398 ورقة بحثية
تكشف هذه الدراسة أنه عند التعرض للأشعة فوق البنفسجية، يقوم إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبوزي الثاني وبروتين XPC بإعادة تشكيل الجينوم ثلاثي الأبعاد بنشاط من خلال تقييد عملية بزوغ العُرى لتقصير عُرى الكروماتين وتعزيز النطاقات، مما يخلق حالة تسمح بالإصلاح تسهل عملية استئصال النوكليوتيدات بكفاءة.
تقدم هذه الدراسة أول تجميعات جينومية نووية وميتوكوندرية عالية الاستمرارية وعلى مستوى الكروموسومات لحيوان الهويمل الباتاغوني (*Hippocamelus bisulcus*) المهدد بالانقراض، مما يوفر موارد جينومية أساسية لتعزيز الإدارة الحفظية والبحث التطوري لهذا النوع الرمزي من الأيائل في أمريكا الجنوبية.
تستخدم هذه الدراسة التحليلات الجينومية، والترانسكريبتومية، والنسيجية لسمكة "الوراس المنقطة" في نيوزيلندا للكشف عن أن تغيير الجنس المدفوع اجتماعياً يتضمن التنظيم المنسق لجينات جنسية معروفة ومستحدثة، وإعادة البرمجة فوق الجينية، والموت الخلوي المبرمج بوساطة الالتهاب لتسهيل إعادة تشكيل الغدد التناسلية.
تقدم هذه الدراسة تجميعاً جينومياً عالي الجودة على مستوى الكروموسومات للنمط البيئي "تريمونا" (Tremona) من نوع *Lolium multiflorum* السويسري، وتُقدم أداة قابلة للتوسع تسمى ParaLies لتطهير التكرارات الزائفة الناتجة عن تغاير الزيجوت بفعالية، مما يحسن بشكل كبير من دقة التجميع لهذا النوع المعقد من الأعلاف.
تقدم هذه الورقة MILK، وهو إطار حوسبي قابل للتوسع ينظم مجموعات البيانات الجينومية الضخمة أحادية الخلية في تمثيلات شجرية هرمية موحدة لتمكين أخذ العينات الفرعية بكفاءة، والحفاظ على العلاقات الخلوية متعددة الدقة، وتسهيل التحليلات التكاملية عبر الأنسجة، والمراحل النمائية، والأنواع.
لقد عززت قاعدة بيانات وراثة وجينوم الذرة (MaizeGDB) قدراتها التحليلية من خلال دمج JBrowse2 مع مستعرض بانجينيوم (Pangenome Viewer) جديد، مما يتيح التصور التفاعلي لكل من البانجينيوم الخطي والقائم على الرسم البياني لتسهيل التوصيف الدقيق للتباينات الهيكلية والسمات الزراعية في الذرة.
باستخدام نظام ميثيل ترانسفيراز (DNA methyltransferase) محفز بالنحاس في خلايا *S. pombe* حية، تُظهر هذه الدراسة أن كلاً من الكروماتين الحقيقي (euchromatin) والكروماتين المغاير (heterochromatin) متاحان عالمياً داخل الكائن الحي، مما يكشف أن ميثيلة H3K9 ونظام HP1/Swi6 لا يحدان من إمكانية الوصول إلى الحمض النووي، وأن عدم الإمكانية الملحوظة في النوى المعزولة هي مجرد نتاج اصطناعي لتقارب المسافات بين النيوكليوسومات وليس آلية تثبيط بيولوجية.
تكشف هذه الدراسة الاستطلاعية أن التباين اللوني الواضح داخل مستعمرة واحدة من مرجان الكأس النسيلي مدفوع بزيادة تنظيم موضعية لنسخ بروتينات فلورية متميزة وبروتينات من عائلة EosFP القابلة للتحول الضوئي، وليس بفروق جينية.
تفكك هذه الدراسة جينوم نخيل الزيت الهجين من الجيل الأول عالي التغاير إلى أنماط فردية كاملة للكشف عن كيفية تنسيق إعادة الهيكلة الجينومية المتكاملة، والتدخلات القديمة، والتعبير الأليلي المتوازن للسمات الأبوية المتميزة لدفع قوة الهجين.
تقدم هذه الدراسة أول تجميع للجينوم على مستوى الكروموسوم لفطر *Blumeria graminis* f. sp. *avenae*، كاشفةً أن تخصصه تجاه العائل مدفوع بالتنوع الموضعي لجينات الإمراض ضمن مناطق جينومية ديناميكية بنيوياً وغنية بالعناصر القافزة، بدلاً من إعادة الهيكلة واسعة النطاق للجينوم.