🧬 जीव विज्ञान

Polymorph-Dependent Success of Generative Protein Design Against Amyloid Fibrils: A Cross-Method Benchmark Including AL Amyloidosis

यह अध्ययन एमाइलॉयडोसिस (AL amyloidosis), पार्किंसंस और अल्जाइमर रोगों से जुड़े एमाइलॉयड फाइब्रिल्स के विरुद्ध जनरेटिव प्रोटीन डिज़ाइन टूल्स का बेंचमार्किंग करता है, जिससे यह पता चलता है कि डिज़ाइन की सफलता रोग के प्रकार के बजाय विशिष्ट फाइब्रिल पॉलीमॉर्फ्स द्वारा निर्धारित होती है, जिसमें डिफ्यूजन-आधारित विधियाँ हेलुसिनेशन-आधारित दृष्टिकोणों से बेहतर प्रदर्शन करती हैं और बीटा-शीट प्रपेंसिटी (beta-sheet propensity) एवं बाइंडिंग कॉन्फिडेंस के बीच एक मजबूत सहसंबंध प्रदर्शित करती हैं।

Siddhardha Nanda2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

Integrated transcriptomic and proteomic analysis reveals molecular targets of vasopressin in GT1-7 GnRH neurons

यह अध्ययन GT1-7 GnRH न्यूरॉन्स का पहला व्यापक मल्टी-ओमिक्स प्रोफाइल प्रस्तुत करता है, जो यह प्रकट करता है कि आर्जिनिन वैसोप्रेसिन 73 लगातार विनियमित अणुओं और प्रमुख सिग्नलिंग मार्गों की पहचान करके समन्वित ट्रांसक्रिप्शनल, पोस्ट-ट्रांस्क्रिप्शनल और मेटाबॉलिक विनियमन के माध्यम से उनकी स्रावी गतिविधि को नियंत्रित करता है।

Ran Tao, Xiaofen zhang, Zhu Zhu, Wei Wang, Feng Huang2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

Polymorph-Independent Resistance to Generative Protein Design Across Five Tau Fibril Folds: A Cross-Tauopathy Benchmark

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि, अन्य अमाइलॉयड प्रणालियों के विपरीत जहाँ डिज़ाइन की सफलता संरचनात्मक बहुरूप (स्ट्रक्चरल पॉलिमॉर्फ) के अनुसार भिन्न होती है, विभिन्न ताऊपैथीज़ (tauopathies) में मौजूद सभी पाँच विशिष्ट ताऊ फाइब्रिल फोल्ड्स जनरेटिव प्रोटीन बाइंडर डिज़ाइन के प्रति समान रूप से प्रतिरोधी हैं, जो यह सुझाव देता है कि प्रतिरोध एक परिवार-विशिष्ट गुण है न कि अमाइलॉयड ज्यामिति की एक सार्वभौमिक विशेषता।

Siddhardha Nanda2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

Beyond Accuracy: Benchmarking the Reproducibility and Robustness of Single-Cell Embeddings

यह शोध पत्र BioBench प्रस्तुत करता है, जो 'बायोलॉजिकल स्टेबिलिटी स्कोर' के माध्यम से इस धारणा को चुनौती देता है कि पुनरुत्पादकता (reproducibility) मॉडल वर्ग के साथ सह-संबंधित है, यह प्रदर्शित करते हुए कि एल्गोरिद्मिक सॉल्वर, न कि कोई विधि रैखिक है या गहरी (deep), सिंगल-सेल एम्बेडिंग स्थिरता के प्राथमिक निर्धारक हैं।

Advika Jain2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

Cell-free DNA profiling for cancer detection and monitoring in dogs: a cross-study benchmark

यह अध्ययन 341 कुत्तों के 896 प्लाज्मा अनुक्रमण (sequencing) रन का उपयोग करके एक एकीकृत बेंचमार्किंग ढांचे को स्थापित करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि एक नया फ्रैगमेंट-लेंथ-आधारित फीचर सेट (FlowTail), जब मौजूदा ट्यूमर-भार अनुमानकों के साथ एकीकृत किया जाता है, तो स्वतंत्र कैनिन अध्ययनों में मजबूत, हस्तांतरणीय और सटीक कैंसर पहचान, प्रकार भेदभाव और अनुदैर्ध्य निगरानी सक्षम करता है।

Bin Li, Ming-shan Tsai, Floryne O. Buishand2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

Multi-omics analyses reveal hypoxia-induced CHD2 as a key driver of malignant progression and microenvironment remodeling in HCC via the TGF-β/SMAD axis

यह अध्ययन हाइपोक्सिया-प्रेरित CHD2 को हेपेटोसेलुलर कार्सिनोमा में एक महत्वपूर्ण ऑन्कोजेनिक ड्राइवर के रूप में पहचानता है जो TGF-β/SMAD मार्ग को सक्रिय करके घातक प्रगति और इम्यून इवेजन (प्रतिरक्षा अपवंचन) को बढ़ावा देता है, जिससे इसे एक संभावित बायोमार्कर और चिकित्सीय लक्ष्य के रूप में स्थापित किया गया है।

YICHEN YANG, Ren Bingyi, Sheng Kai, Bai Zhiyuan, Ren Yang, Yi Lv, Liu Kang2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

In Vivo Evaluation of the Efficacy, Biosafety, and Bioavailability of Potential NBC Probiotic Strains

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि पाँच विशिष्ट लैक्टिक एसिड बैक्टीरिया स्ट्रेन (NBC99, YEA81, SA74, NBC5527, और NBC2255) बिना किसी विषाक्तता के चूहों में ऑक्सीडेटिव तनाव को प्रभावी रूप से कम करते हैं, आंत और रक्त-मस्तिष्क अवरोध की अखंडता को मजबूत करते हैं, और प्रणालीगत सूजन को कम करते हैं, जिससे गट-ब्रेन एक्सिस को नियंत्रित करने के लिए सुरक्षित प्रोबायोटिक्स के रूप में उनकी क्षमता का समर्थन मिलता है।

Elvan Anadol, Ateş Kara, Hasan Tezer, Şaban Cem Sezer, Zeynep Yığman, Deniz Billur, Beyza Aydoğan Kara, Sibel Söylemez (…)2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

A Visual Metric for Biological Membrane Instability: Geometric Coupling of Lateral Expansion and Acyl Chain Splay as a Geometric Precursor Signature of Packing Defects in Glutamate Transporter Splice Variant Self-assemblies

यह अध्ययन पैकिंग डिफेक्ट ज्योमेट्री प्लॉट (PDGP) को पेश करता है, जो एक पायथन-आधारित टूल है जो हाइड्रोफोबिक पैकिंग दोषों की पहचान करने के लिए स्थानीय वोरोनोई क्षेत्र को एसिल चेन स्प्ले के साथ सह-संबंधित करता है, जिससे यह पता चलता है कि ट्रंकेटेड ग्लूटामेट ट्रांसपोर्टर होमोडाइमर, प्रारंभिक अपेक्षाओं के विपरीत, बड़े असेंबली की तुलना में अधिक झिल्ली विकार और दोष अधिभोग उत्पन्न करते हैं।

Alper Karagöl, Taner Karagöl2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

A Reproducible Meta-Analytic Pipeline for Quantifying Ecological Bottlenecks, Alpha Diversity Decay, and Core Biomarker Fluctuations in Ex Vivo Human Gut Microbiota Fermentations

यह शोध पत्र एक पुनरुत्पादक (reproducible) R-आधारित सांख्यिकीय पाइपलाइन प्रस्तुत करता है जो एक्स विवो (ex vivo) मानव गट माइक्रोबायोटा किण्वन में तत्काल पारिस्थितिक बहाव (ecological drift) को परिमाणित करता है, जो इन विवो (in vivo) से कृत्रिम बायोरिएक्टर वातावरण में स्थानांतरण होने पर टैक्सोनोमिक समृद्धि में 87.9% की तीव्र गिरावट और महत्वपूर्ण सामुदायिक पुनर्गठन को प्रकट करता है।

Ismael Akala2026-09-22
🧬 जीव विज्ञान

Brainana: an end-to-end preprocessing framework for macaque neuroimaging

ब्रेननाना (Brainana) एक स्वचालित, कंटेनराइज्ड और क्लाउड-सुलभ फ्रेमवर्क है जिसे डीप लर्निंग मॉडल्स, शारीरिक अनुकूलन (anatomical optimizations) और गुणवत्ता नियंत्रण को एकीकृत करके मैकाक न्यूरोइमेजिंग डेटा के एंड-टू-एंड प्रीप्रोसेसिंग को मानकीकृत और सुव्यवस्थित करने के लिए डिज़ाइन किया गया है ताकि पुनरुत्पादक, स्केलेबल और क्रॉस-स्टडी तुलनीय परिणाम सुनिश्चित किए जा सकें।

Xingyu Liu, Yijun Zhang, Zi Yin, Zonglei Zhen, Michael Arcaro2026-09-22