⚛️ biophysics

Kinetic proofreading as a mechanism for transcriptional specificity in living human cells

تُظهر هذه الدراسة أنه في الخلايا البشرية الحية، يتم تحقيق النوعية النسخية من خلال آلية تدقيق حركي تعتمد على الطاقة حيث تعمل المحفزات ككواشف لزمن المكوث، مما يسمح لمستقبل الجلوكوكورتيكويد بالتمييز بين مواقع الارتباط النوعية وغير النوعية عبر عمليات مدفوعة بـ ATP مثل النِديلة وإعادة تشكيل الكروماتين.

Kim, J. M., Ball, D. A., Johnson, T. A., DInzeo, C., Cho, H. J., Ozbun, L., Karpova, T. S., Pegoraro, G., Larson, D. R.2026-03-18
⚛️ biophysics

Quantitative Mapping of Sulfation, Iduronic Acid, and Secondary Structure in Glycosaminoglycans

تستخدم هذه الدراسة عمليات محاكاة الديناميات الجزيئية واسعة النطاق لتوضيح أن التشكيلات اللولبية لـ GAG مدفوعة باستقرار حمض الإيدورونيك من النوع L عبر أنماط كبرتة محددة، وتستحدث مقياساً كمياً ذا معيارين لتصنيف هذه البنى الثانوية بشكل موضوعي.

Riopedre-Fernandez, M., Biriukov, D., Martinez-Seara, H.2026-03-18
⚛️ biophysics

Functional coupling between ribosomal RNA transcription and processing guided by stable transcription factor binding

تكشف هذه الدراسة، باستخدام مجهر الفلورة للجزيء المنفرد متعدد الألوان، أن التجمع المستقر لمركب rrnTAC الذي يستمر لدقائق، والمدفوع بتجنيد بروتين SuhB، ضروري لتقليل توقف إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي (RNAP) وتعزيز المعالجة المصاحبة للنسخ للحمض النووي الريبي (rRNA)، مما يميز الديناميكيات الوظيفية لنسخ الـ rRNA عن التفاعلات العابرة النموذجية لنسخ الـ mRNA.

Chaban, A., Qureshi, N. S., Duss, O.2026-03-18
⚛️ biophysics

PSF-Driven Spatio-Temporal Blending in Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy and Its Mitigation via Mean-Shift Super-Resolution-Based Masking.

تقدم هذه الورقة سير عمل فعالاً من الناحية الحسابية يستخدم تقنية "التحول المتوسط لتعزيز الدقة" (MSSR) لتوليد أقنعة مكانية قائمة على الكثافة، مما يقلل بفعالية من خلط الإشارات المكاني-الزماني الناتج عن دالة انتشار النقطة (PSF) في مجهر تصوير عمر الفلورة (FLIM)، ويعيد استعادة بصمات العمر الدقيقة دون تغيير حركية الاضمحلال الزمني الأساسية.

Gonzalez-Gutierrez, M., Vazquez-Enciso, D. M., Mateos, N., Hwang, W., Torres-Garcia, E., Hernandez, H. O., Chacko, J. V. (…)2026-03-18
⚛️ biophysics

Structural mechanisms of pump assembly and drug transport in the AcrAB-TolC efflux system

تقدم هذه الدراسة بنيات مجهرية إلكترونية ببرودة (cryo-EM) عالية الدقة لمعقدات التدفق في بكتيريا الإشريكية القولونية (*E. coli*) الأصلية، والتي تكشف أن البروتين الشحمي YbjP غير الموصوف سابقاً يعمل كمكون بنيوي حاسم يثبت بروتين TolC في الغشاء الخارجي ويستوعب التغيرات التشكيلية أثناء دورة نقل الدواء الكاملة.

Ge, X., Gu, Z., Wang, J.2026-03-17
⚛️ biophysics

A predictive mechanochemical modeling framework for the deformation and remodeling of the nuclear lamina

تقدم هذه الدراسة إطاراً لنمذجة ميكانيكية كيميائية تنبؤية تحاكي كيفية تأثير تشوه النواة الناجم عن الركائز ذات الأعمدة النانوية على إعادة تشكيل اللامين والنقل النووي السيتوبلازمي، مما يكشف أن تضاريس نانوية محددة تزيد من توتر الغلاف إلى الحد الأقصى وأن نقص اللامين يزيد بشكل كبير من خطر التمزق، وهو اكتشاف تم التحقق منه لاحقاً تجريبياً.

Francis, E. A., Sarikhani, E., Naghsh-Nilchi, H., Jahed, Z., Rangamani, P.2026-03-17
⚛️ biophysics

Real-Time Visualization of G2L4 Reverse Transcriptase in DNA Repair via Microhomology-Mediated End Joining

تكشف هذه الدراسة، باستخدام مجهر القوة الذرية عالي السرعة، عن الآلية الآنية التي تسهل بها ثنائيات النسخ العكسي G2L4 عملية الالتحام الطرفي بوساطة التماثل الدقيق عبر الارتباط بالحمض النووي (DNA)، وملء الفجوات، ونشاط إنزيم الترسيب الطرفي، بينما يعمل إنزيم T4 DNA ligase على تثبيت نواتج الإصلاح عن طريق سد الثغرات ومنع التفرع غير المساري.

Zhang, P., Guo, M., Zhang, Y. J., Lambowitz, A. M., Lin, Y.-C.2026-03-17
⚛️ biophysics

Intrinsic electrostatics of ATP synthase modulate the proton motive force across species

تكشف هذه الدراسة أن إنزيم بناء ثلاثي فوسفات الأدينوسين (ATP synthase) يمتلك جهداً إلكتروستاتيكياً ذاتياً يعمل مباشرة على تعديل القوة الدافعة للبروتونات المحلية التي يتعرض لها محركه، مما يجعله معدلاً خاصاً بالنوع لفعالية الفسفرة التأكسدية، وهو ما يمكن أن يعزز أو يقلل من عائد ATP اعتماداً على القطبية الهيكلية للإنزيم.

K. Matar, I., Fahimi, P., Vigneau, J.-N., Matta, C. F.2026-03-17
⚛️ biophysics

Spatial confinement reshapes the folding of an ion-stabilized DNA with three-way junction

تُظهر هذه الدراسة، باستخدام نموذج DNAfold2 خشن الحبيبات، أن الحصر المكاني على المقياس النانوي يعمل كمحدد بنيوي يعيد تشكيل مشهد طي الوصلات ثلاثية الاتجاهات للحمض النووي المستقر أيونياً عبر الاستبعاد الإنتروبي للوسائط الممتدة، مما يؤدي إلى تثبيت التضاريس المدمجة وفرض انتقالات تعاونية عبر ظروف أيونية متنوعة.

Wang, X., Shi, Y.-Z.2026-03-17
⚛️ biophysics

A hidden thermal mechanism in inhibitory ligand-gated chloride channels

تكشف هذه الدراسة أن قنوات الكلوريد المثبطة المنظمة بالربيطة، مثل AVR-14B في الخيطيات ومستقبلات الجلايسين في البشر، تعمل كمستشعرات حرارية ذاتية عبر التحول من التثبيط الطوري إلى التثبيط المستمر عند عتبات حرارية محددة عبر مسار نفاذية أيوني غير تقليدي، وهي آلية تؤثر بشكل حاسم على فعالية الأدوية والتحمل الحراري للكائن الحي.

Ohnishi, K., Fujiwara, Y.2026-03-17