The Ground-Truth Problem in Regulatory Genomics: An Empirical Analysis of Reference-Dependent Method Rankings
تُظهر هذه الدراسة أن ترتيب طرق استنتاج شبكة التنظيم الجيني حساس للغاية لاختيار الشبكة المرجعية، مما يكشف أن أكثر من نصف مقارنات الطرق يمكن أن تنعكس اعتماداً على التعريف البيولوجي وتغطية الحقيقة الأرضية، وهو ما يجادل بأن اختيار المرجع يجب أن يُعامل كمتغير تجريبي حاسم وليس كافتراض خلفي ثابت.