🧬 الأحياء

Computational Simulations of Trigger-and-Inhibit Control Rules in Intussusceptive Pillar Morphogenesis

تستخدم هذه الدراسة ديناميكا السوائل الحسابية لتوضيح أن تشكل الأعمدة في عملية التشكيل الداخلي يتم التحكم فيه عبر آلية "التحفيز والتثبيط"، حيث تعمل تدرجات إجهاد القص الجداري الحادة على بدء تكوين الأعمدة بينما يعمل إجهاد القص الجداري المطلق المرتفع على كبحها، مما يجعل التوزيع المكاني لإجهاد القص هو المحرك الأساسي لإعادة تشكيل الأوعية الدموية الدقيقة.

Nenad Filipovic, Akira Tsuda, Jennifer M. Pan, Jae Cho, Hassan A. Khalil, Maximilian Ackermann, Steven J. Mentzer2026-09-18
🧬 الأحياء

Regulatory Evolution of TEM β-lactamases through Large-Scale Genomic Analysis Reveals Promoter Diversity and its Impact on β-lactam Resistance in Escherichia coli

تدمج هذه الدراسة التحليل الجينومي واسع النطاق لأكثر من 60,000 جينوم لبكتيريا الإشريكية القولونية (*Escherichia coli*) مع الاستدلال السببي والنمذجة الهيكلية لتوضيح أن التنوع في منطقة محفز جين *bla*<sub>TEM</sub>، بما يتجاوز الاختلافات في التسلسل المشفر، يؤثر بشكل كبير على أنماط مقاومة البيتا-لاكتام.

Srimathy Ramachandran, Snekha Arumugam Chandran, Suma Mohan S.2026-09-18
🧬 الأحياء

spaGFM is a scalable graph foundation model for spatial transcriptomics analyses

تقدم الورقة البحثية spaGFM، وهو نموذج رسومي أساسي قابل للتوسع يستفيد من المسارات العشوائية والتعلم الخاضع للإشراف الذاتي لتوليد تمثيلات قوية وقابلة للنقل لبيانات النسخ المكاني، مما يتيح تحليل التنظيم النسيجي المعقد والتبعات الوظيفية عبر سياقات بيولوجية متنوعة.

Juexin Wang, Yu Zhong, Fei He, Xiaojie Jin, Yang Yu, Ricardo Melo Ferreira, Andrew Gunderson, Jordan Krull, Guangyu Wang (…)2026-09-18
🧬 الأحياء

Uncovering Anti-Cancer Potential of Clausena anisata Bioactives via Network Pharmacology-Based Target Prediction, Virtual Screening, Docking, ADMET Analysis, and Molecular Dynamics Simulation

تستخدم هذه الدراسة نهجاً متكاملاً لتقنيات الصيدلة الشبكية والحوسبة لتحديد مركبَي الأنيسولاكتون والتريفيزيول المستخلصين من نبات كولاسينا أنيساتا (Clausena anisata) كمركبات رائدة واعدة ومستقرة وذات خصائص دوائية تستهدف مستقبل عامل نمو البشرة (EGFR) لعلاج محتمل للسرطان.

Priyanka Nath Mazumdar, Kaushik Kalita, Partha Pratim Dutta, Dhrubajyoti Gogoi, Nikhita Nina Bora, Manash Pratim Sarma2026-09-18
🧬 الأحياء

Rethinking aerobic glucose metabolism in Saccharomyces cerevisiae: is glucose completely fermented to ethanol at high concentrations?

تتحدى هذه الورقة الرؤية التقليدية التي تفترض أن عملية التمثيل الغذائي الهوائي للجلوكوز في خميرة *Saccharomyces cerevisiae* تتضمن تنفساً وتخمراً مباشرين متزامنين عند التركيزات العالية من الجلوكوز، مقترحةً بدلاً من ذلك أن الجلوكوز يتم تخميره بالكامل أولاً إلى إيثانول مع أكسدة لاحقة للإيثانول، وتحدد تصميماً تجريبياً لتتبع النظائر كمياً لاختبار هذه الفرضية.

David Barreras Martínez2026-09-18
🧬 الأحياء

An Immuno-informatics Pipeline for Identification of Low-Risk Peptide Immunotherapy Candidates Across the Childhood Food Allergy Triad

تقدم هذه الدراسة مساراً متكاملاً للمعلوماتية المناعية نجح في تحديد 23 مرشحاً من الببتيدات منخفضة المخاطر للعلاج المناعي عبر مسببات الحساسية الموجودة في الفول السوداني والحليب والبيض، وذلك عبر إعطاء الأولوية حاسوبياً للتسلسلات ذات الارتباط المنخفض بـ HLA والقدرة التحسسية المنخفضة، مع التحقق من صحة هذا النهج مقابل المرشحين السريريين الحاليين وتسليط الضوء على ضرورة التحقق التجريبي.

Aditya Narayan, Ruchi Jain, Manish Kumar2026-09-18
🧬 الأحياء

CAST as a Tumor-Specific Suppressor in Colorectal Cancer: Discovery Through Integrative Analysis of Unannotated Isoforms, Proteomics, and Epigenetic Regulation

من خلال تحليل تكاملي لتسلسل القراءة الطويلة أحادي الخلية، والبروتيوميات، والبيانات فوق الجينية، تحدد هذه الدراسة CAST ككابح نوعي للأورام في سرطان القولون والمستقيم يتم تنشيطه مجددًا عبر إزالة ميثيل المحفز وينظمه عائلة miR-200، مما يؤسس لإطار عمل قابل للتعميم لاكتشاف الأهداف العلاجية من الأشكال المتعددة غير المشروحة.

alireza ebadi, Maryam Hashemi2026-09-18
🧬 الأحياء

Molecular Targeting of UBR2 in Melasma Using Natural Compounds from Scutellaria baicalensis through Integrated Computational Approaches

تستخدم هذه الدراسة نهجاً حوسبياً متكاملاً لتحديد حمض الفيروليك وسكولافلون II من نبات *Scutellaria baicalensis* كمركبات واعدة وآمنة ومستقرة لتثبيط هدف UBR2، وذلك لعلاج محتمل للكلف.

Akhtar Veg, Faria Saleem, Romana Ishrat2026-09-18
🧬 الأحياء

A Computational Cancer GWAS Screen Highlights Structural Variation at the 7q22.1 Locus Near STAG3

تُظهر هذه الدراسة أن فحصاً حوسبياً يدمج بيانات تسلسل القراءة القصيرة والقراءة الطويلة يكشف عن إثراء كبير للمتغيرات الهيكلية عند مواقع الجينات النوعية لعملية الانقسام المنصف التي تتداخل مع إشارات دراسات الارتباط الجينومي الكامل للسرطان، وتحديد حذف جديد بطول 442 زوجاً من القواعد النيتروجينية بالقرب من جين *STAG3* كمرشح محتمل كمحرك عند موضع القابلية للإصابة بسرطان القولون والمستقيم 7q22.1، وهو ما كان سيُفقد لو استُخدم تسلسل القراءة القصيرة بمفرده.

Koushik Chowdhury2026-09-18
🧬 الأحياء

The Changing Landscape of Genetic Risk: Age-Related Effects of Polygenic Scores for Suicidal Behaviors

تكشف هذه الدراسة لمتتابعة "Add Health" أن درجات المخاطر متعددة الجينات للأفكار الانتحارية والمحاولات تظهر ارتباطات متواضعة ولكنها معنوية مع النتائج فقط في مرحلة الشباب وبداية منتصف العمر، وليس في مرحلة المراهقة، مما يشير إلى أن النماذج الحالية للمخاطر الجينية القائمة على بيانات البالغين قد لا تستوعب المخاطر المرتبطة بمراحل نمو محددة، ويسلط الضوء على الحاجة إلى دراسات الارتباط الكامل للجينوم مقسمة حسب العمر لتحسين استراتيجيات الوقاية المستهدفة.

Nathan Gillespie, Severine Lannoy, Mallory Stephenson, Robert Kirkpatrick, Zuriel Ceja, Miguel Renteria, Alexis C. Edwar (…)2026-09-17