفيف فقط في الاستقرار الحراري.

O'Donnell, A., Abbas, G.2026-04-30
⚗️ biochemistry

The discovery of missing taxane C13α-O-deacetylases re-delineates the biosynthetic pathway of paclitaxel

تحدد هذه الدراسة إنزيمات نزع أسيتيل التاكسان الجديدة (T13dA1 وT13dA2 وT79dA) التي تعيد رسم مسار التخليق الحيوي للباكليتاكسيل كشبكة معقدة، مما يتيح إعادة تكوين ناجحة لإنتاج الباكيتين III عالي المردود في نبات *Nicotiana benthamiana* من خلال مسارات متكاملة مكونة من 18 و19 جيناً.

Li, C., Sun, X., Chen, R., Xie, K., Chen, D., Liu, J., Dai, J.2026-04-30
⚗️ biochemistry

PPM1B utilizes a trinuclear metal architecture for phosphatase activity

تكشف هذه الدراسة أن الفوسفاتاز PPM1B يستخدم مركزاً معدنياً ثلاثي النوى، حيث يقوم أيون معدني ثالث (M3) بالتنسيق مباشرة مع الركيزة وتثبيت المجموعة المغادرة لدفع عملية التحلل المائي، مما يمثل استراتيجية كيميائية تقاربية مع فوسفاتازات PPP توظف بنية تحفيزية متميزة.

Stevens, R. P., Solodushko, V., Wierzbicki, A., Rich, T. C., Alexeyev, M. F., Thompson, M. K., Stone, M., Hall, C., deWe (…)2026-04-27
⚗️ biochemistry

Designed Minibinders Rewire Receptor Signaling to Enable Functional Human Myogenic Reprogramming

تُظهر هذه الدراسة أن البروتينات المصغرة (C6-DPC) المصممة بواسطة الذكاء الاصطناي يمكنها التغلب على حواجز الإشارات لتمكين إعادة البرمجة العضلية البشرية الوظيفية والفعالة، وذلك من خلال التنشيط المتزامن لمسارات FGFR المحفزة لتكوين العضلات وتثبيط إشارات ALK1/TGFBR2 المضادة لتكوين العضلات وإشارات gp130 الالتهابية، مما يؤدي إلى توليد أنسجة عضلية عالية القوة من الخلايا الليفية.

Keshri, R., Foreman, Z., Barrett, P., Robinson, A. J., Reyes, G., Phal, A. A., Krishnakumar, A., Narog, E., Chiu, M., Ja (…)2026-04-27
⚗️ biochemistry

De novo design of a macrocycle induced dimerization system for cellular control

طوّر باحثون نظاماً للثنائية المستحثة كيميائياً باستخدام ببتيد حلقي مصمم حديثاً، ونفاذ عبر الغشاء، ومتماثل ثنائي مع بروتين متوافق، مما يتيح تحكماً شرطياً دقيقاً في العمليات الخلوية مثل التعبير الجيني وإعادة تشكيل اللوسيفيريز.

Baker, D., Hanna, S., Salveson, P., Wicky, B., Kennedy, M., Hicks, D., Moller, C., Cheng, S., Li, X., Abedi, M., Coventr (…)2026-04-26
⚗️ biochemistry

Biochemical and structural characterisation of MprF homologue,LpiA from Agrobacterium

تُوصّف هذه الورقة الخصائص الكيميائية الحيوية والبنية الثنائية لبروتين LpiA، وهو نظير لبروتين MprF من بكتيريا *Agrobacterium fabrum*، باستخدام المجهر الإلكتروني فائق التبريد (cryo-EM) للكشف عن السمات الهيكلية المحفوظة والأنماط المحتملة لارتباط الركيزة المشتركة مع الأنواع البكتيرية ذات الصلة.

Dhole, S., Sabharwal, P., Kutti, V. R.2026-04-26
⚗️ biochemistry

Lag phase length of IAPP amyloid formation predicts the duration of β-cell toxicity

تُظهر هذه الدراسة أن مدة سمية خلايا بيتا الناتجة عن بروتين (IAPP) يمكن التنبؤ بها كمياً من خلال طول مرحلة التأخر في التجمع، مما يشير إلى أن الوسائط ما قبل الليفية العابرة، وليس الألياف الناضجة، هي المحركات الأساسية للاختلال الوظيفي الخلوي في مرض السكري.

Plesner, A., Cao, P., Raleigh, D., Abedini, A.2026-04-25
⚗️ biochemistry

Fluorescent non-canonical amino acid as a site-specific conformational probe of prion formation

تُثبت هذه الدراسة أن الحمض الأميني غير التقليدي الفلوري 7-HCAA يعمل كمسبار حساس ومحدد الموقع لمراقبة التغيرات التشكلية في الوقت الفعلي أثناء تكوين البريون، مما يبرهن على قدرته على تتبع التحولات الهيكلية في المختبر مع الحفاظ على القدرة الإنتانية لبروتين PrPSc في الكائن الحي.

de Alcantara Ferreira, J., Walsh, D. J., Turnbaugh, E., Mills, J. H., Supattapone, S.2026-04-24
⚗️ biochemistry

Zero-shot design of a de novo metalloenzyme

تقدم هذه الورقة dEVA، وهو إطار عمل لخوارزمية تطورية متعددة الأهداف يتيح التصميم من الصفر وبدون معرفة مسبقة (zero-shot) لإنزيمات معدنية وظيفية دون الاعتماد على قوالب طبيعية، حيث نجحت في إثبات القدرة على ابتكار إنزيم ثنائي الزنك بكفاءة تحفيزية تضاهي الفوسفاتاز الطبيعية.

El Nesr, G., Duerr, S. L., Mathews, I. I., Wen, Q., Zhao, K., Sarangi, R., Roethlisberger, U., Sunden, F., Huang, P.2026-04-24