Integrating Mechanistic Modeling and Machine Learning to Study CD4+/CD8+ CAR-T Cell Dynamics with Tumor Antigen Regulation

Questo lavoro presenta un modello matematico esteso che integra la dinamica delle cellule CAR-T CD4+ e CD8+ con la regolazione dell'antigene tumorale, dimostrando come l'uso combinato di simulazioni meccanicistiche e reti neurali possa migliorare la previsione dei risultati terapeutici nonostante l'incertezza dei parametri.

Saranya Varakunan, Melissa Stadt, Mohammad KohandelWed, 11 Ma🧬 q-bio

More than a feeling: Expressive style influences cortical speech tracking in subjective cognitive decline

Questo studio dimostra che un maggiore declino cognitivo soggettivo è associato a un indebolimento del tracciamento corticale delle caratteristiche linguistiche di alto livello durante l'ascolto di discorsi privi di espressività prosodica, suggerendo tale meccanismo come potenziale biomarcatore per le fasi iniziali del declino cognitivo.

Matthew King-Hang Ma, Yun Feng, Cloris Pui-Hang Li, Manson Cheuk-Man FongWed, 11 Ma🧬 q-bio

Understanding the temperature response of biological systems: Part I -- Phenomenological descriptions and microscopic models

Questo primo articolo di una revisione in due parti esamina i modelli fenomenologici e microscopici utilizzati per descrivere le risposte delle reazioni biologiche alla temperatura, evidenziando le deviazioni dal comportamento di Arrhenius e definendo grandezze operative come le temperature ottimali e i limiti termici.

Simen Jacobs, Julian Voits, Nikita Frolov, Ulrich S. Schwarz, Lendert GelensWed, 11 Ma🧬 q-bio

Domain-aware priors stabilize, not merely enable, vertical federated learning in data-scarce coral multi-omics

Il paper dimostra che l'integrazione di priorità biologiche e la selezione delle caratteristiche guidate dalla salienza dei gradienti nel framework VFL REEF stabilizzano l'apprendimento federato verticale in condizioni di scarsità estrema dei dati, permettendo una classificazione efficace dello stress termico nei coralli che supera significativamente i metodi convenzionali.

Sam VictorWed, 11 Ma🧬 q-bio

Exploring Strategies for Personalized Radiation Therapy Part IV: An Interaction-Picture Approach to Quantifying the Abscopal Effect

Questo studio introduce un approccio basato sulla trasformazione "interaction-picture" della meccanica quantistica per quantificare l'effetto abscopale come fenomeno stocastico continuo nei modelli di tumore bilaterale, offrendo un metodo standardizzato per valutare le risposte sistemiche nella radioterapia adattiva ultra-frazionata personalizzata (PULSAR).

Hao Peng, Laurentiu Pop, Kai Jiang, Faya Zhang, Debabrata Saha, Raquibul Hannan, Robert TimmermanWed, 11 Ma🧬 q-bio

The Black Death Anomaly: A Non-Abelian Field Theory of Epidemiological Safe Zones

Questo lavoro risolve le anomalie storiche della Peste Nera, come le vaste zone sicure, modellando la dinamica epidemica attraverso una teoria di campo di gauge non-abeliana che dimostra come l'interferenza distruttiva delle onde di mutazione generi topologicamente nodi macroscopici stabili, spiegando matematicamente la sopravvivenza di regioni come Polonia e Boemia.

Jose de Jesus Bernal-Alvarado, David DelepineWed, 11 Ma🧬 q-bio

Sequential learning theory for Markov genealogy processes

Questo articolo introduce un framework basato sulla filtrazione per analizzare come l'aggiunta di taxa migliori l'inferenza filodinamica, decomponendo la riduzione della varianza attesa in componenti di apprendimento, disallineamento e covarianza, e dimostrando l'esistenza di un limite fondamentale irriducibile per ciò che i dati sequenziali possono rivelare sulla genealogia latente a causa del divario tra le garanzie di apprendimento ottenibili da un oracolo e quelle disponibili per l'analista.

David J PascallWed, 11 Ma🧬 q-bio

Misspecification of the generation time distribution and its impact on Rt estimates in structured populations

Questo studio dimostra che la mancata considerazione della variabilità della distribuzione dei tempi di generazione tra diversi gruppi demografici può portare a stime errate del numero di riproduzione Rt, sottolineando la necessità di raccogliere dati epidemici dettagliati e di adottare modelli strutturati per migliorare l'accuratezza delle risposte di sanità pubblica.

Ioana Bouros, Robin Thompson, David Gavaghan, Ben LamberWed, 11 Ma🧬 q-bio

Association of Radiologic PPFE Change with Mortality in Lung Cancer Screening Cohorts

Questo studio dimostra che la progressione radiologica della fibroelastosi pleuroparenchimale (PPFE) nei programmi di screening per il cancro del polmone è associata indipendentemente a un aumento della mortalità e a esiti clinici avversi, suggerendo che la sua valutazione quantitativa possa fungere da biomarcatore utile per identificare individui ad alto rischio respiratorio.

Shahab Aslani, Mehran Azimbagirad, Daryl Cheng, Daisuke Yamada, Ryoko Egashira, Adam Szmul, Justine Chan-Fook, Robert Chapman, Alfred Chung Pui So, Shanshan Wang, John McCabe, Tianqi Yang, Jose M Brenes, Eyjolfur Gudmundsson, The SUMMIT Consortium, Susan M. Astley, Daniel C. Alexander, Sam M. Janes, Joseph JacobWed, 11 Ma🧬 q-bio

Joint Geometric-Chemical Distance for Protein Surfaces

Il documento presenta IFACE, un nuovo framework basato su corrispondenze che allinea le superfici proteiche accoppiando probabilità di geometria intrinseca e campi chimici spaziali per derivare una distanza congiunta geometrico-chimica capace di distinguere la variabilità conformazionale dalla divergenza strutturale e di identificare tasche catalitiche conservate.

Himanshu Swami, John M. McBride, Jean-Pierre Eckmann, Tsvi TlustyWed, 11 Ma🧬 q-bio

Modeling the spillover risk of highly pathogenic avian influenza from wild birds to cattle in Denmark: A data-driven risk assessment framework

Questo studio presenta un quadro di valutazione del rischio basato sui dati per stimare la probabilità settimanale di spillover dell'influenza aviaria altamente patogena H5N1 dagli uccelli selvatici al bestiame bovino in Danimarca, identificando aree e periodi ad alto rischio per potenziare la sorveglianza e la preparazione.

You Chang, Jose L. Gonzales, Erik Rattenborg, Mart C. M. de Jong, Beate ConradyThu, 12 Ma🧬 q-bio