🦠 microbiology

BertMS-enabled molecular networking for unknown compounds dereplication

تقدم هذه الورقة BertMS، وهو إطار عمل قائم على تقنية "ترانسفورمر" (transformer) يعمل على تحسين تقدير التشابه الطيفي والتشبيك الجزيئي بشكل كبير لغرض تحديد هوية المركبات غير المعروفة في علم الأيض، وذلك من خلال تعلم تمثيلات سياقية لأيونات الشظايا من بيانات MS/MS واسعة النطاق.

Luning, Z., Shuang, W., Jixing, P., Xiaofei, H., Wenxue, W., Dehai, L.2026-03-19
🦠 microbiology

HAC1 contributes to stress adaptation and virulence in the emerging fungal pathogen Candida auris

تُظهر هذه الدراسة أن منظم استجابة البروتين غير المطوي HAC1 ضروري للتكيف مع الإجهاد والضراوة في فطر *Candida auris*، حيث يسهل عملية الربط غير التقليدي له البقاء تحت إجهاد الشبكة الإندوبلازمية والإجهاد الحراري، بينما يؤدي حذفه إلى تقليل العبء الفطري ووفيات المضيف بشكل كبير في نماذج العدوى.

Oiki, S., Abe, M., Hirasawa, A., Koizumi, A., Otani, A., Shinohara, T., Miyazaki, Y.2026-03-19
🦠 microbiology

Carbon and nitrogen availability affect biofilm growth and morphology of the extremotolerant fungus Knufia petricola

تُظهر الدراسة أن الفطر *Knufia petricola*، وهو فطر يعيش في الصخور ويتحمل الظروف القاسية، يعمل على تعديل نموه وشكله المورفولوجي وتكوين كتلته الحيوية استجابةً لتوافر الكربون والنيتروجين، حيث ينتقل إلى استراتيجية نمو خيطية استكشافية في ظل محدودية المغذيات للكشف عن أنماط عالمية لاستحواذ الفطريات على الموارد.

Dehkohneh, A., Schumacher, J., Cockx, B. J. R., Keil, K., Camenzind, T., Kreft, J.-U., Gorbushina, A. A., Gerrits, R.2026-03-19
🦠 microbiology

Cost and benefits of gene amplification-mediated antibiotic resistance

تُظهر هذه الدراسة أنه في حين أن تضاعف وتضخيم الجينات في بكتيريا *Enterobacter cloacae* يوفر ميزة بقاء تعتمد على الجرعة ضد عقار سيفتازيديم، إلا أنه يفرض تكلفة فسيولوجية على النمو في غياب المضادات الحيوية، ويزيد بشكل متناقض من الحساسية للقتل السريع عند تركيزات أعلى من التركيز المثبط الأدنى، مما يسلط الضاهرة على المقايضات المعتمدة على السياق لهذه الآلية من المقاومة.

Fang, Y., Kupke, J., Steiner, U., Tedin, K., Fulde, M.2026-03-19
🦠 microbiology

Biodegradation of components from an oxidized polyethylene by a Rhodococcus strain isolated from the gut of Atlantic Salmon

تُظهر هذه الدراسة أن بكتيريا *Rhodococcus* sp. ASF-10، وهي نوع من البكتيريا المعزولة من أمعاء سمك السلمون الأطلسي، يمكنها التحلل الحيوي لمشتقات البولي إيثيلين المؤكسدة ذات الوزن الجزيئي المنخفض من خلال مسارات إنزيمية محددة، مما يوفر استراتيجيات محتملة للمعالجة الحيوية المستدامة.

Sandholm, R., Rojas Calderon, D., Hansen, M. T., Chowreddy, R. R., Vaaje-Kolstad, G., La Rosa, S. L.2026-03-19
🦠 microbiology

Efficient plasmid-based rescue of T7 RNA polymerase-driven calicivirus reverse genetics systems in mammalian cells using vaccinia virus RNA capping enzymes

تقدم هذه الورقة نظاماً جديداً وفعالاً للوراثة العكسية القائم على البلازميد لفيروس نوروفيروس الفئران، والذي يستخدم إنزيمات تغليف فيروس فاشنيا (D1R وD12L) وبوليميراز الحمض النووي الريبي T7 لتعزيز عيارات الإنقاذ الفيروسي ووفرة البروتين المتعدد بشكل كبير في الخلايا الثديية، مما يوفر منصة قوية للتحليل عالي الإنتاجية للطفرات الفيروسية.

Buchanan, F. J. T., Loi, M., Chim, C., Zhou, S., Penrice-Randal, R., Neves, L. X., Erdmann, M., Emmott, E.2026-03-19
🦠 microbiology

High specificity meets genomic flexibility in the Siphamia-Photobacterium symbiosis

تُظهر هذه الدراسة أن أسماك السيفون المعتدلة تحافظ على تكافل محدد للغاية مع بكتيريا *Photobacterium mandapamensis* من خلال ترشيح المضيف، حتى في ظل إظهار المتعايشات البكتيرية مرونة جينومية وتنوعاً ظاهرياً كبيراً في التلألؤ البيولوجي.

Osland, H. K., Neff, E., Gaisiner, A., Hays, D., Gould, A. L.2026-03-19
🦠 microbiology

MATRIX: Rapid Quantification of Total and Active Microbial Cells with Single Cell Phenotypes for Environmental Microbiomes

تقدم الورقة البحثية MATRIX، وهو سير عمل عالي الإنتاجية يجمع بين المجهر الآلي، والصبغ الفلوري، والاستدلال البايزي للقياس الكمي السريع والمستدام لكل من الخلايا الميكروبية الكلية والنشطة مع التقاط الأنماط الظاهرية للخلايا المفردة في المجموعات الميكروبية البيئية المتنوعة.

Gonzalo, M., Liu, X., Dufour, Y. S., Shade, A.2026-03-18
🦠 microbiology

Infauna selectively enhance DNA virus diversity and activity in marine sediments

تُظهر هذه الدراسة أن الكائنات الحية التي تعيش داخل الرواسب تعزز بشكل انتقائي وفرة وتنوع والنشاط النسخي لفيروسات الحمض النووي (DNA) من خلال آليات تتوسطها البكتيريا، مما يجعل هذه الكائنات منظماً حاسماً للديناميكيات الفيروسية والدورات البيوجيوكيميائية في النظم البيئية القاعية البحرية.

Fonseca, A., Middelboe, M., Holmfeldt, K., Bell, E., Humborg, C., Norkko, A., Nascimento, F. J. A.2026-03-18
🦠 microbiology

Validation of shoe sole dust as a microbial sampler reveals distinct fungal and bacterial responses to nearby vegetation

تؤكد هذه الدراسة أن غبار نعل الحذاء يعد عينة ميكروبية موثوقة، حيث كشفت أن المجتمعات البكتيرية والفطرية تستجيب للغطاء النباتي بمقاييس مكانية مختلفة، مع ارتباط البكتيريا بالخضرة في المسارات المباشرة والفطريات بالخضرة على نطاق المشهد الطبيعي الأوسع.

Ferdous, S. M., Taimisto, P., Musakka, E., Siponen, T., Täubel, M., Hegarty, B.2026-03-18