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bioinformatics

1197 Arbeiten

Die Bioinformatik verbindet Biologie und Informatik, um riesige Mengen an biologischen Daten verständlich zu machen. Statt sich nur auf einzelne Experimente zu konzentrieren, nutzen Forscher hier computergestützte Methoden, um Muster im Leben selbst zu entschlüsseln, von der DNA bis zu komplexen Krankheitsverläufen. Diese Schnittstelle ermöglicht es, die Sprache des Lebens in Zahlen und Algorithmen zu übersetzen und neue Erkenntnisse schnell zu gewinnen.

Auf Gist.Science durchsuchen wir täglich die neuesten Vorab-Veröffentlichungen auf bioRxiv in diesem Bereich. Für jedes neu eingereichte Preprint erstellen wir nicht nur eine detaillierte technische Zusammenfassung für Fachleute, sondern auch eine einfache Erklärung in Alltagssprache, damit jeder den Kern der Forschung verstehen kann. So wird komplexes Wissen für ein breites Publikum zugänglich, ohne dass wichtige Details verloren gehen.

Unten finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Bioinformatik, die wir kürzlich für Sie aufbereitet haben.

💻 Bioinformatik

CROssBARv2: A Unified Computational Framework for Heterogeneous Biomedical Data Representation and LLM-Driven Exploration

Das Paper stellt CROssBARv2 vor, eine skalierbare Plattform, die heterogene biomedizinische Daten in einem einheitlichen Wissensgraphen mit standardisierten Ontologien und Vektor-Embeddings integriert, um durch eine hallucinationsreduzierte LLM-Schnittstelle und maschinelles Lernen die Datenexploration, Hypothesengenerierung und translationalen Forschung zu erleichtern.

Sen, B., Ulusoy, E., Darcan, M., Ergun, M., Lobentanzer, S., Rifaioglu, A. S., Turei, D., Saez-Rodriguez, J., Dogan, T.2026-04-15
💻 Bioinformatik

Discovery of Selective Nrf2 Activators from Natural Products: AComputational Screening Approach to Minimize Off-Target Effects on PXR and CYP2D6

Diese Studie stellt eine computergestützte Screening-Methode vor, die aus fast 630.000 Naturstoffen hochselektive Nrf2-Aktivatoren identifiziert, die durch eine gezielte Minimierung unerwünschter Wechselwirkungen mit PXR und CYP2D6 die Entwicklung sicherer Therapien gegen oxidativen Stress ermöglichen.

Wang, Y., Gong, Y., Li, R., Li, Z., Cai, H., Fan, L., Ma, H.2026-04-15
💻 Bioinformatik

Benchmarking precision matrix estimation methods for differential co-expression network analysis

Diese Studie führt ein umfassendes Benchmarking verschiedener Methoden zur Schätzung von Präzisionsmatrizen durch, um deren Leistung bei der Analyse differentialer Ko-Expressionsnetzwerke unter unterschiedlichen Simulationsbedingungen zu bewerten und dabei festzustellen, dass zwar GLassoElnetFast die höchste Genauigkeit aufweist, jedoch keine einzelne Methode unter allen Bedingungen optimal ist.

Overmann, M., Grabert, G., Kacprowski, T.2026-04-15
💻 Bioinformatik

Beyond Structure and Affinity: Context-Dependent Signals for de novo Binder Success

Die Studie zeigt, dass die Integration biologisch informierter Sequenzmerkmale, die über reine Struktur- und Affinitätsbewertungen hinausgehen, die Erfolgsvorhersage beim de-novo-Design von Proteinbindern erheblich verbessert, indem sie kontextabhängige Signale für Expression und Bindung identifiziert und so die Trefferquote bei der Vorauswahl potenzieller Kandidaten signifikant steigert.

Bozkurt, C.2026-04-15
💻 Bioinformatik

Decoding Single-Cell Omics of Perturbation Responses Using DeSCOPE

Die Studie stellt DeSCOPE vor, ein leichtgewichtiges Framework auf Basis eines konditionalen Variational Autoencoders, das die Vorhersage von Reaktionen auf genetische Perturbationen in verschiedenen Omics-Datenlandschaften verbessert und dabei besonders bei nicht gesehenen Genen, Zelltypen und kombinatorischen Perturbationen überlegene Leistung zeigt.

Wu, P., Wei, H., Li, Y., Zheng, X., Zhou, C., Hu, X., Wang, C.2026-04-15
💻 Bioinformatik

Differential co-localisation analysis of multi-sample and multi-condition experiments with spatialFDA

Das Open-Source-Paket spatialFDA kombiniert räumliche Statistik mit funktionaler Datenanalyse, um in räumlichen Omics-Daten differenzielle zelluläre Kollokalisationen über mehrere Bedingungen hinweg präzise zu quantifizieren und zu testen, was durch Simulationen sowie Anwendungen auf Typ-1-Diabetes-Daten validiert wurde.

Emons, M., Scheipl, F., Gunz, S., Purdom, E., Robinson, M. D.2026-04-15
💻 Bioinformatik

Predicting Antibody Self-Association with Sequence Structure Fusion Models: The Central Role of CSI-BLI in Early Developability Screening

Die Studie stellt einen interpretierbaren, end-to-end Rahmen vor, der Protein-Sprachmodelle mit AlphaFold-basierten Strukturdaten fusioniert, um die Selbstassoziation von Antikörpern mittels des CSI-BLI-Assays für das frühe Entwickelbarkeits-Screening präzise vorherzusagen.

Ahmed, S., Devalle, F., Leisen, L., Pham, T., Amofah, B., Lee, A., Hutchinson, M., Chakiath, C., DiChiara, J., Farzandh (…)2026-04-15
💻 Bioinformatik

Testing and Estimating Causal Treatment Effect Heterogeneity in Observational Studies via Revised Deep Semiparametric Regression: A Lung Transplant Case Study

Diese Studie entwickelt das Framework deepHTL, um in einer großen Lungentransplantations-Registerdatenanalyse nachzuweisen, dass der Nutzen einer bilateralen gegenüber einer einseitigen Lungentransplantation stark von Patienteneigenschaften abhängt, wobei jüngere und risikoärmere Empfänger den größten Vorteil haben.

Yuan, S., Zou, F., Zou, B.2026-04-15
💻 Bioinformatik

From Movement to METs: A Validation of ActTrust(R) for Energy Expenditure Estimation and Physical Activity Classification in Young Adults

Diese Studie validiert das ActTrust(R)-Gerät als kosteneffektive Alternative zum ActiGraph GT3X+ zur Schätzung des Energieverbrauchs und zur Klassifizierung der körperlichen Aktivitätsintensität bei jungen Erwachsenen durch die Entwicklung und Überprüfung linearer Modelle und Schwellenwerte.

dos Santos Batista, E., Basilio Gomes, S. R., Bruno de Morais Ferreira, A., Franca, L. G. S., Fontenele Araujo, J., Mort (…)2026-04-14