1123 ورقة بحثية
تؤسس هذه الدراسة إطار عمل موحد للتعليق التوضيحي القائم على التعبير، مما يتيح الكشف المنهجي والقياس الكمي القابل للتكرار للحمض النووي الريبوزي الصغير من نوع "فولت" (svtRNAs) الوفير في الخلايا البشرية، كاشفةً عن معالجتها المتسقة وأدوارها التنظيمية المحتملة الشبيهة بالحمض النووي الريبوزي الميكروي (miRNA) عبر مجموعات بيانات متنوعة.
يُعد "Descriptron-GBIF Annotator" منصة تعتمد على التعهيد الجماعي عبر المتصفح ولا تتطلب تثبيتاً، وهي تستفيد من التجزئة المدعومة بالذكاء الاصطناه ومن الأنطولوجيات المعيارية لتمكين الجمهور من إنشاء توصيفات مورفولوجية مهيكلة من صور GBIF، مما يعالج ندرة بيانات التنوع البيولوجي الموصوفة من خلال بنية ثنائية الطبقات تغذي مساهمات العلوم المواطنية في تدريب نماذج الذكاء الاصطناعي الخبيرة.
يُعد Cycle-Extractor أداة برمجة خطية للأعداد الصحيحة المختلطة سريعة ودقيقة تعيد بناء هياكل الحمض النووي خارج الكروموسومات (ecDNA) من بيانات تسلسل القراءات القصيرة والطويلة على حد سواء، متفوقةً بذلك على الطرق الحالية في السرعة ومحققةً دقة فائقة في تحديد الدوائر الورمية الكبيرة ذات النسخ العالية التي تم التحقق منها بالأدلة التجريبية.
تقدم هذه الورقة SuperSurv، وهي حزمة مفتوحة المصدر للغة R توفر إطار عمل موحداً لبناء وتقييم وتفسير مجموعات التعلم الآلي لبيانات البقاء على قيد الحياة ذات الرقابة اليمنى، وذلك من خلال دمج المتعلمين غير المتجانسين، وتنفيذ التكديس الموزون بـ IPCW، وتقديم أدوات شاملة لضبط المعلمات الفائقة، والمقارنة المرجعية، والتفسير السريري.
تقدم الورقة البحثية DNA-MGC+، وهو برنامج ترميز متعدد الاستخدامات يتفوق بشكل كبير على الحلول الحالية من خلال تمكين استرجاع البيانات بشكل موثوق وفعال من حيث الموارد على الحمض النووي الاصطنا tamp عبر منصات تسلسل متنوعة، حتى في ظل معدلات خطأ عالية وأعماق تسلسل منخفضة.
تُعد BioPipelines إطار عمل مفتوح المصدر بلغة بايثون يعمل على تبسيط اعتماد أدوات التعلم العميق لتصميم البروتينات والروابط من خلال تمكين علماء الأحياء الكيميائية من تحديد ونمذجة وتنفيذ سير عمل حوسبي معقد ومتعدد الخطوات بأقل جهد برمجي ودون الحاجة إلى بنية تحتية متخصصة.
تقدم هذه الدراسة أدلة كيميائية حيوية على أن الحمض النووي الريبوزي مزدوج الشريط (dsRNA) الذي يتم تناوله عن طريق الفم في خنفساء البطاطس الكولورادية تتم معالجته إلى جزيئات حمض نووي ريبوزي صغير (siRNAs) وظيفية داخل الجهاز العصبي المركزي، مما يؤكد النقل والنشاط الجهازي لتقنية تداخل الحمض النووي الريبوزي (RNAi) في الأنسجة العصبية.
تقدم الورقة البحثية نموذج SpliceSelectNet، وهو نموذج تعلم عميق هرمي قائم على تقنية Transformer، يحقق دقة وحالة متطورة في التفسير البيولوجي عند التنبؤ بمواقع الوصل وتحديد الوصل غير الطبيعي من خلال التقاط التبعيات التنظيمية المحلية وبعيدة المدى (حتى 100 كيلوباز) في تسلسلات الحمض النووي بشكل فعال.
فليمنج (Fleming) هو وكيل ذكاء اصطناعي تكاملي يجمع بين النماذج التمييزية والتوليدية مع تحسين الجزيئات والتنبؤ بخصائص الامتصاص والتوزيع والتمثيل الغذائي والإخراج والسمية (ADMET) لتحديد وتصميم مركبات رائدة جديدة بنجاح لتثبيط المتفطرة السلية بمعدلات نجاح مخبرية عالية وملفات تعريف سلامة مواتية.
تُعد FLAMESv2 حزمة برمجية عالية الوحدات ومستقلة عن البروتوكولات، مصممة لبيئة R/Bioconductor، لمعالجة وتحليل بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA) أحادية الخلية والمكانية ذات القراءات الطويلة، مما يتيح توصيفاً شاملاً للأشكال المتعددة للـ RNA (isoforms)، والربط البديل (alternative splicing)، والتباين الخلوي عبر مختلف مسارات العمل التجريبية.