⚛️ biophysics

Transferability of ion force fields to OPC water: Maintaining single-ion and ion-pairing properties

تُظهر هذه الدراسة أن حقول قوة الأيونات الحالية لا تنتقل مباشرة إلى ماء (OPC) دون انحرافات كبيرة، مما دفع المؤلفين إلى اقتراح حقل القوة الجديد MS/G-LB(OPC)، الذي يجمع بين معاملات كاتيونية وأنيونية محددة لإعادة إنتاج طاقات الهيدرات الحرّة التجريبية، والخصائص البنيوية، ومشتقات النشاط بدقة.

Wiebeler, C., Falkner, S., Schwierz, N.2026-04-02
⚛️ biophysics

Correcting Preprocessing Bias in Sparse Chromatin Contact Data Enables Physically Interpretable Reconstruction of Genome Architecture

تحدد هذه الورقة وتصحح انحيازاً جوهرياً في معالجة خرائط اتصال الكروماتين مسبقة المعالجة ناتجاً عن قص المئويات للمصفوفة الكاملة، مقدمةً إطاراً متسقاً إحصائياً وأداة تعلم عميق (CCUT) تتيح إعادة بناء كمي وقابل للتفسير فيزيائياً لبنية الجينوم بما يتوافق مع فيزياء البوليمرات ونماذج استخراج العراوي.

Sys, S., Misak, M., Soliman, A., Herrera-Rodriguez, R., Lambuta, R.-A., Weissbach, S., Everschor, K., Schweiger, S., Mic (…)2026-04-02
⚛️ biophysics

YY1-concentration-dependent formation of mechanically distinct DNA condensates through different interaction mechanisms

تكشف هذه الدراسة أن عامل النسخ YY1 يُشكّل تكاثفات DNA متميزة ميكانيكيًا بطريقة تعتمد على التركيز، حيث تؤدي التركيزات العالية متوسطًا إلى تجمعات تشبه السوائل وضعيفة الترابط مدعومة بـ DNA غير متحرك، بينما تدفع التركيزات العالية نحو تكاثفات تشبه المواد الصلبة وقوية الترابط من خلال الجسر الناتج عن أصابع الزنك.

Yan, X., Terakawa, T.2026-04-02
⚛️ biophysics

Structural Basis of M1 Muscarinic and H3 Histamine Receptor Inhibition in OPC Differentiation

توضح هذه الدراسة الأساس الهيكلي الذي يثبط من خلاله المركب الرائد CN045 مستقبلات المسكارين M1 ومستقبلات الهيستامين H3 لتعزيز تمايز الخلايا السلفية للدبيدات قليلة التغصن، كاشفةً عن ارتباط أقوى وأكثر استقراراً بمستقبل M1 من خلال المحاكاة الحاسوبية لتوجيه تطوير علاجات إعادة تكوين الميالين لمرض التصلب المتعدد.

Raubenolt, B., Cumbo, F., Joshi, J., Martin, W., Medicetty, S., Yang, Y., Trapp, B., Blankenberg, D.2026-04-02
⚛️ biophysics

Structure and dynamics of a multidomain ligand-gated ion channel revealed under acidic conditions

باستخدام المجهر الإلكتروني المبرد تحت ظروف حمضية، حدد الباحثون بنية قناة الأيونات البكتيرية المنظمة بالربيطة DeCLIC في هيئة مسامية موسعة لم تكن معروفة سابقاً، مع تحديدها كحالة مفتوحة وظيفية وتوضيح كيفية قيام ارتباط الكالسيوم وديناميكيات النطاق الطرفي-N بدفع القناة نحو الإغلاق.

Anden, O., Rovsnik, U., Lycksell, M., Delarue, M., Howard, R. J., Lindahl, E.2026-04-01
⚛️ biophysics

Biophysical fitness landscape design traps viral evolution

تقدم هذه الورقة تصميم مشهد اللياقة الفيزيائية الحيوية (FLD)، وهو إطار حوسبي يستخدم مجموعات أجسام مضادة مُحسّنة لإعادة تشكيل مشاهد اللياقة الفيروسية كمياً، مما يؤدي إلى كبح تطور المتغيرات الهاربة مثل متغيرات سارس-كوف-2 بشكل استباقي قبل ظهورها.

Mohanty, V., Shakhnovich, E. I.2026-04-01
⚛️ biophysics

Mass photometry reveals stoichiometry and binding dynamics of bispecific tetravalent anti-VEGF-PD-1 antibody ivonescimab

تُحلل هذه الدراسة، باستخدام قياس الكتلة والنمذجة الحركية، ديناميكيات الارتباط للأجسام المضادة ثنائية الخصوصية "إيفونيسيماب"، كاشفةً أنها تشكل بشكل سائد ثنائيات مستقرة بنسبة 2:2 مع عامل نمو بطانة الأوعية الدموية (VEGF) ومعقدات ثلاثية تقدم جزيئين من مستقبل PD-1، مع ثوابت تفكك متميزة لكل تفاعل.

Jajcanin Jozic, N., Bishop, J., O'Shea, A. R., Karunanithy, G., Lichten, C., Cheeseman, S.2026-04-01
⚛️ biophysics

Intermittent attachments form three-dimensional cell aggregates with emergent fluid properties

تقدم هذه الورقة نموذجاً مبنياً على الخلايا يتسم بالبساطة، يوضح أن الالتصاقات المتقطعة النشطة تقود انتقال التجمعات الخلوية إلى تجمعات ثلاثية الأبعاد ذات خصائص ناشئة تشبه السوائل، مما يفسر بنجاح الملاحظات التجريبية لظواهر تنقيط خلايا السرطان، وتقلبات الشكل، والتحرك الكيميائي الجماعي.

Panigrahi, D. P., Celora, G. L., Ford, H. Z., Insall, R. H., Bhat, R., Manhart, A., Pearce, P.2026-04-01
⚛️ biophysics

PLCβs are recruited to the plasma membrane in macrophages by both Gβγ and Gαq

باستخدام الخلايا البلعمية كنموذج دراسي، تُظهر هذه الدراسة أن كلاً من Gβγ وGαq يعملان بشكل مستقل على استدعاء إنزيمات PLCβ إلى الغشاء البلازمي لتنشيطها، مما يثبت أن Gβγ وحده كافٍ لتنشيط PLCβ في سياقات تأشير داخلية محددة.

Falzone, M., Banerjee, P., MacKinnon, R.2026-04-01
⚛️ biophysics

Closed Kinematic Chain Biomechanics and Cycling: Linking Biomechanical Variables to Knee Joint Loading

استخدمت هذه الدراسة الديناميكا العكسية لبرنامج OpenSim والتحسين الاستاتيكي على بيانات من 16 دراجاً لتوصيف التباين الكبير بين الأفراد في عزم دوران مفصل الركبة وقوى رد الفعل، مما يسلط الضوء على الأدوار الحاسمة لمجموعات عضلية محددة ويدعم الحاجة إلى استراتيجيات تدريب وتأهيل شخصية في رياضة ركوب الدراجات.

BAHO VITA, H., Welegebriel, D. F.2026-04-01