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1197 Arbeiten

Die Bioinformatik verbindet Biologie und Informatik, um riesige Mengen an biologischen Daten verständlich zu machen. Statt sich nur auf einzelne Experimente zu konzentrieren, nutzen Forscher hier computergestützte Methoden, um Muster im Leben selbst zu entschlüsseln, von der DNA bis zu komplexen Krankheitsverläufen. Diese Schnittstelle ermöglicht es, die Sprache des Lebens in Zahlen und Algorithmen zu übersetzen und neue Erkenntnisse schnell zu gewinnen.

Auf Gist.Science durchsuchen wir täglich die neuesten Vorab-Veröffentlichungen auf bioRxiv in diesem Bereich. Für jedes neu eingereichte Preprint erstellen wir nicht nur eine detaillierte technische Zusammenfassung für Fachleute, sondern auch eine einfache Erklärung in Alltagssprache, damit jeder den Kern der Forschung verstehen kann. So wird komplexes Wissen für ein breites Publikum zugänglich, ohne dass wichtige Details verloren gehen.

Unten finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Bioinformatik, die wir kürzlich für Sie aufbereitet haben.

💻 Bioinformatik

Genome-wide computational prediction of miRNAs encoded by influenza A virus (H3N2) predicts target genes involved in pulmonary and antiviral innate immunity

Diese Studie nutzt eine genomweite computergestützte Pipeline zur Vorhersage von miRNAs und ihren Zielgenen, die vom Influenza-A-Virus (H3N2) kodiert werden, und enthüllt ein Netzwerk von Wirtsgenen, die an der pulmonalen und antiviralen angeborenen Immunität beteiligt sind, was die virale Pathogenese klären und therapeutische Angriffspunkte aufzeigen könnte.

Siddiqi, M. A., Kumar, H., Mazumder, M.2026-05-18
💻 Bioinformatik

KaryoScope: rapid, alignment-free sequence annotation for the pangenome era

KaryoScope ist ein schnelles, ausrichtungsunabhängiges Werkzeug, das eine Basen-auflösende Annotation diverser genomischer Merkmale über gesamte Pangenom-Assemblierungen hinweg in Minuten ermöglicht, indem es zuvor unzugängliche variable Regionen wie Zentromere und Subtelomere effektiv charakterisiert, um vergleichende und klinische Analysen zu unterstützen.

Ranallo-Benavidez, T. R., Chen, Y.-A., Potapova, T. A., Alanko, J. N., Loucks, H., Lucas, J., Human Pangenome Reference (…)2026-05-17
💻 Bioinformatik

Hidden State Genomics: Graph-Based Analysis of Sparse Auto-Encoder Feature Activity in Genomic Language Models

Diese Studie nutzt sparse Autoencoder und graphbasierte Analysen, um aufzuzeigen, dass das genomische Sprachmodell Nucleotide Transformer v2 granulare Sequenzsyntax und lokale biophysikalische Einschränkungen kodiert, anstatt komplexe regulatorische Logik, was seine starke Leistung bei spezifischen molekularen Aufgaben, aber schwächere Fähigkeiten bei umfassenderen regulatorischen Inferenzen erklärt.

Kmiec, E., O'Brien, S., McCoy, M.2026-05-16
💻 Bioinformatik

TAMIPAMI: Software and methods for PAM/TAM identification for CRISPR and OMEGA gene editing systems

Dieser Artikel stellt TAMIPAMI vor, ein straffes experimentelles und computergestütztes Framework, das die Identifizierung von PAM/TAM für CRISPR- und OMEGA-Systeme vereinfacht, indem es nur eine einzige Kontrollbibliothek erfordert, einen neuartigen Algorithmus zur Definition minimaler degenerierter Motive nutzt und zugängliche Web- und Befehlszeilentools für eine schnelle Charakterisierung bietet.

Orosco, C., Jain, P. K., Rivers, A. R.2026-05-16
💻 Bioinformatik

PrEditR: A protein-centric platform for CRISPR-mediated base editor sgRNA design

PrEditR ist ein quelloffenes, proteinzentriertes Werkzeug, das darauf ausgelegt ist, die Einschränkungen bestehender DNA-zentrierter sgRNA-Design-Software zu überwinden, indem es die hochdurchsatzfähige, massenspektrometrikompatible Generierung von Guide-RNAs für CRISPR-Baseneditor-Screens ermöglicht, die spezifische Protein-Post-Translations-Modifikationsstellen anvisieren.

Myers, S. A., Vasquez Castro, F., Sanchez Solis, L. D.2026-05-16
💻 Bioinformatik

BTEXgenie: A curated and user-friendly tool for profile HMM-based substrate-specific annotation of BTEX degradation genes

BTEXgenie ist ein kuratiertes, benutzerfreundliches Werkzeug, das maßgeschneiderte Profil-Versteckte-Markov-Modelle nutzt, um im Vergleich zu bestehenden Datenbanken eine deutlich höhere Sensitivität bei der Detektion substratspezifischer Gene zu erreichen, die am aeroben und anaeroben BTEX-Abbau beteiligt sind, und gleichzeitig integrierte Pfad- und Genomvisualisierungen für umweltbezogene und vergleichende Genomstudien bereitstellt.

Qu, J., Garber, A. I., Armbruster, C. R.2026-05-15
💻 Bioinformatik

TDP-43 regulates chromatin looping and gene transcription through binding and stabilizing DNA G-quadruplex structures

Diese Studie zeigt, dass TDP-43 die Gen-Transkription reguliert und langreichweitige Chromatin-Schleifenbildung fördert, indem es an DNA-G-Quadruplex-Strukturen an Chromatin-Schleifenankern bindet und diese stabilisiert, wodurch eine mechanistische Erklärung für die Gen-Dysregulation bei mit TDP-43-Funktionsstörung assoziierten Erkrankungen geliefert wird.

Yang, F., Zhang, S., Guo, X., Qiao, Y., Zhang, Y., Sun, H., Chen, X., Wang, H.2026-05-15
💻 Bioinformatik

A modular Bayesian framework for inferring transmission networks from polyclonal infections, with application to Plasmodium falciparum

Dieser Beitrag stellt ein modulares bayessches Rahmenwerk vor, exemplifiziert durch die Plasmotrack-Software für *Plasmodium falciparum*, das gerichtete Übertragungsnetzwerke aus polyklonalen Infektionen rekonstruiert, indem es multiple genetische Quellen und nicht beobachtete Eltern berücksichtigt, um zentrale Public-Health-Metriken zu schätzen.

Murphy, M. R., Nielsen, R., Perkins, A., Greenhouse, B.2026-05-15