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🧬 biologia

The multiple stress-tolerant gene OsSRDPexhibited nitrogen stress adaptation by transcriptional regulation of downstream genes, regulation of plant secondary metabolism and carbon-nitrogen metabolic reprogramming

Questo studio dimostra che il gene multi-tollerante allo stress OsSRDP migliora l'adattamento allo stress da azoto nel riso transgenico regolando i geni a valle coinvolti nella riprogrammazione del metabolismo del carbonio-azoto e nel metabolismo secondario, offrendo così una potenziale strategia per migliorare l'efficienza dell'uso dell'azoto.

Meena Subbaiah, Karikalan Jayaraman, Jeevanandhan Kittan, Sachin Phogat, Maga Vishnu T., Amitha Mithra Sevanthi, Dwijesh (…)2026-10-15
🧬 biologia

Ancestry-Associated Pathway Enrichment and Network Architecture in Severe Asthma: Airway Remodelling, Epithelial Barrier and Sex-Adjusted Analysis

Questo studio caratterizza l'arricchimento di pathway e le reti di co-espressione genica associati all'ascendenza nell'asma grave utilizzando la trascrittomica del sangue intero, identificando il Rimodellamento delle Vie Aeree come un pathway costantemente arricchito negli individui di ascendenza europea, evidenziando al contempo i limiti delle piccole dimensioni del campione e della mancanza di dati sulla composizione cellulare per un'inferenza di rete comparativa robusta.

Adekunle O. Adeluwoye, Watafua Miriam, Lawal Jamiu, Katherine O. David, Ayanfeoluwa Alabetutu2026-10-15
🧬 biologia

Scoring the downstream chain of small-n label-free proteomics against known ratios: search engine, match-between-runs, imputation, differential testing and enrichment background on a public three-species benchmark

Questo studio mette a confronto un dataset proteomico pubblico senza marcatura di tre specie per dimostrare che le scelte analitiche a valle — specificamente riguardo al match-between-runs, all'imputazione, ai test differenziali e agli sfondi di arricchimento — possono alterare i tassi di falsa scoperta fino a 34 volte, raccomandando infine una combinazione di soglie di fold-change, filtraggio rigoroso e selezione appropriata dello sfondo per minimizzare i segnali falsi.

Byeongsoo Kang2026-10-15
🧬 biologia

AI-Driven Pharmacogenomic Modeling of Gene–Micronutrient Interactions in Pulmonary Tuberculosis: An in-Silico Study Using Synthetic Patient Data

Questo studio in silico dimostra la fattibilità dell'uso di un framework guidato dall'IA, specificamente XGBoost con interpretazione SHAP, per modellare le interazioni non lineari tra i genotipi BCL2/TNF e i livelli di micronutrienti nella previsione degli esiti del trattamento della tubercolosi polmonare utilizzando una coorte sintetica di pazienti.

Dhivya S. Rajasekaran, Sivaraj Rengaraj, Satyavani Kaliamurthi, Gurudeeban Selvaraj2026-10-15
🧬 biologia

The microbial community living within the rust fungus Uromyces hawksworthii assessed through metagenome analysis

Questo studio ha utilizzato l'analisi metagenomica dei geni 16S rRNA e ITS per rivelare che le strutture delle comunità batteriche e fungine all'interno delle spore di *Uromyces hawksworthii* differiscono significativamente tra le fasi di aecio e telio, suggerendo che questi profili microbici possano distinguere gli stadi di sviluppo e potenzialmente spiegare le variazioni nell'abbondanza degli iperparassiti.

Andre Freire Cruz, Denise Vilela Resende, Luiz Eduardo Bassay Blum2026-10-15
🧬 biologia

EEG microstate-source coupling is spatially preserved in ALS

Questo studio dimostra che, sebbene la sclerosi laterale amiotrofica (SLA) alteri la dinamica temporale dei microstati EEG, l'accoppiamento spaziale tra questi microstati e le loro sottostanti sorgenti cerebrali distribuite rimane stabile e riproducibile, suggerendo che le organizzazioni spaziali e temporali dei microstati siano governate da meccanismi parzialmente indipendenti.

Marjorie Metzger, Gabriel Costa, Stefan Dukic, Roisin McMackin, Eileen Giglia, Matthew Mitchell, Saroj Bista, Yasmine Ta (…)2026-10-15
🧬 biologia

Global environmental drivers of soil microbiome structure: a systematic review and meta- analysis

Questa revisione sistematica e meta-analisi di 100 studi globali identifica il pH del suolo come il principale driver della struttura della comunità batterica, quantificando al contempo gli impatti significativi della vegetazione, dell'intensificazione dell'uso del suolo e del prolungato tempo di recupero della composizione microbica rispetto alla diversità a seguito del ripristino degli ecosistemi.

Abhinav Yadav, Neha Singh Chandel2026-10-14
🧬 biologia

A Circulating TLR2 pos CD14 neg CD16 neg “Unclassified Subset” is Decreased in Multiple Myeloma Patients and May Comprise CD163 pos Dendritic Cells

Questo studio identifica un sottogruppo di cellule circolanti precedentemente trascurato, TLR2-positivo, CD14-negativo, CD16-negativo nei pazienti con mieloma multiplo che fenotipicamente somiglia alle cellule dendritiche CD163-positive piuttosto che ai monociti, rivelando come la sua significativa riduzione nella malattia possa contribuire alla disregolazione immunitaria e sottolineando come le strategie di gating influenzino criticamente la classificazione dei sottogruppi cellulari.

Mie Wolff Kristensen, Sarah Lindhøj Kvorning, Holger Jon Møller, Marianne Hokland, Thomas Vorup-Jensen, Morten Nørgaard (…)2026-10-14
🧬 biologia

Single Nostril Breathing Modulates EEG Microstate Dynamics, Cortical Source Activity, and Functional Connectivity in Healthy Adults

Questo studio dimostra che la respirazione guidata con una singola narice in adulti sani modula la dinamica cerebrale su larga scala alterando le transizioni dei microstati EEG, aumentando l'attività in specifiche regioni corticali come il cingolato anteriore e l'insula, e inducendo un disaccoppiamento funzionale specifico per frequenza all'interno delle reti di salienza, attenzione e controllo esecutivo.

Kumar Abhishek, Sweta Sweta, Prashant Tayade, Suriya Prakash Muthukrishnan, Simran Kaur, Ratna Sharma2026-10-14