Shotgun-NF: A reproducible Nextflow pipeline for end-to-end shotgun metagenomics analysis
Shotgun-NF एक पोर्टेबल, मॉड्यूलर और पुनरुत्पादनीय (reproducible) Nextflow पाइपलाइन है जो कंटेनराइजेशन और स्वचालित प्रोवेनेंस ट्रैकिंग के माध्यम से विविध कंप्यूटिंग वातावरणों में निष्पादन निरंतरता सुनिश्चित करते हुए, कच्चे अनुक्रमण डेटा (raw sequencing data) से लेकर स्ट्रेन-स्तरीय तुलनात्मक अंतर्दृष्टि तक, एंड-टू-एंड शॉटगन मेटाजेनोमिक्स विश्लेषण के लिए उपकरणों के एक व्यापक समूह को एकीकृत करती है।