🧬 biology

An Acinetobacter baumannii acyltransferase represses pilin production to maintain energy homeostasis and overcome nutritional immunity

Lo studio identifica l'aciltransferasi AimS di *Acinetobacter baumannii* come un fattore critico per superare l'immunità nutrizionale dell'ospite reprimendo la produzione di pili e la formazione di biofilm tramite il regolatore CsuR, risparmiando così l'ATP cellulare per mantenere l'omeostasi energetica e garantire la fitness batterica durante l'infezione respiratoria.

Eric Skaar, Dillon Kunkle, Owen Burroughs, Christopher Corcoran2026-06-30
🧬 biology

A Network-Control Approach to Seizure Intervention via Adjoint Optimal Control

Questo articolo propone un sistema di stimolazione cerebrale profonda a ciclo chiuso che utilizza un modello basato su rete di 60 regioni cerebrali come oscillatori di Hopf, combinando un rilevatore predittivo con una strategia di controllo a due livelli (regolazione lineare-quadratica e controllo ottimale aggiunto) per prevenire con successo biforcazioni di tipo epilettico nel 100% delle simulazioni.

Aadi Deosthaler, Samarth Muralidhara, Yashas Anil2026-06-30
🧬 biology

Aging reprograms the functional, epigenetic, and metabolic landscape of macrophages

Questo studio rivela che l'invecchiamento riprogramma attivamente i macrofagi attraverso cambiamenti coordinati in epigenetica, metabolismo e funzione — caratterizzati da una ridotta risposta alle citochine, un metabolismo lipidico alterato e cambiamenti fenotipici specifici — piuttosto che causare semplicemente un declino funzionale, offrendo così un nuovo quadro per comprendere l'inflammaging e le malattie legate all'età.

Manasa Suresh, Francisco Tapia Belmonte, Bryan T. Weselman, Xintang Li, Marie Durr, Isabella Duchovny, Yanitza Gutierrez (…)2026-06-30
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Multi-state modeling associates proliferation genes with early estrogen receptor-positive breast cancer recurrence and survival

Questo studio utilizza la modellazione multi-stato per dimostrare che l'alta espressione basale di geni correlati alla proliferazione è significativamente associata alla recidiva precoce e alla successiva mortalità nel carcinoma mammario con recettori degli estrogeni positivi ad alto rischio, mentre la recidiva tardiva è legata a percorsi di segnalazione distinti.

Yongzhe Wang, Christine Quinones, Irene Kang, Hope Rugo, Ernest Martinez, Victoria Seewaldt, Joanne Mortimer, Aritro Nat (…)2026-06-30
🧬 biology

Single-Cell Foundation Models in Biotechnology: A Scoping Review and Bibliometric Analysis of Multimodal AI for Cell-State, Perturbation, and Biomarker Prediction

Questa revisione sistematica e analisi bibliometrica di 1.042 studi rivela che, sebbene i modelli di fondazione single-cell stiano espandendosi rapidamente nel settore biotecnologico, il campo soffre di una riproducibilità inconsistente, di una scarsa rigorosità nei benchmark e di una mancanza di risorse aperte, con semplici baseline che spesso si dimostrano competitive rispetto ad architetture complesse.

Behin Omidi, Mohammmad Mahdi Hemati Aalm, Arshia Farmahini Farahani, Amir Reza Hassan Poor Barkadehi2026-06-30
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Identification of Differentially Expressed Genes Related to UFMylation Modifications in Periodontitis: Integrated Insights from Transcriptomics and Clinical Experiments

Questo studio integra l'analisi trascrittomica, l'apprendimento automatico e la validazione clinica per identificare C4A, GANAB e TUBA4A come biomarcatori diagnostici chiave legati alla UFMilazione per la parodontite, elucidando i loro ruoli nelle vie immunitarie e metaboliche e proponendo potenziali bersagli terapeutici.

Changqing Mu, Juan Liu, Kaining Liu, Xiaofeng Huang2026-06-30
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Timing of menstrual cups to prevent transition from optimal to not optimal vaginal microbiome community state type: Results from a 6.5-year prospective observational cohort

In uno studio di coorte prospettico di 6,5 anni condotto su studentesse delle scuole secondarie keniote, l'uso della coppetta mestruale ha ridotto significativamente il rischio di transizione da un microbioma vaginale ottimale a dominanza di *L. crispatus* verso uno stato non ottimale, suggerendo che fornire le coppette prima del debutto sessuale sia cruciale per mantenere la salute vaginale.

Supriya Mehta2026-06-30
🧬 biology

Ethnicity-Stratified Inflammatory Phenotyping Using GMM Clustering and XGBoost Regression: A Cross-Ethnicity Nearest-Neighbour Framework for Precision CRP Estimation in NHANES 2017–2023

Questo studio utilizza un framework di machine learning a due stadi che combina il clustering GMM e la regressione XGBoost sui dati NHANES 2017–2023 per rivelare che le risposte della proteina C-reattiva (CRP) guidate dai macronutrienti variano significativamente per fenotipo metabolico ed etnia, evidenziando un "Paradosso della Resilienza alle Fibre" nelle popolazioni afroamericane non ispaniche e raccomandando un approccio di nutrizione di precisione stratificato.

Anshul Iyer, Vania Sharma2026-06-30
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EEG Signal Variance as a Biomarker for Ictal State Classification: Subject-Level Validation of a Random Forest Classifier using the University of Bonn Dataset

Questo studio dimostra che la varianza del segnale EEG è un biomarcatore robusto per distinguere gli stati ictal e valida il fatto che un classificatore Random Forest, addestrato sul dataset dell'Università di Bonn con una rigorosa partizione dei dati a livello di soggetto per prevenire il leakage, raggiunge un'elevata accuratezza (96,2%) e sensibilità (98,3%) nel rilevamento delle crisi epilettiche.

Md. Ahasanul Al Hasib Ayon2026-06-30