🦠 علم الأحياء الدقيقة

Identifiability of metabolic resilience from sparse longitudinal metabolomics

تُظهر هذه الورقة أنه في حين يمكن للبيانات الأيضية الطولية المتفرقة أن تُنتج كميات ديناميكية قابلة للتقدير عددياً، إلا أنها غالباً ما تفشل في ضمان قابليتها للتمييز العلمي، لا سيما بالنسبة لطبوغرافيات الاستقرار العالمي، مما يؤسس لتسلسل هرمي من القابلية للتمييز يستلزم تصميمات أخذ عينات أكثر كثافة لتجنب تفسير الملاحظات المتفرقة بشكل مفرط كدليل على الديناميكيات الأيضية الكامنة.

Aminian-Dehkordi, J., Mofrad, M.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

InfluProto: Predicting Cross-Species Transmission of Influenza A Virus via Prototype Learning

تقدم الورقة البحثية نموذج InfluProto، وهو نموذج تعلم عميق يستخدم تعلم النماذج الأولية (prototype learning) لتكميم تكيف فيروس الإنفلونزا أ مع المضيف كعملية مستمرة، مما يحقق دقة عالية في التنبؤ بانتقال الفيروس بين الأنواع ويقدم أداة قيمة للمراقبة الوبائية.

Geng, Z., Li, L., Ye, R., Wang, Y., Song, S.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

Cannabinoid receptor 1 activity promotes microbial dysbiosis by stimulating the oxygen-dependent expansion of Enterobacteriaceae

تُظهر هذه الدراسة أن إشارات الإندوكانابينويد عبر مستقبل CB1 تعطل عملية التمثيل الغذائي للمخاطية القولونية والتوازن الأكسجيني، مما يحفز التوسع المعتمد على الأكسجين لعائلة الأمعائيات (Enterobacteriaceae) ويفاقم الالتهاب المعوي.

Mitchell, M. K., Carty, M. A., Snow, N. L., Archambault, M. T., Budsberg, A. E., Carrillo, E. V., Vignieri, E. E., Older (…)2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

Exploring recurrent urinary tract infection: paired microbiota and culture-based profiling reveals stable dysbiosis and multidrug-resistant, virulence-enriched uropathogens

تكشف هذه الدراسة أن التهابات المسالك البولية المتكررة لدى النساء تتميز بحالة من اختلال التوازن الميكروبي المستقر، والتي تتسم بانخفاض التنوع الميكروبي، وفقدان بكتيريا "اللاكتوباسيلوس"، وهيمنة مسببات الأمراض البولية متعددة المقاومة للأدوية والغنية بعوامل الضراوة، والتي تستمر بغض النظر عن حالة العلاج.

Kaushik, S., P, K., Pal, S., Nandi, N., Kiran, G. S., Kumar, S. H. K., Selvin, J., Veettil, V. N., Devi, S.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

A Third-generation Lentiviral Vector System for Flow Virometry-based Analysis of HIV-1 Env and Other Viral Envelope Proteins

تقدم هذه الورقة نظام ناقل فيروسي لنتي (lentiviral vector) من الجيل الثالث يدمج البروتينات الفلورية في بروتين (HIV-1 Gag) متعدد اليتيدات لتمكين تحليل قياس التدفق أحادي الجسيم عالي السلامة البيولوجية لبروتينات الغلاف الفيروسي وتنوعها غير الجيني من خلال التنميط الكاذب المرن.

Busskamp Castro, P. I., Parreuter, J., Brands, C., Perkovic, A.-M., van Bilsen, B., Giebel, B., Bohne, J., Tertel, T., G (…)2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

Assessment of antimicrobial potential of cell-free supernatant from Lacticaseibacillus paracasei SRG isolated from the vaginal microbiota of healthy women against uropathogens

تُظهر هذه الدراسة أن بكتيريا *Lacticaseibacillus paracasei* SRG، المعزولة من الميكروبيوم المهبلي لدى النساء السليمات، تُظهر خصائص بروبيوتيك قوية وتنتج نواتج أيضية مضادة للميكروبات مقاومة للحرارة وللإنزيمات الهاضمة للبروتين ومعتمدة على الرقم الهيدروجيني في مستخلصها الخالي من الخلايا، والتي تثبط بفعالية مسببات أمراض المسالك البولية، مما يسلط الضل على إمكاناتها كمرشح بروبيوتيك جديد لإدارة عدوى المسالك البولية.

Anand, R., Rai, D., Prakash, P., Maurya, G. K.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

Sister species, shared and divergent responses: early transcriptomic profiling of Bursaphelenchus xylophilus exposed to Esteya spp.

تكشف هذه الدراسة أنه على الرغم من تقاربهما في السلالات، فإن الفطريات آكلة النيماتودا من نوعي *Esteya floridanum* و *E. vermicola* تثير استجابات نسخية مبكرة متباينة في نيماتودا خشب الصنوبر *Bursaphelenchus xylophilus* عند ساعة واحدة بعد التلقيح، وتتميز بأنماط متمايزة من التنشيط البروتيني والليزوزومي إلى جانب تثبيط مشترك لمسارات الأيض الخارجي والكربون.

Pires, D., Varela, A. R., Kolarik, M., Inacio, M. L., Mota, M., Vicente, C. S. L.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

Unsupervised decomposition of massively parallel TraDIS-Xpress fitness data from Escherichia coli identifies distinct functional and expression modules of antimicrobial resistance determinants

تطبق هذه الدراسة تحليل المكونات المستقلة (ICA) على مجموعة ضخمة من بيانات لياقة بكتيريا الإشريكية القولونية (Escherichia coli) من نوع TraDIS-Xpress لتفكيك العلاقات المعقدة بين النمط الجيني والنمط الظاهري إلى وحدات وظيفية وتعبيرية متميزة (fxModules)، مما يتيح التحديد الدقيق والمستقل عن التوصيف لآليات المقاومة المعروفة واكتشاف روابط جينية جديدة عبر ظروف إجهاد متنوعة.

Yasir, M., Turner, A. K., Telatin, A., Bastkowski, S., Holden, E. R., Charles, I. G., Webber, M. A.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

A simple platform for in situ DNA-PAINT optimization enables improved multiplexed super-resolution imaging in Gram-negative bacteria

تُنشئ هذه الدراسة منصة فحص قائمة على تقنية (RNA-FISH) لتحسين أزواج الارتباط بين المصور والرسو (imager-docking pairs) لتقنية (DNA-PAINT) بشكل منهجي داخل البكتيريا سالبة الجرام السليمة، مما يتيح تصويراً ثلاثي الأبعاد عالي الجودة ومتعدد الإرسال بدقة فائقة للهياكل البكتيرية وتجمعات الحمض النووي الريبي (RNA).

Andress, K., Koehler, P. S., Xu, R., Schmidt-Heydt, A., Diepold, A., Spahn, C.2026-10-12
🦠 علم الأحياء الدقيقة

Ethnic differences in gut microbiota composition and functional capacity persist over six years in the HELIUS multi-ethnic longitudinal cohort

تكشف دراسة طولية استمرت لست سنوات على مجموعة "هيليوس" (HELIUS) متعددة الأعراق أنه بينما يطرأ على تكوين ميكروبيوم الأمعاء بعض التغيرات الزمنية، فإن الاختلافات العرقية الجوهرية في كل من التركيب الميكروبي والقدرة الوظيفية تظل قائمة في بيئة حضرية مشتركة، مع عمر نصف متوقع لهذه الفوارق يبلغ نحو عقدين من الزمن.

Verhaar, B. J. H., Boulund, U., Herrema, H., Nicolaou, M., Zwinderman, A. H., van den Born, B.-J. H., Hamdiui, N., Elina (…)2026-10-12