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Contrasting population structures coexist in a strain-resolved estuarine microbiome

Questo studio, che segna il culmine di un decennio di ricerche, utilizza il sequenziamento Nanopore e l'assemblatore myloasm per ricostruire 488 genomi completi da un campione di microbioma estuario, rivelando come popolazioni batteriche coesistenti possano seguire strategie evolutive radicalmente diverse, con *Pelagibacter* che mostra un'alta diversità di ceppi e *HIMB114* che presenta una struttura quasi monolitica.

Lui, L. M., Nielsen, T.2026-03-31🦠 microbiology

Body-wrapping anterior flagella drive ultrafast swimming in bacterial zoospores

Questo studio rivela che le zoospore di *Actinoplanes missouriensis* raggiungono velocità di nuoto ultra-rapide (fino a 500 lunghezze corporee al secondo) grazie a un fascio di flagelli anteriori che avvolgono il corpo e ruotano sincronamente come un'elica, un meccanismo innovativo che supera i limiti della motilità batterica tradizionale basata sulla sola velocità del motore.

Uemura, N. A., Ishida, T., Sowa, Y. + 4 more2026-03-31🦠 microbiology

A Droplet Digital PCR Assay for Quantification of Bacteriophage Viral Vector Titer and Purity.

Questo studio presenta un saggio ottimizzato di PCR digitale a gocce (ddPCR) che, grazie all'uso di codici a barre del DNA unici e a un approccio di progettazione degli esperimenti, permette una quantificazione precisa e accurata della purezza e della potenza dei vettori virali basati su batteriofagi, superando i limiti delle tradizionali misurazioni di attività biologica.

Voorhees, P. J., Ponek, R. M., Liu, J. D. + 1 more2026-03-30🦠 microbiology

A Machine Learning Framework for Serogroup Classification of pathogenic species of Leptospira Based on rfb Locus Profiles

Questo studio presenta un framework di machine learning che classifica con alta precisione i sierogruppi di *Leptospira* patogeni analizzando i profili del locus *rfb* a partire da dati genomici, offrendo un'alternativa scalabile ai tradizionali test sierologici e proponendo il nuovo concetto di "seroclass".

de Carvalo Ferreira Filho, E., Melo Arruda, P., Cabral Afonso Ferreira, L. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

A set of constitutive promoters with graded strengths for gene expression in diverse cyanobacterial strains

Questo studio presenta un set di promotori costitutivi con forze graduali, derivati da varianti sintetiche di PconII, che sono stati caratterizzati in diversi ceppi di cianobatteri (inclusi ceppi non modello isolati di recente) per fornire strumenti genetici versatili necessari all'ingegneria metabolica e alla produzione biotecnologica.

Trieu, K., Bishe, B., Taton, A. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

ONETest PathoGenome: A Multi-Cohort Evaluation of an Optimized NGS Assay for Detection of Lower Respiratory Pathogens in Bronchoalveolar Lavage

Lo studio valida l'assay metagenomico automatizzato ONETest PathoGenome su campioni di lavaggio broncoalveolare, dimostrando che la sua capacità di arricchimento del genoma centrale migliora significativamente la sensibilità e la specificità nella rilevazione di patogeni respiratori rispetto alle colture tradizionali e alla sequenziazione shotgun, offrendo un risultato rapido e complementare per la diagnosi delle infezioni del tratto respiratorio inferiore.

Massoumi Alamouti, S., Nguyen, H. D., Daneshpajouh, H. + 9 more2026-03-30🦠 microbiology

DEAD-box RNA helicase DDX3X maintains the homeostasis of the Zika virus translation-replication cycle

Lo studio dimostra che l'elicasa cellulare DDX3X regola l'omeostasi del ciclo di traduzione e replicazione del virus Zika nelle cellule microgliali umane, promuovendo la sintesi proteica virale e inibendo la sintesi dell'RNA in modo dipendente dall'ATP, suggerendo il suo potenziale come bersaglio farmacologico.

Hernandez-Diaz, T., Gonzalez-Poblete, A., Giraldo-Ocampo, S. + 13 more2026-03-30🦠 microbiology

A host-directed virulence factor of Clostridium perfringens is modulated by gut commensal strains

Lo studio dimostra che i ceppi commensali del microbiota intestinale umano modulano la crescita e l'espressione della virulenza di *Clostridium perfringens*, in particolare della tossina theta, attraverso la competizione per i nutrienti e l'alterazione proteica, suggerendo che la modulazione mirata del microbioma sia una strategia efficace per prevenire le infezioni.

Schumacher, J., Stincone, P., Rapp, J. + 10 more2026-03-30🦠 microbiology

A Live Attenuated Vaccine Candidate against Emerging Highly Pathogenic Cattle-Origin 2.3.4.4b H5N1 Viruses

Questo studio dimostra che il vaccino vivente attenuato LPhTXdNS1, privo della proteina NS1 e derivato da un ceppo H5N1 di origine bovina, è sicuro, altamente immunogeno e capace di proteggere i topi da una sfida letale con il virus selvatico, rappresentando un promettente candidato vaccinale contro l'epidemia emergente di H5N1 2.3.4.4b.

Mostafa, A., Ye, C., Barre, R. S. + 12 more2026-03-29🦠 microbiology