physics.bio-ph पेपर

Equilibrium cluster statistics of cooperative and anticooperative binding on finite one-dimensional rings

यह शोध पत्र परिमित एक-आयामी वलयों (one-dimensional rings) पर सहयोगात्मक और प्रति-सहयोगात्मक बंधन में साम्यावस्था क्लस्टर सांख्यिकी (equilibrium cluster statistics) के लक्षण वर्णन के लिए सटीक परिमित-आकार अभिव्यक्ति और एक स्केलेबल कॉम्बिनेटोरियल ढांचा प्रस्तुत करता है, जो जैविक असेंबली से संबंधित छोटे आवधिक प्रणालियों में स्थानिक संगठन को समझने के लिए नए बेंचमार्क प्रदान करता है।

Thomas Alfonsi, Jérôme Dorignac, John Palmeri, Nils-Ole Walliser2026-06-17

🔬 condensed matter

Delayed excitations induce polymer looping and coherent motion

यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि समयबद्ध रूप से पैटर्न वाले सक्रिय प्रक्रियाओं द्वारा संचालित विषमांगी बहुलक (inhomogeneous polymers), दूरस्थ लोकी (loci) के तनाव-मध्यस्थ युग्मन के माध्यम से विशिष्ट विन्यास और सुदृढ़ संकुचन प्राप्त कर सकते हैं, जहाँ विलंबित उत्तेजनाएं सुसंगत गति और फोल्डिंग को प्रेरित करती हैं।

Andriy Goychuk, Deepti Kannan, Mehran Kardar2026-06-16

🔬 physics

Hierarchical Autocatalytic Systems as a Bridge between Maximum Entropy Production and Bayesian Posterior Contraction: A Numerical Study with Stochastic-Thermodynamic Bounds

यह शोध पत्र एक त्रि-स्तरीय स्टोकेस्टिक ऑटोकैटलिटिक प्रणाली का एक संख्यात्मक अध्ययन प्रस्तुत करता है जो यह प्रदर्शित करता है कि पदानुक्रमित संगठन अधिकतम एंट्रॉपी उत्पादन और जेनेटिक एंट्रॉपी में कमी को संचालित करता है, जबकि न्यूनतम मॉडलों की तुलना में काफी ढीले थर्मोडायनामिक अनिश्चितता और स्पीड लिमिट बाउंड्स प्रदर्शित करता है, जो अंततः ऐसे विकासवादी गतिकी और डिफ्यूजन-मॉडल प्रशिक्षण के बीच एक औपचारिक पत्राचार स्थापित करता है।

Yoshinori Watanabe2026-06-16

🔬 physics

Beyond the planktonic MIC: imaging biofilm-antimicrobial encounters

यह शोध पत्र तर्क देता है कि मानक प्लैंकटोनिक रोगाणुरोधी परीक्षण (antimicrobial assays) क्रोनिक बायोफिल्म संक्रमणों की जटिल, गहराई-स्तरीकृत गतिशीलता को पकड़ने में विफल रहते हैं और परिपक्व बायोफिल्म के भीतर रोगाणुरोधी प्रभावकारिता का बेहतर मूल्यांकन करने के लिए एक नए चार-आयामी, लाइव, लेबल-मुक्त इमेजिंग ढांचे का प्रस्ताव देता है।

Seongsoo Lee, YongKeun Park2026-06-16

🔬 physics

Delving into the Catalytic Mechanism of Molybdenum Cofactors: A Novel Coupled Cluster Study

यह अध्ययन DMSO और NO $_3^-$ सबस्ट्रेट्स के साथ मोलिब्डेनम कोफैक्टर (Moco) वेरिएंट के उत्प्रेरक तंत्र को मॉडल करने के लिए पेयर कपल्ड क्लस्टर डबल्स (pCCD) वेरिएंट सहित आधुनिक कपल्ड-क्लस्टर विधियों का उपयोग करता है, जो अभिक्रिया ऊर्जा विज्ञान (reaction energetics) और बंध निर्माण को स्पष्ट करने में संरचनात्मक विश्राम (structural relaxation), पर्यावरणीय प्रभावों और कक्षक-आधारित क्वांटम सूचना की महत्वपूर्ण भूमिकाओं को प्रकट करता है।

Marta Gałyńska, Matheus Morato F. de Moraes, Paweł Tecmer, Katharina Boguslawski2026-06-15

🧬 biology

Temperature transferable Machine Learned Coarse Grained model for proteins

यह शोध पत्र प्रोटीनों के लिए एक ऊष्मागतिकीय रूप से सूचित, तापमान-स्थानांतरणीय मशीन-लर्नड कोर्स-ग्रेन्ड ढांचे को प्रस्तुत करता है जो स्पष्ट रूप से औसत बल की क्षमता (पोटेंशियल ऑफ मीन फोर्स) को ऊर्जावान और एंट्रॉपी घटकों में विभाजित करता है, जिससे बिना पुन: प्रशिक्षण के विभिन्न थर्मल रिजीमों में ऊष्मा क्षमता जैसी तापमान-निर्भर विशेषताओं का सटीक पूर्वानुमान संभव हो पाता है।

Jacopo Venturin, Cecilia Clementi2026-06-15

🧬 biology

Measurement-limited learning of conformational heterogeneity in cryo-electron microscopy

यह शोधपत्र एक सूचना-सैद्धांतिक ढांचे को प्रस्तुत करता है जो एन्सेम्बल भार (ensemble weights) और छवियों के बीच पारस्परिक सूचना (mutual information) को अधिकतम करके क्रायो-इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी में प्रतिनिधि विन्यासों (conformations) के चयन को अनुकूलित करता है, जिससे एक मापन-प्रेरित स्थूल-कणिकीकरण (measurement-induced coarse-graining) को परिभाषित किया जाता है जो शोर की उपस्थिति में संरचनात्मक रिज़ॉल्यूशन और सांख्यिकीय पहचान क्षमता के बीच संतुलन बनाता है।

Henry H. Mattingly, Luke Evans, Pilar Cossio2026-06-15

🧬 biology

Implications of hierarchical Markov models of behavior: on irreversibility, predictability, and dimensionality

यह शोध पत्र पशु व्यवहार का वर्णन करने के लिए पदानुक्रमित मार्कोव मॉडल (hierarchical Markov models) के उपयोग के सैद्धांतिक निहितार्थों का अन्वेषण करता है, यह प्रदर्शित करते हुए कि कैसे इन मॉडलों के आइजनमान (eigenvalues) और आइजनवेक्टर्स (eigenvectors) व्यवहार की क्रम-समान प्रकृति, पूर्वानुमान क्षमता और प्रभावी आयामीता को स्पष्ट करने के लिए व्याख्यात्मक समय पैमाने और संशोधन प्रदान करते हैं।

John J. Vastola, Kanaka Rajan2026-06-15

🧬 biology

Bioelectrical interfaces beyond excitable cells: cancer, aging, and gene expression modulation

यह शोधपत्र इंजीनियरिंग और जीव विज्ञान के बीच के अंतर को पाटते हुए यह अन्वेषण करता है कि कैसे उन्नत बायोइलेक्ट्रिकल इंटरफेस का उपयोग गैर-उत्तेजक कोशिकाओं (non-excitable cells) में अंतर्जात विद्युत संकेतों के अध्ययन और हेरफेर के लिए किया जा सकता है, जो जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करने, कैंसर को पुनर्गठित करने और उम्र बढ़ने की प्रक्रिया में हस्तक्षेप करने के नए मार्ग प्रस्तुत करता है।

Paolo Cadinu, Matthew Burgess, Catarina Franco Jones, Marzia Iarossi, Manuel Schröter, Nako Nakatsuka, Mustafa B. A. Dja (…)2026-06-12

🧬 biology

Intermediate State Formation of Topologically Associated Chromatin Domains using Quantum Annealing

यह शोधपत्र प्रदर्शित करता है कि क्वांटम एनीलिंग क्रोमैटिन के एपिजेनेटिक आइसिंग मॉडल को प्रभावी ढंग से सैंपल कर सकती है ताकि सांख्यिकीय विशेषताओं को पुनरुत्पादित किया जा सके और टोपोलॉजिकली एसोसिएटिंग डोमेन (TAD)-जैसे संरचनात्मक रूपांकनों को प्रदर्शित करने वाले विन्यास उत्पन्न किए जा सकें, जो 1D एपिजेनेटिक परिदृश्यों को 3D क्रोमैटिन फोल्डिंग से जोड़ने वाले तंत्रों की खोज के लिए शास्त्रीय विधियों के एक आशाजनक विकल्प की पेशकश करता है।

Tobias Kempe, S. M. Ali Tabei, Mohammad H. Ansari2026-06-12

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