433 ورقة بحثية
تقدم هذه الورقة نموذج معادلة تفاضلية جزئية للسطح الهندسي (GS-PDE) لمحاكاة انتقال الخلية والنواة عبر القنوات المجهرية الضيقة، حيث تم التحقق بنجاح من صحة هذا النهج مقابل البيانات التجريبية وتحديد التوتر السطحي وهندسة الحجز كعوامل حاسمة تحكم كفاءة الهجرة.
تُظهر هذه الدراسة أن القوة الأيونية للبيئة تعمل كمنظم شكلي (conformational rheostat) لعامل النسخ Phd غير المنتظم هامشياً، حيث تعدل انتقاله من حالة عدم الانتظام الكامل إلى مونومر غير منتظم جزئياً، وصولاً في النهاية إلى ثنائي بنيوي، مما ينظم وظيفته من خلال طيف من حالات الانتقال من عدم الانتظام إلى الانتظام.
تُثبت هذه الدراسة أن قلب الثدييات مادة طوبولوجية نيماتية كيرالية، حيث تُظهر أن كيرالية ألياف عضلة القلب المنظمة والعيوب الطوبولوجية المحددة ضرورية لتوليد انقباض التوائي فعال، بشكل مستقل عن النمط التشريحي لليمين واليسار في الجسم.
توضح هذه الدراسة الآلية الدورانية لمحرك سوط بكتيريا *Campypylobacter jejuni* من خلال إثبات أن التميؤ غير المتماثل والتبديل المتناوب للبرتنة لبقايا D22 المزدوجة، مقترناً بإزالة السدادة والتغيرات في تشكل السلسلة الجانبية، هي عمليات أساسية لتحويل تدرجات الأيونات إلى قوة ميكانيكية.
تكشف هذه الدراسة أن سوء طي البروتين الناتج عن أخطاء التشابك يزيد بشكل كبير من احتمالية التحلل البروتوزومي بوساطة اليوبيكويتين في الخلايا البشرية، بينما يتجنب حوالي ثلث هذه البروتينات سيئة الطي عملية التحلل عبر اتخاذ حالات قريبة من الحالة الأصلية.
باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية طويلة المدى وطرق الذكاء الاصطناعي وتعلم الآلة، توضح هذه الدراسة الآلية الذرية التي يقوم من خلالها بروتين nsp10 المرن بتنشيط nsp16 في فيروس SARS-CoV-2 عبر مزلاج كاره للماء، مما يؤدي إلى تغييرات تشكيلية تفتح موقع ربط الحمض النووي الريبي (RNA) وتنظم تبادل SAM/SAH لتمكين التهرب المناعي الفيروسي.
تستخدم هذه الدراسة محاكاة الديناميات الجزيئية لجميع الذرات لتوضيح أن زيادة تركيزات الليبومانان والليبوارابينومان في الأغشية الداخلية للمتفطرات تحفز انتقالاً إلى حالة تشبه الفرشاة المدمجة التي تقلل من إمكانية وصول المذيب وتُبطئ انتشار الدهون عبر الطبقة الثنائية، مما يضع إطاراً جزيئياً لفهم دور الغشاء كحاجز فيزيائي منظم ومنصة للفوعة.
تكشف هذه الدراسة، باستخدام تصوير الجزيء المنفرد، أن حركة بروتينات G ثلاثية الوحدات في الخلايا الحية تختلف باختلاف النوع وتتحدد أساساً من خلال الوحدة الفرعية Gα، حيث تُظهر البروتينات ثلاثية الوحدات التي تحتوي على G12/13 انخفاضاً ملحوظاً في الحركة الجانبية مقارنة بتلك التي تحتوي على الوحدات الفرعية Gi/o أو Gs أو Gq.
مستوحاةً من الأنظمة البيولوجية، تقدم هذه الورقة شبكة إزاحة خيوط الحمض النووي (DNA) خالية من الإنزيمات تستخدم قوالب من الحمض النووي أحادي الخيط لتجميع متعدِّدات محددة وطويلة العمر غير تساهمية من مجمع أحادي القسيمات بشكل حفزي وذاتي تحت ظروف متساوية الحرارة، مما يتجاوز بفعالية تثبيط الناتج لإنشاء مجموعات بعيدة عن حالة التوازن.
يقدم المؤلفون VULCROM، وهو مجهر ضوئي بردي فائق الاستقرار وخالٍ من الفراغ، يتيح إجراء مجهرية الارتباط الضوئي والإلكتروني فائقة الدقة روتينية (cryo-SR-CLEM) على العينات البيولوجية المجمّدة، حيث نجح في تحليل البنى الخلوية نانوية المقياس في كل من الأنسجة الحيوانية والنباتية من أجل التصوير المقطعي الإلكتروني البردي.