🧬 biology

Shotgun-NF: A reproducible Nextflow pipeline for end-to-end shotgun metagenomics analysis

Shotgun-NF एक पोर्टेबल, मॉड्यूलर और पुनरुत्पादनीय (reproducible) Nextflow पाइपलाइन है जो कंटेनराइजेशन और स्वचालित प्रोवेनेंस ट्रैकिंग के माध्यम से विविध कंप्यूटिंग वातावरणों में निष्पादन निरंतरता सुनिश्चित करते हुए, कच्चे अनुक्रमण डेटा (raw sequencing data) से लेकर स्ट्रेन-स्तरीय तुलनात्मक अंतर्दृष्टि तक, एंड-टू-एंड शॉटगन मेटाजेनोमिक्स विश्लेषण के लिए उपकरणों के एक व्यापक समूह को एकीकृत करती है।

Fereshteh Izadi, Sepideh Mofidifar, Emily A. Wasson, Carla S. Möller-Levet, André P. Gerber2026-07-01
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MLH1 −93G/A Polymorphism: Its Role in Colorectal Cancer Progression and Metastasis

यह अध्ययन एक इराकी आबादी में पहले अन्वेषण की रिपोर्ट करता है, जिसमें पाया गया है कि MLH1 −93G/A बहुरूपता (polymorphism) कोलोरेक्टल कैंसर के बढ़ते संवेदनशीलता से महत्वपूर्ण रूप से जुड़ी हुई है और उन्नत रोग प्रगति, जिसमें उच्च हिस्टोलॉजिकल ग्रेड, बाद के TNM चरण और लिम्फ नोड मेटास्टेसिस शामिल हैं, के साथ सह-संबंधित है।

Ali Alabedi, Rand Al- Husseini2026-07-01
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Predicting Microbiologically Influenced Corrosion Risk from Quorum Sensing Biofilm Community Features: A Random Forest-SHAP Approach

यह अध्ययन एक रैंडम फॉरेस्ट-SHAP मशीन लर्निंग फ्रेमवर्क प्रस्तुत करता है जो पारंपरिक पर्यावरणीय और सूक्ष्मजीव संबंधी मापदंडों के साथ नवीन कोरम सेंसिंग बायोफिल्म सामुदायिक विशेषताओं को एकीकृत करके सूक्ष्मजीवों द्वारा प्रेरित क्षरण (माइक्रोबायोलॉजिकल इन्फ्लुएंस्ड कोरोजन) के जोखिम की सफलतापूर्वक भविष्यवाणी करता है, जिससे 0.762 का F1 स्कोर प्राप्त होता है और क्षरण मूल्यांकन में बैक्टीरिया संचार संकेतों के भविष्य कहनेवाला मूल्य का प्रदर्शन होता है।

Bipul Bhattarai, Naina Maharajan, Sulav Dahal2026-07-01
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AI-Based Pipeline for Vascularization Detection in Histological Images; low-cost solution Using Moderate Computing Resources

यह शोध पत्र एक कम लागत वाले, उपयोगकर्ता के अनुकूल एआई (AI) पाइपलाइन को प्रस्तुत करता है जो सरल इमेज प्रोसेसिंग को एक संवादात्मक, स्व-शिक्षण समानता-खोज पद्धति के साथ जोड़ता है ताकि रोगविज्ञानी (pathologists) सीमित कंप्यूटिंग संसाधनों और न्यूनतम मैनुअल लेबलिंग का उपयोग करके हिस्टोलॉजिकल छवियों में वैस्कुलराइजेशन (vascularization) का तेजी से और सटीक रूप से पता लगा सकें।

Jan Žídek, Bretislav Lipový, Veronika Pavliňáková, Martin Knoz, Jakub Holoubek, David Izsák, Vladimir Váňa, Jan Herudek (…)2026-07-01
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Ecological Inference Is Structured Empirical Risk Minimization: Generalization Across Space, Nested Units, and Niche Support

यह शोध पत्र यह तर्क देता है कि भौगोलिक मॉडलों के विभिन्न स्थलों पर सामान्यीकरण करने में बार-बार होने वाली विफलता का मूल कारण नेस्टेड (nested) सर्वेक्षण डेटा में एक मौलिक एस्टिमैंड (estimand) बेमेल होना है, जो यह प्रदर्शित करता है कि पारिस्थितिक अनुमान (ecological inference), डोमेन जनरलाइजेशन के तहत एम्पेरिकल रिस्क मिनिमाइजेशन (empirical risk minimization) के संरचनात्मक रूप से समकक्ष है और विश्वसनीय स्थानिक हस्तांतरण सुनिश्चित करने के लिए मानक व्यक्तिगत-स्तरीय क्रॉस-वैलिडेशन के बजाय जनसंख्या-स्तरीय होल्डआउट वैलिडेशन की आवश्यकता है।

R. Craig Stillwell2026-07-01
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BioGPT-ClinVar: Parameter-Efficient Fine-Tuning of a Biomedical LLM for Genomic Variant Interpretation

यह अध्ययन BioGPT-ClinVar प्रस्तुत करता है, जो जीनोमिक वेरिएंट व्याख्या के लिए 150-मिलियन-पैरामीटर वाले BioGPT मॉडल को अनुकूलित करने के लिए लो-रैंक एडेप्टेशन (LoRA) का उपयोग करने वाला एक पैरामीटर-कुशल फाइन-ट्यूनिंग फ्रेमवर्क है, जो एक क्यूरेटेड ClinVar डेटासेट पर प्रभावी अभिसरण (convergence) प्रदर्शित करता है और भविष्य के नैदानिक एवं निगरानी अनुप्रयोगों के लिए एक ओपन-सोर्स, पुनरुत्पादक पाइपलाइन प्रदान करता है।

Sepideh Moafi2026-07-01
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Trained quantum Kolmogorov--Arnold networks can dequantize, and a discrete-logarithm encoding need not: a measurement-based map of where quantum advantage can live

यह शोध पत्र यह प्रदर्शित करता है कि जहाँ प्रशिक्षित क्वांटम कोलमोगोरोव-अर्नोल्ड नेटवर्क अक्सर कम-बॉन्ड-डायमेंशन टेंसर नेटवर्क के माध्यम से शास्त्रीय रूप से अनुकरणीय होते हैं, वहीं डिस्क्रीट-लॉगारिदम एन्कोडिंग का उपयोग करके वास्तविक क्वांटम लाभ को संरक्षित और प्रशिक्षित योग्य बनाया जा सकता है, जो बैरन प्लेटो (barren plateaus) का शिकार हुए बिना संख्या-सिद्धांत संबंधी जटिलता (number-theoretic hardness) को समाहित करते हैं।

Hikaru Wakaura2026-07-01
🧬 biology

Integrated Machine Learning, Virtual Screening and Molecular Dynamics to Discover Febuxostat as a Novel S1PR1 Modulator

यह अध्ययन मल्टीपल स्केलेरोसिस के लिए चिकित्सीय क्षमता वाले एक नवीन, स्थिर S1PR1 मॉड्युलेटर के रूप में फेबक्सोस्टेट (Febuxostat) की पहचान करने के लिए मशीन लर्निंग, वर्चुअल स्क्रीनिंग और मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स को संयोजित करने वाले एक एकीकृत कम्प्यूटेशनल वर्कफ़्लो का उपयोग करता है।

Akshata Pauskar, Elamathi Natarajan2026-07-01
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Xkr regulates phosphatidylserine transport via ER-PM contact sites to promote apoptotic cell clearance

यह अध्ययन प्रकट करता है कि ड्रोसोफिला (Drosophila) लिपिड स्क्रैम्ब्लेज Xkr, ER-प्लाज्मा झिल्ली संपर्क स्थलों पर dORP9 के साथ परस्पर क्रिया करके कोशिका सतह तक गैर-वेसिकुलर फॉस्फेटिडिलसेरीन परिवहन को सुगम बनाने के लिए, एपोप्टोटिक कोशिका निकासी को बढ़ावा देता है, जिससे यह "ईट मी" (eat me) सिग्नल एक्सपोजर के लिए एक वैकल्पिक कैस्पेज़-स्वतंत्र मार्ग के रूप में कार्य करता है।

Qian Zheng, Xinyu Ma, Fuqiao Liu, Tong Xiao, Lei Yuan, Qing Yan, Hui Wang, Hui Xiao2026-07-01
🧬 biology

Analysis of Human Physiology in Simulated Lunar and Martian Hypogravity With and Without Virtual Reality

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि सिम्युलेटेड हाइपोग्रैविटी (hypogravity) चलने के दौरान हृदय संबंधी मांग को कम करती है, जबकि वर्चुअल रियलिटी हृदय गति में वृद्धि को विलंबित करके शारीरिक प्रतिक्रियाओं को नियंत्रित करती है, जो भविष्य के चंद्र और मंगल मिशनों के लिए चालक दल को तैयार करने हेतु AlterG ट्रेडमिल के साथ VR के संयोजन की सुरक्षा और प्रभावकारिता की पुष्टि करता है।

Rosirene Pantaleão Gessinger, Juliana Silva Herbert, João de Carvalho Castro, Joana Figueira Godinho, Adrian Alberto Fer (…)2026-07-01