152 पेपर
यह शोध पत्र एडेप्टिव प्रोटीन टोकनाइजेशन (Adaptive Protein Tokenization) प्रस्तुत करता है, जो एक वैश्विक टोकनाइजेशन विधि है जो प्रोटीन निरूपणों में क्रमिक रूप से विवरण जोड़कर मौजूदा स्थानीय दृष्टिकोणों की सीमाओं को दूर करती है, जिससे जनरेटिव, पुनर्निर्माण और वर्गीकरण कार्यों में प्रदर्शन में सुधार होता है और एडेप्टिव इन्फरेंस तथा ज़ीरो-शॉट प्रोटीन श्रिंकिंग जैसे नवीन अनुप्रयोगों को सक्षम बनाया जाता है।
यह शोध पत्र ConforMix को प्रस्तुत करता है, जो एक इन्फरेंस-टाइम (inference-time) एल्गोरिदम है जो डिफ्यूजन मॉडल्स को डोमेन मोशन और क्रिप्टिक पॉकेट्स सहित विविध बायोमॉलिकुलर कन्फर्मेशनल लैंडस्केप्स को कुशलतापूर्वक सैंपल करने और खोजने के लिए उन्नत करता है, जिसमें स्वतंत्रता की डिग्री (degrees of freedom) के पूर्व ज्ञान या पुनर्रचना (retraining) की आवश्यकता नहीं होती है।
यह शोध पत्र एक सैद्धांतिक विश्लेषण प्रस्तुत करता है जो यह प्रदर्शित करता है कि विभेदक सूचना असंतुलन (Differentiable Information Imbalance) का उपयोग करके प्रोटीनों के लिए अनसुपरवाइज्ड फीचर चयन, ग्लास-जैसे और लिक्विड-जैसे अवस्थाओं के बीच एक चरण संक्रमण (phase transition) को प्रकट करता है, जहाँ भौतिक-रासायनिक विशेषताओं की महत्वपूर्ण संख्या डाउनस्ट्रीम वर्गीकरण प्रदर्शन के संतृप्ति के साथ मेल खाती है, जो न्यूनतम फीचर सेटों की पहचान करने के लिए एक सिद्धांत आधारित मानदंड प्रदान करती है।
यह शोध पत्र UCCS प्रस्तुत करता है, जो एक नवीन इन्फरेंस-टाइम स्टीयरिंग विधि है जो यूटिलिटी-नियंत्रित कंट्रास्टिव डेटासेट का निर्माण करके प्रोटीन लैंग्वेज मॉडल्स में पैथोलॉजिकल रिपिटिशन (रोगजनक पुनरावृत्ति) को प्रभावी ढंग से कम करती है, जिससे संरचनात्मक फोल्डेबिलिटी (structural foldability) से समझौता किए बिना या मॉडल को पुन: प्रशिक्षित किए बिना जनरेशन विश्वसनीयता में सुधार होता है।
यह शोध पत्र मिनिमल-एक्शन डिस्क्रीट श्रोडिंगर ब्रिज मैचिंग (MadSBM) का परिचय देता है, जो एक रेट-आधारित जनरेटिव फ्रेमवर्क है जो अमीनो-एसिड एडिट ग्राफ पर उच्च-संभावना वाले क्षेत्रों में नेविगेट करने के लिए एक समय-निर्भर नियंत्रण क्षेत्र (time-dependent control field) को सीखकर पेप्टाइड अनुक्रम डिजाइन को अनुकूलित करता है, और साथ ही कार्यात्मक अनुकूलन (functional optimization) के लिए श्रोडिंगर ब्रिज मॉडल में डिस्क्रीट क्लासिफायर गाइडेंस के अनुप्रयोग को भी अग्रणी बनाता है।
यह शोध पत्र एक ऐसी कम्प्यूटेशनल रूपरेखा प्रस्तुत करता है जो सिंथेटिक फंक्शनल लैंडस्केप बनाने के लिए एक जनरेटिव विधि और एक टोपोलॉजी-अवेयर ग्राफ न्यूरल नेटवर्क को संयोजित करती है ताकि डेटा की कमी को दूर किया जा सके और मल्टीस्पेसिफिक एंटीबॉडीज की प्रभावकारिता की भविष्यवाणी की जा सके, जिससे ट्राइस्पेसिफिक टी-सेल एंगेजर्स जैसे जटिल चिकित्सीय डिजाइनों के तर्कसंगत अनुकूलन को सक्षम बनाया जा सके।
यह अध्ययन अल्जाइमर रोग के लिए एक आशाजनक चिकित्सीय रणनीति प्रदान करते हुए, इंट्रासेल्युलर अमाइलॉइड बीटा-42 को यूबिक्विटिन-प्रोटियासोम सिस्टम के माध्यम से क्षरण (डिग्रेडेशन) के लिए लक्षित करने वाले नवीन, संश्लेषणात्मक आणविक ग्लू (molecular glues) को डिजाइन करने के लिए 'लिगेज-कंडीशन्ड जंक्शन ट्री वेरिएशनल ऑटोएन्कोडर' का उपयोग करने वाले एक एआई-संचालित ढांचे को प्रस्तुत करता है।
यह शोध पत्र फोटोसिस्टम II में एक नए जल ऑक्सीकरण तंत्र का प्रस्ताव करता है जहाँ O-O बंध His337 के O3 लिगैंड और Mn1 पर उत्पन्न O6 ऑक्सीजन के बीच बनता है, एक ऐसा मार्ग जो कम ऊर्जा आवश्यकताओं और प्रतिक्रिया को निर्देशित करने में प्रोटीन वातावरण की महत्वपूर्ण भूमिका को प्रदर्शित करके प्रयोगात्मक विवादों को सुलझाता है।