⚛️ biophysics

Learning Continuous Morphological Trajectories via Latent Principal Curves

यह शोधपत्र MorphCurveVAE को प्रस्तुत करता है, जो एक दो-चरणीय डीप लर्निंग फ्रेमवर्क है जो मल्टी-ब्रांच वेरिएशनल ऑटो-एनकोडर और टोपोलॉजिकल-अवेयर प्रिंसिपल कर्व्स का उपयोग करके स्थिर माइक्रोस्कोपी स्नैपशॉट्स से निरंतर, जैविक रूप से सुसंगत 3D रूपात्मक प्रक्षेपवक्र (morphological trajectories) को पुनर्गठित करता है, जो समय-समाधान डेटा की आवश्यकता के बिना माइटोसिस जैसी गतिशील कोशिकीय प्रक्रियाओं को प्रभावी ढंग से मॉडल करता है।

Magana, S., Zhao, W., Dao Duc, K.2026-03-18
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A Computational Framework for Pulmonary Assessing Wave Intensity Following Simulated Lung Resection

यह अध्ययन एक ऐसे कम्प्यूटेशनल ढांचे को प्रस्तुत करता है जो धमनी नेटवर्क के परिवर्तनों को मॉडल करके फेफड़े के रिसेक्शन (lung resection) के बाद पल्मोनरी वेव इंटेंसिटी और प्रवाह पुनर्वितरण में हेमोडायनामिक परिवर्तनों का सफलतापूर्वक अनुकरण करता है, जिसके परिणाम नैदानिक डेटा के साथ मजबूत सहमति दिखाते हैं और भविष्य के रोगी-विशिष्ट अनुप्रयोगों के लिए मॉडल की क्षमता को प्रमाणित करते हैं।

Mackenzie, J. A., Hill, N. A.2026-03-18
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Protein disorder controls allostery in DNA

यह अध्ययन प्रकट करता है कि ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर ComK का अंतर्निहित अव्यवस्थित क्षेत्र (IDR), प्रोटीन बाइंडिंग के बजाय, एलोस्टेरी को सक्षम करने के लिए लंबी दूरी के DNA उतार-चढ़ाव को बढ़ाता है, जबकि इसे हटाने से DNA कठोर हो जाता है और ट्रांसक्रिप्शनल कार्य समाप्त हो जाता है।

Rosenblum, G., Terterov, I., Mishra, S. K., Elad, N., Gianga, T.-M., Hussain, R., Siligardi, G., Hofmann, H.2026-03-18
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Kinetic proofreading as a mechanism for transcriptional specificity in living human cells

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जीवित मानव कोशिकाओं में, ट्रांसक्रिप्शनल विशिष्टता एक ऊर्जा-निर्भर काइनेटिक प्रूफरीडिंग तंत्र के माध्यम से प्राप्त की जाती है जहाँ प्रमोटर 'ड्वेल-टाइम डिटेक्टर' के रूप में कार्य करते हैं, जो ग्लुकोकॉर्टिकॉइड रिसेप्टर को नेडाइलेशन और क्रोमैटिन रीमॉडलिंग जैसी ATP-संचालित प्रक्रियाओं के माध्यम से विशिष्ट और गैर-विशिष्ट बाइंडिंग साइटों के बीच अंतर करने की अनुमति देता है।

Kim, J. M., Ball, D. A., Johnson, T. A., DInzeo, C., Cho, H. J., Ozbun, L., Karpova, T. S., Pegoraro, G., Larson, D. R.2026-03-18
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Quantitative Mapping of Sulfation, Iduronic Acid, and Secondary Structure in Glycosaminoglycans

यह अध्ययन यह प्रदर्शित करने के लिए बड़े पैमाने पर आणविक गतिशीलता (मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स) सिमुलेशन का उपयोग करता है कि GAG हेलिकल संरचनाएं विशिष्ट सल्फेशन पैटर्न के माध्यम से L-इडुरोनिक एसिड स्थिरीकरण द्वारा संचालित होती हैं और इन द्वितीयक संरचनाओं को वस्तुनिष्ठ रूप से वर्गीकृत करने के लिए एक मात्रात्मक दो-पैरामीटर मीट्रिक प्रस्तुत करता है।

Riopedre-Fernandez, M., Biriukov, D., Martinez-Seara, H.2026-03-18
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Functional coupling between ribosomal RNA transcription and processing guided by stable transcription factor binding

मल्टी-कलर सिंगल-मॉलिक्यूल फ्लोरोसेंस माइक्रोस्कोपी का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि सुहबी (SuhB) की भर्ती द्वारा संचालित, rrnTAC कॉम्प्लेक्स का मिनटों तक चलने वाला स्थिर संयोजन, RNAP पॉज़िंग को कम करने और को-ट्रांस्क्रिप्शनल rRNA प्रोसेसिंग को बढ़ाने के लिए आवश्यक है, जो mRNA ट्रांसक्रिप्शन की विशिष्ट क्षणिक अंतःक्रियाओं से rRNA ट्रांसक्रिप्शन की कार्यात्मक गतिशीलता को अलग करता है।

Chaban, A., Qureshi, N. S., Duss, O.2026-03-18
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PSF-Driven Spatio-Temporal Blending in Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy and Its Mitigation via Mean-Shift Super-Resolution-Based Masking.

यह शोध पत्र एक गणनात्मक रूप से कुशल वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है जो फ्लोरेसेंस लाइफटाइम इमेजिंग माइक्रोस्कोपी (FLIM) में PSF-जनित स्थानिक-कालिक सिग्नल मिश्रण को प्रभावी ढंग से कम करने और अंतर्निहित टेम्पोरल डिके काइनेटिक्स को बदले बिना सटीक लाइफटाइम सिग्नेचर को बहाल करने के लिए इंटेंसिटी-आधारित स्थानिक मास्क उत्पन्न करने हेतु मीन-शिफ्ट सुपर-रिज़ॉल्यूशन (MSSR) का उपयोग करता है।

Gonzalez-Gutierrez, M., Vazquez-Enciso, D. M., Mateos, N., Hwang, W., Torres-Garcia, E., Hernandez, H. O., Chacko, J. V. (…)2026-03-18
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Structural mechanisms of pump assembly and drug transport in the AcrAB-TolC efflux system

यह अध्ययन नेटिव *E. coli* एफ्लक्स कॉम्प्लेक्स के उच्च-रिज़ॉल्यूशन वाले क्रायो-ईएम (cryo-EM) संरचनाओं को प्रस्तुत करता है जो यह प्रकट करते हैं कि पूर्व में अज्ञात लिपोप्रोटीन YbjP, TolC को बाहरी झिल्ली (outer membrane) से जोड़ने वाले एक महत्वपूर्ण संरचनात्मक घटक के रूप में कार्य करता है और पूर्ण ड्रग ट्रांसपोर्ट चक्र के दौरान होने वाले संरचनात्मक परिवर्तनों को समायोजित करता है।

Ge, X., Gu, Z., Wang, J.2026-03-17
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A predictive mechanochemical modeling framework for the deformation and remodeling of the nuclear lamina

यह अध्ययन एक भविष्य कहनेवाला मैकेनोकेमिकल मॉडलिंग ढांचा प्रस्तुत करता है जो यह सिम्युलेट करता है कि नैनोपिलर सबस्ट्रेट्स द्वारा प्रेरित परमाणु विरूपण (न्यूक्लियर डिफॉर्मेशन) लैमिन रीमॉडलिंग और न्यूक्लियोसाइटोप्लाज्मिक ट्रांसपोर्ट को कैसे प्रभावित करता है, जिससे यह पता चलता है कि विशिष्ट नैनोटोपोग्राफियां एनवेलप तनाव को अधिकतम करती हैं और लैमिन की कमी फटने के जोखिम को महत्वपूर्ण रूप से बढ़ा देती है, एक ऐसा निष्कर्ष जिसे बाद में प्रयोगात्मक रूप से मान्य किया गया।

Francis, E. A., Sarikhani, E., Naghsh-Nilchi, H., Jahed, Z., Rangamani, P.2026-03-17
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Real-Time Visualization of G2L4 Reverse Transcriptase in DNA Repair via Microhomology-Mediated End Joining

हाई-स्पीड एटॉमिक फोर्स माइक्रोस्कोपी का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन उस वास्तविक समय की प्रक्रिया को प्रकट करता है जिसके द्वारा G2L4 रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेज डाइमर, डीएनए बाइंडिंग, गैप फिलिंग और टर्मिनल ट्रांसफरेज़ गतिविधि के माध्यम से माइक्रोहोमोलॉजी-मीडिएटेड एंड जॉइनिंग को सुगम बनाते हैं, जबकि T4 डीएनए लाइगेज निक्स को सील करके और ऑफ-पाथवे ब्रांचिंग को दबाकर मरम्मत किए गए उत्पादों को स्थिर करता है।

Zhang, P., Guo, M., Zhang, Y. J., Lambowitz, A. M., Lin, Y.-C.2026-03-17