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Questo studio presenta le strutture crioelettroniche del complesso elicasa-primasi dell'herpesvirus umano 1 in complesso con inibitori clinici, rivelando un meccanismo di inibizione allosterica che blocca la conformazione aperta dell'elicasa e fornisce una base strutturale per lo sviluppo di nuovi farmaci contro i sottogruppi beta e gamma degli herpesvirus.
Questo studio descrive la scoperta e la caratterizzazione del flavophos, un nuovo antibiotico fosfonato prodotto da *Burkholderia* che inibisce la lumazine sintasi, un enzima chiave nella biosintesi dei flavin, grazie a un meccanismo catalitico divergente mediato da un enzima della famiglia DUF849.
Lo studio dimostra che la fusione delle subunità χ e ψ della DNA polimerasi III di *E. coli* impedisce la tolleranza all'AZT, rivelando che il ruolo di χ nella riparazione del DNA richiede un'interazione dinamica e non vincolata con SSB e l'elicasi YoaA al di fuori del complesso di caricamento del clamp.
Il paper presenta SpecReBoot, un nuovo framework statistico che applica il metodo bootstrap al ricalcolo delle similarità negli spettri di massa di tandem per quantificare l'incertezza nelle reti molecolari, eliminando connessioni inaffidabili e rivelando relazioni chimiche nascoste, come dimostrato dalla scoperta di un nuovo scaffold macrolattone.
Questo studio dimostra che, a differenza della carenza totale di lipidi eterei, la specifica assenza di plasmalogeni nei topi non compromette l'integrità retinica né la fertilità, indicando che i lipidi plasmanilici sono sufficienti a prevenire le gravi patologie oculari e riproduttive associate alla carenza di lipidi eterei.
Questo studio identifica per la prima volta un insieme diversificato di proteine che riconoscono specificamente la simmetria delle modifiche 5-formilcitosina nel DNA mammifero, rivelando come fattori di trascrizione e proteine di riparazione legino selettivamente diverse combinazioni di nucleobasi per modulare la regolazione cromatinica.
Questo studio rivela come l'architettura del promotore modellata da TFAM e gli elementi regolatori di PolRMT coordinino l'inizio e la regolazione della trascrizione mitocondriale, identificando un'interfaccia stimolatoria dipendente da TFAM e un meccanismo di autoinibizione mediato dall'elica di ancoraggio di PolRMT.
Questo studio identifica un nuovo sito allosterico vicino all'elica 8 nel recettore GPR84, rivelando attraverso strutture Cryo-EM e simulazioni come un modulatore positivo (PSB-16671) induca segnalazione Gi-biased stabilizzando una conformazione specifica che favorisce la fagocitosi delle cellule tumorali senza desensibilizzazione.
Gli autori sviluppano un approccio basato su immunoprecipitazione con nanocorpi e spettrometria di massa nativa per analizzare complessi proteici endogeni nel cervello umano, rivelando che l'abbondanza regionale di eterodimeri mGluR2/3 è alterata in condizioni di depressione e suicidio, fornendo così un legame diretto tra organizzazione recettoriale e comportamento.
Lo studio dimostra che la fosforilazione di UBE2J1 alla serina 184 è essenziale per promuovere la replicazione del virus della stomatite vescicolare e la sincizializzazione cellulare, in quanto la sua sovraespressione, specialmente nella forma troncata non ancorata all'ER, aumenta significativamente i titoli virali e l'area di fusione cellulare.
Questo studio identifica TCF25 come una proteina citoplasmatica che regola la stabilità di GPRASP2, definendo il suo contesto funzionale e le implicazioni per l'omeostasi cellulare.
Questo studio caratterizza la proteina BrxC del sistema di difesa BREX, rivelando come la sua capacità di formare diversi complessi competitivi e di legare il DNA, regolata dall'ATP e dalle interazioni con BrxB e PglZ, sia fondamentale per modulare l'equilibrio tra la metilazione del genoma ospite e la restrizione dei batteriofagi.
Questo studio dimostra che l'approccio nanoDSF con gradiente di urea supera le limitazioni cinetiche e strumentali, permettendo la determinazione affidabile delle temperature di fusione di proteine ipertermofile estremamente stabili, come la DNA polimerasi di *Pfu*, che altrimenti non mostrerebbero transizioni di unfolding in condizioni native.
Questo studio presenta una strategia di legazione enzimatica che utilizza brevi oligonucleotidi di DNA modificati, in particolare con gruppi decilici, per migliorare significativamente l'efficienza di ionizzazione e la sensibilità della spettrometria di massa accoppiata alla cromatografia liquida nell'analisi di RNA e delle sue modifiche.
Questo studio valida tre varianti ingegnerizzate di albumina sierica umana, prodotte in *E. coli* con un elevato numero di sostituzioni amminoacidiche, dimostrando che mantengono la struttura nativa, la stabilità, la biocompatibilità e la funzionalità di riciclo mediata da FcRn, offrendo così una soluzione sostenibile e priva di derivati animali per applicazioni biotecnologiche e terapeutiche.
Questo studio rivela che la perossiredossina atipica RvPrxL del tardigrado *Ramazzottius varieornatus*, pur avendo perso la sua attività antiossidante canonica, si è neofunzionalizzata per legare gli acidi nucleici nel nucleo grazie a una struttura oligomerica unica e a una regione N-terminale specifica.
Questo studio risolve la struttura del complesso tra la ligasi PafA e un substrato pupilato, rivelando che la vasta specificità di riconoscimento del substrato è garantita da un'interfaccia dinamica e distribuita che favorisce la compatibilità geometrica rispetto a motivi sequenziali conservati.
HyperLab, una piattaforma web guidata dall'intelligenza artificiale sviluppata da HITS, accelera la scoperta di farmaci semplificando l'intero flusso di lavoro, dalla previsione delle strutture di legame e l'ottimizzazione molecolare allo screening di vasti librerie chimiche e alla validazione sperimentale, riducendo così barriere temporali, economiche e di competenza specializzata.
Lo studio dimostra che l'ubiquitinazione di H2A.Z (H2A.Zub) è un meccanismo chiave per la repressione trascrizionale globale, associandosi a cromatina repressiva caratterizzata da modifiche istoniche come H3K27me3, isole CpG metilate e sequenze omopuriniche/omopirimidiniche.
Lo studio dimostra che l'uso di modelli di machine learning rivela come il coefficiente di distribuzione logD, che riflette l'idrofobicità dipendente dal pH, sia il fattore determinante per prevedere la partizione delle piccole molecole nei condensati biomolecolari, superando l'efficacia dei descrittori tradizionali come logP e logS.