347 ورقة بحثية
تقدم هذه الدراسة تجميعاً جينومياً عالي الجودة، يقترب من مقياس الكروموسوم، لذبابة صنوبر الشائع (*Diprion pini*)، تم إنتاجه باستخدام تقنيات القراءة الطويلة والقراءة المرتبطة دون استخدام تسلسل Hi-C، مما يوفر مورداً قيماً لفهم تطوره، وتحديد الجينات الفريدة المتعلقة بمعالجة المستقلبات النباتية، وتطوير استراتيجيات محسنة لإدارة الآفات.
تُظهر هذه الدراسة أن معقدات إعادة تشكيل الكروماتين من نوع BAF مطلوبة باستمرار للحفاظ على إمكانية الوصول عند المعززات "المهيأة" المستجيبة للمحفزات، لا سيما تلك المرتبطة بـ AP-1 وعوامل النسخ المحددة للنسل، مما يتيح الاستجابات النسخية للإشارات البيئية مثل إنترفيرون غاما والديكساميثازون.
يكشف تحليل لـ 1,001 جينوم للذئب الأوروبي عن فسيفساء معقدة من السلالات التطورية المتميزة ذات مستويات متفاوتة من تزاوج الأقارب والطفرات الضارة، مما يشير إلى أنه على الرغم من التعافي الديموغرافي، تواجه العديد من المجموعات مخاطر صحية جينية كبيرة تستلزم استراتيجيات حفظ دقيقة ومحددة لكل منطقة.
تُثبت هذه الدراسة نظاماً خالياً من الخلايا باستخدام مستخلصات أجنة ذبابة الفاكهة (Drosophila) متعددة النوى لإظهار أن البنى الكروماتينية المعقدة، بما في ذلك الحلقات والمجالات المرتبطة طوبولوجياً، يمكن أن تتشكل تلقائياً من مكونات ذائبة، مما يكشف أن تشكل مجالات محددة عند موقع جين (eve) يعتمد على الاقتران المباشر لعناصر الحدود بواسطة بروتين (Su(Hw)) بدلاً من عملية بزوغ الحلقات البسيطة.
من خلال دمج نماذج تطورية متعددة المقاييس لتحديد الطفرات الضارة، تكشف هذه الدراسة أنه بينما تراكمت في البنجر السكري المستأنس في البداية حمولة جينية أعلى من أقاربه البرية، فإن قرناً من التربية الحديثة قد نجح في تنقية هذه المتغيرات الضارة، مما يقدم مجموعة منتقاة ومطورة من الأهداف لتحسين المحاصيل في المستقبل.
تكشف هذه الدراسة أن بلح البحر "زيبر" و"كواجا" الغازيين يمتلكان بنيات متباينة بشكل صارخ لتحديد الجنس، حيث يُظهر بلح البحر "زيبر" نظام ZZ/ZW متعدد الجينات، بينما يستخدم بلح البحر "كواجا" نظام XX/XY موضعياً مدفوعاً بموقع *FoxL2-Y* جديد محدد للذكور، مما يسلط الضوء على تباعد تناسلي غير متوقع وآليات تطورية سريعة في الأنواع الغازية وثيقة الصلة.
تقدم هذه الدراسة تجميعاً لجينوم عشب *Themeda triandra* من نوع C4 على مستوى الكروموسومات، والذي يكشف عن تماثل في النمط النووي مع السورغم، بينما تكشف التحليلات المقارنة لسلالات متنوعة عن اختلافات جينية كبيرة، بما في ذلك تعدد الصيغ الصبغية وتغيرات في عدد النسخ في الجينات المستجيبة للإجهاد، مما يقدم رؤى قيمة لتحسين المحاصيل المقاومة للمناخ.
تقدم هذه الدراسة إطار عمل للتعلم المستمر يدمج بيانات الخلية الواحدة من أكثر من 300 مريض بسرطان القولون والمستقيم مع أطلس الاضطرابات لرسم الآليات السببية، مما يكشف عن حالة خبيثة متميزة تشبه الأدمة، ويوضح كيف يؤدي تثبيط مسار MAPK إلى تحولات في الحالة الخلوية علاجية.
من خلال تطبيق إطار عمل للترانسكريبتوميات الهندسية على بيانات متعددة المجموعات، تكشف هذه الدراسة أن التهاب الجلد التأتبي يُظهر عدم استقرارًا أكبر في التعبير الجيني المعتمد على المرجع في الآفات بسبب صغر أحجام التأثير، وتُظهر أيضًا أن مجموعة فرعية كبيرة من المرضى غير المصابين بالآفات قد تجاوزت بالفعل حد الاستقرار الفسيولوجي إلى حالات مرتبطة بالمرض، وهي ظاهرة تحجبها التحليلات التقليدية المعتمدة على متوسط المجموعات.
تؤسس هذه الدراسة مورداً شاملاً واستراتيجيات نمذجة تسلسل مبتكرة من خلال دمج البيانات متعددة الأوميكس من 190 متبرعاً بشرياً لرسم خرائط المتغيرات التنظيمية من نوع "سيس" (cis-regulatory) الخاصة بأنواع الخلايا في الدماغ، مما يتيح التفسير الوظيفي لمواقع خطر مرض باركنسون غير المشفرة.