⚛️ Category

biophysics

435 ورقة بحثية

⚛️ الفيزياء الحيوية

Rheb membrane orientation dynamics and functional consequences elucidated by molecular simulations, single-molecule-FRET and signaling assays

من خلال دمج محاكاة الديناميات الجزيئية، وتقنية نقل طاقة الفلورة الرنيني للجزيء الواحد (FRET)، ومقايسات تأشير الخلايا، تكشف هذه الدراسة أن ديناميكيات التوجه الغشائي لبروتين Rheb (وهو بروتين GTPase متمركز في الغشاء الداخلي) تُعد حاسمة في تنظيم تنشيط mTORC1، مما يثبت أن التحولات التوجيهية تعمل كآلية تحكم وظيفية لبروتينات GTPase الصغيرة المعدلة بالدهون.

Hutchins, C. M., Pagba, C., Verma, G., Jakubec, J., Du, G., Jayaraman, V., Gorfe, A.2026-03-02
⚛️ الفيزياء الحيوية

RNA i-Motif Formation at Neutral pH

تكشف هذه الدراسة أنه بينما تكون هياكل "آي-موتيف" (i-motifs) للحمض النووي الريبوزي (RNA) غير مطوية عالمياً عند درجة حموضة متعادلة في تجارب المجموعات، فإن تقنيات الجزيء الواحد ترصد تجمعاً صغيراً ولكنه قد يكون ذا أهمية بيولوجية من الهياكل المطوية، مما يشير إلى إمكانية ارتباطها بالبيئات الخلوية.

Preciado-Carrillo, Z., Fountain, S., Wright, E. P., Guneri, D., Abdelhamid, M. A., Craggs, T. D., DING, Y., Waller, Z. A (…)2026-03-02
⚛️ الفيزياء الحيوية

Computational Synthetic Inner Membrane Reveals Cardiolipin-Leak Control of ATP Output

تقدم هذه الورقة إطار عمل حاسوبي قابل لإعادة الإنتاج لغشاء ميتوكوندري داخلي اصطناعي (syn-IMM)، يكشف كيف يتفاعل تركيب الكارديوليبين مع تسرب الغشاء للتحكم في إنتاج ATP، محددًا نافذة ضيقة مثالية للكارديوليبين ومؤسسًا قواعد تصميم كمية للأغشية الحيوية القابلة للبرمجة.

Petalcorin, M. I. R.2026-02-28
⚛️ الفيزياء الحيوية

Critical Assessment of ML models for ADMET Prediction in TDC leaderboards

تُقيّم هذه الدراسة بشكل نقدي لوحات صدارة (ADMET) الخاصة بـ "مجمع بيانات العلاج" (TDC)، وتكشف أن معظم النماذج الأعلى تصنيفاً تعاني من عدم القابلية للتكرار، أو تسرب البيانات، أو الإفراط في ملاءمة مجموعة الاختبار، حيث لم تجتز سوى ثلاث طرق فقط عمليات التحقق الصارمة، مما يسلط الضوء على الحاجة الملحة لمعايير قياس أكثر صرامة تشمل مجموعات اختبار مخفية وبيئات تقديم معيارية.

Koleiev, I., Stratiichuk, R., Shevchuk, N., Melnychenko, M., Nyporko, O., Todoryshyn, D., Husak, V., Starosyla, S., Yesy (…)2026-02-28
⚛️ الفيزياء الحيوية

Impact of Image Representation on Deep Learning-Based Single-Cell Classification by Holographic Imaging Flow Cytometry

تقدم هذه الدراسة أول تقييم منهجي لستة مسارات لتمثيل الصور من أجل التصنيف القائم على التعلم العميق للخلية الواحدة في قياس التدفق التصويري الهولوغرافي، مما يكشف عن مقايضة واضحة بين الكفاءة الحسابية والدقة مع توفير إطار عمل أمثل لباريتو لتوجيه اختيار المسار للتطبيقات الطبية الحيوية.

Pirone, D., Cavina, B., Giugliano, G., Nanetti, F., Reggiani, F., Miccio, L., Kurelac, I., Ferraro, P., Memmolo, P.2026-02-28
⚛️ الفيزياء الحيوية

QuantiTrack: A unified software to study protein dynamics in living cells

يقدم المؤلفون QuantiTrack، وهو برنامج قائم على MATLAB وسهل الاستخدام يوفر حلاً شاملاً لتحليل تتبع الجزيء المنفرد في الخلايا الحية، مُبرهنين على فائدته من خلال الكشف عن كيفية تغيير غسل الهرمونات لديناميكيات الارتباط وحالات التنشيط لمستقبل القشرانيات السكرية.

Ball, D. A., Wagh, K., Stavreva, D. A., Hoang, L., Schiltz, R. L., Chari, R., Raziuddin, R., Mazza, D., Upadhyaya, A., H (…)2026-02-27
⚛️ الفيزياء الحيوية

Time-Resolved Single-Molecule FRET Reveals Length-Dependent Nucleosome Decompaction by Poly(ADP-ribose)

من خلال الجمع بين الخلط الموائع الدقيقة القائم على القطيرات ونقل طاقة الرنين الفلوري للجزيء الواحد، تكشف هذه الدراسة أن البولي (ADP-ريبوز) (PAR) يحفز فك تكتل النيوكليوسوم المعتمد على الطول من خلال التنافس الإلكتروستاتيكي مع الحمض النووي الريبوزي من أجل الارتباط بالهستون، حيث لا تنجح فقط البوليمرات التي تتجاوز عشر وحدات ADP-ريبوز في دفع انفتاح الكروماتين السريع بكفاءة.

Yang, T., Gopi, S. R., Pinet, L., Simoni, S., Imhof, R., Nettels, D., Altmeyer, M., Best, R. B., Schuler, B.2026-02-27
⚛️ الفيزياء الحيوية

Synaptic spine head morphodynamics from graph grammar rules for actin dynamics

تقدم هذه الورقة إطار عمل لـ "قواعد الرسم البياني الديناميكي" (Dynamical Graph Grammar) لنمذجة هيكل الأكتين الخلوي وديناميكيات الغشاء داخل رؤوس الأشواك التغصنية، مما يوضح كيف تتحكم بروتينات ربط الأكتين المحددة وتفاعلاتها في المورفوديناميكا المشبكية من خلال عمليات محاكاة عشوائية مقيدة بيوفيزيائياً.

Hur, M., Bartol, T., Rangamani, P., Sejnowski, T., Mjolsness, E.2026-02-26
⚛️ الفيزياء الحيوية

Self-consistent automatic retrieval of single cell rotation enables highly reliable holo-tomographic flow cytometry

تقدم هذه الورقة طريقة تحسين تكرارية جديدة، مؤتمتة بالكامل ومتسقة ذاتياً، تسترجع بدقة زوايا الدوران المجهولة للخلايا المفردة المتدفقة، مما يعزز بشكل كبير من موثوقية وقابلية توسع قياس التدفق بالتصوير المقطعي الهولوغرافي من أجل التصوير المقطعي بمعامل الانكسار ثلاثي الأبعاد بدون استخدام واسمات.

Pirone, D., Miccio, L., Bianco, V., Ferraro, P., Memmolo, P.2026-02-26
⚛️ الفيزياء الحيوية

A Dynamic NMR Lineshape Simulation Framework for Lipid Diffusion and Membrane Thinning in Bicelles and Nanodiscs

تقدم هذه الورقة إطاراً نظرياً شاملاً لمحاكاة أشكال خطوط الرنين المغناطيسي النووي الديناميكي في ثنائيات البيسل (bicelles) والنانو ديسكات (nanodiscs)، والذي يأخذ في الاعتبار صراحةً انتشار الدهون المقترن، والتوزيعات التوجيهية، وترقق الغشاء، مما يتيح التفسير الكمي للتفاعلات متباينة الخواص والتغيرات الهيكلية في الغشاء الناجمة عن الارتباط الجزيئي الحيوي.

Wi, S., Ramamoorthy, A.2026-02-26