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Lo studio integra dati di trascrittomica e proteomica su tre patogeni batterici umani per dimostrare che le risposte allo stress ambientale riducono la correlazione tra livelli di mRNA e proteine, evidenziando il ruolo cruciale dei geni essenziali e delle modifiche post-traduzionali nell'adattamento batterico.
Questo studio integra dati epidemiologici e genomici su 4.505 campioni respiratori bovini negli Stati Uniti (2020-2025), rivelando che il Coronavirus Bovino (BCoV) è prevalente nei vitelli giovani, spesso co-infetta con altri patogeni e circola principalmente come ceppo del genotipo GIIb in continua evoluzione genetica.
Questo studio utilizza un flusso di lavoro metagenomico ottimizzato per analizzare i microbiomi aerei e superficiali in un ospedale britannico, rivelando la presenza di patogeni critici, geni di resistenza agli antibiotici e fattori di virulenza che evidenziano la complessità delle vie di trasmissione delle infezioni ospedaliere e la necessità di una sorveglianza ambientale rapida.
Questo studio descrive l'adattamento proteomico globale di *Pseudogymnoascus destructans* sotto stress da carenza o eccesso di rame, identificando centinaia di proteine differenzialmente abbondanti coinvolte nell'acquisizione del metallo, nella difesa dallo stress ossidativo e nel metabolismo, e presentando anticorpi specifici per rilevare tali risposte.
Uno studio su laghi meromittici rivela che la discrepanza tra abbondanza e attività nei batteri solfuro-ossidanti è determinata dal tipo di infezione virale, con i batteri solfuro-rossi che ospitano virus temperati e mostrano un'attività trascrizionale superiore alla loro abbondanza, mentre i batteri solfuro-verdi sono colpiti da infezioni litiche.
Questo studio conferma per la prima volta l'isolamento di *Candida auris* in Antartide, evidenziando fenotipi adattati al freddo, affinità per il nylon e un ruolo cruciale dei fenotipi mutatori nell'evoluzione rapida e nella diffusione globale di ceppi resistenti ai farmaci.
Lo studio rivela che il locus scs in *Stenotrophomonas maltophilia* agisce come un determinante contesto-dipendente dell'adesione e della virulenza, modulando le funzioni di altri sistemi pilari e flagellari in un complesso paesaggio di superficie batterica.
Questo studio rivela che i phoronidi (*Phoronopsis harmeri*) e i loro tubi ospitano microbiomi distinti e meno diversificati rispetto ai sedimenti circostanti, dominati da batteri coinvolti nel ciclo dello zolfo, suggerendo un potenziale ruolo simbiotico nella difesa chimica e nei processi biogeochimici marini.
Questo studio presenta un catalogo genomico di batteri e fagi derivato da metagenomi di *Zostera marina*, rivelando un potenziale ruolo dei virus nel ciclo del carbonio degli ecosistemi di praterie di fanerogame marine.
Questo studio presenta il genoma di *Colletotrichum* sp. CLE4, un fungo associato alla fanerogama marina *Zostera marina*, rivelando un processo di semplificazione genomica e un adattamento evolutivo che suggeriscono un ruolo ecologico specializzato e un potenziale stile di vita emibiotrofico nell'ecosistema marino.
Questo studio presenta il recupero di cinque metagenomi assemblati (MAG) da eucarioti associati alla fanerogama marina *Zostera marina*, incluso un nuovo fungo chitride dell'ordine Lobulomycetales caratterizzato da un ampio repertorio di enzimi e proteine secretorie che suggeriscono un ruolo simbiotico nell'ecosistema delle praterie di posidonia.
Lo studio dimostra che il ligando reprime l'attività della chinasi istidinica batterica PdtaS di *Mycobacterium tuberculosis* inibendone la dimerizzazione, un meccanismo che permette a un singolo enzima di percepire segnali chimici diversificati come il rame e l'ossido nitrico.
Questo studio integra bioinformatica e machine learning per identificare isole di patogenicità in *Fusobacterium nucleatum* e formulare un'ipotesi meccanicistica che collega l'acquisizione di ferro mediata da emolisina alla promozione del cancro attraverso lo stress ossidativo e la modulazione della via Hippo.
Questo studio identifica sistematicamente le proteine leganti i peptidi di tipo PBP2 come i principali recettori dei siderofori nei batteri Gram-positivi, rivelando meccanismi di regolazione coordinata e differenze strutturali rispetto ai Gram-negativi che permettono di ricostruire su larga scala le reti di interazione microbica mediata dal ferro.
Lo studio identifica la chinasi NEK4 di *Plasmodium berghei* come un regolatore chiave che, localizzandosi al centro organizzatore dei microtubuli e al complesso polare apicale subito dopo la fecondazione, coordina l'avvio della meiosi con la morfogenesi dello zigote, garantendo la duplicazione del MTOC, la condensazione della cromatina e la migrazione nucleare, il cui fallimento porta all'arresto completo dello sviluppo.
Questo studio sviluppa una pipeline computazionale basata su dati temporali ad alta risoluzione di *Pseudomonas aeruginosa* per quantificare gli effetti dell'inoculo e le dinamiche transitorie dell'antibiotico-susceptibilità, identificando un modello matematico che supera le metriche tradizionali e definisce nuovi criteri per distinguere i regimi dinamici.
Questo studio, il più ampio condotto finora sulle comunità microbiche delle olive da tavola, rivela che il metodo di lavorazione (naturale o alcalino) è il fattore principale che struttura la diversità batterica e fungina, mentre l'elevata variabilità intra-varietale e intra-produttore, dovuta a fattori stocastici e all'uso di piccoli contenitori, impedisce l'identificazione affidabile delle varietà tramite approcci metagenomici, fornendo al contempo una base per lo sviluppo di nuovi starter microbici specifici.
Questo studio identifica e valida peptidi antimicrobici derivati dal microbiota intestinale umano, in particolare l'amp21, come candidati promettenti per disgregare i biofilm di *Pseudomonas aeruginosa* attraverso l'inibizione delle proteine lectiniche LecA e LecB, dimostrando anche l'efficacia superiore di peptidi ultracorti progettati a partire da questi lead.
Questo studio sulla coorte Lifelines NEXT analizza l'origine, la persistenza e i fattori che influenzano il viroma intestinale nelle madri e nei neonati, rivelando che la diversità virale materna è la fonte primaria per il bambino, che il parto e l'allattamento ne guidano lo sviluppo e che un'alta diversità virale è associata allo sviluppo di allergie alimentari.
Questo studio contesta la validità delle conclusioni di Hariharan et al. sull'inefficacia delle particelle interferenti terapeutiche (TIP) contro l'HIV, sostenendo che i dati osservazionali post-hoc non possono dimostrare l'efficacia terapeutica, che le stime del numero di riproduzione di base (R0) sono incoerenti con la dinamica virale e che esistono meccanismi alternativi sufficienti a spiegare le osservazioni riportate.