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🧬 biology

Multi-predictor pathogenicity filtering and membrane-specific stability analysis identify and characterize candidate destabilizing missense variants of the GIP receptor (GIPR)

Integrando il filtraggio della patogenicità tramite multi-predittore con l'analisi della stabilità specifica di membrana, questo studio identifica e caratterizza 14 varianti missenso rare e strutturalmente destabilizzanti nel recettore GIP (GIPR) che probabilmente impattano la funzione e fungono da base per la futura ricerca farmacogenetica.

Sabbir Ahmad Antor, Mahjabin, Nurnabi Azad Jewel2026-06-29
🧬 biology

Artificial Intelligence-Driven Insights into the Antioxidant and Anticancer Properties of Onion (Allium cepa) and Tomato (Solanum lycopersicum) in Prostate Cancer Prevention and Management: A Contemporary Review

Questa recensione contemporanea sintetizza le prove sulle proprietà antiossidanti e anticancro dei fitochimici di cipolla e pomodoro nella prevenzione del tumore alla prostata, evidenziando come gli approcci guidati dall'intelligenza artificiale, quali il docking molecolare e l'apprendimento automatico, possano superare le attuali barriere traslazionali mediante la prioritarizzazione sistematica dei composti bioattivi e l'elucidazione dei loro meccanismi molecolari, nonostante le ambiguità cliniche esistenti.

Alli Ayobami O.2026-06-29
🧬 biology

Curvana: an R package and Shiny Web app for analyzing AFM force curves

Il documento presenta Curvana, un pacchetto R open-source e un'applicazione web Shiny progettati per automatizzare e snellire l'analisi end-to-end delle curve forza-distanza della microscopia a forza atomica (AFM), offrendo una soluzione intuitiva per convertire i dati grezzi in metriche di interazione significative senza richiedere competenze di programmazione o installazioni locali complesse.

Yue Zhang, Zhaoyang Wang, Xitong Liu2026-06-29
🧬 biology

Hierarchically supervised computational pathology stratifies HER2 categories and ERBB2 amplification risk from routine H&E slides in breast cancer

Il documento introduce CHERISH, un framework di patologia computazionale a supervisione gerarchica che sfrutta vetrini H&E di routine per stratificare accuratamente le categorie HER2 e predire il rischio di amplificazione di ERBB2 incorporando la logica dei test clinici nella sua architettura, superando così i limiti dei modelli convenzionali e riducendo la necessità di test di conferma ad alta intensità di risorse.

Xiaohua Zeng, Yansong Ba, Long Wang, Xiaomin Xiong, Xin Zhou, Qingming Jiang, Sihao Liu, Shanqi Li, Zhigang Pei, Tao Zha (…)2026-06-29
🧬 biology

Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics

Questo articolo introduce Spec-ReX, un metodo di Intelligenza Artificiale Spiegabile basato sulla responsabilità causale per la spettroscopia vibrazionale nella diagnostica del cancro, e ne valida rigorosamente le prestazioni rispetto ad altre tecniche di XAI attraverso dataset in silico, in vitro ed ex vivo per rispondere alla critica necessità di processi decisionali clinici trasparenti.

Nathan Blake, David Kelly, Sarah Kapllani-Mucaj, Rong Wang, Geraint Thomas, Hana Chockler2026-06-29
🧬 biology

Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal

Questo studio rivela che l'estrusione di loop mediata da coesina lega forche di replicazione adiacenti per promuoverne il rallentamento e la reversione durante lo stress da replicazione inibendo PRIMPOL, integrando così l'organizzazione del genoma con la tolleranza al danno del DNA per proteggere la stabilità genomica.

Massimo Lopes, Daniel González Acosta, Daniel Giménez-Llorente, Melani Rodrigues, Moses Aouami, Orhi Barroso-Gomila, Jav (…)2026-06-29
🧬 biology

The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner

La missione Artemis I ha indotto cambiamenti dipendenti dal genotipo nei profili degli amminoacidi dei semi e nella crescita post-volo in *Arabidopsis thaliana*, rivelando che il metabolismo degli amminoacidi a catena ramificata è un fattore critico che influenza le risposte delle piante all'esposizione allo spazio profondo.

Joanne E Thomson, Evan Angelos, Ramona Gaza, Dinah Dimapilis, Ye Zhang, Kamber Scott, James O’Keefe, Federica Brandizzi2026-06-29
🧬 biology

Genetic dissection of dynamic leaf area index variation in maize using UAV-based phenotyping and time-series genome-wide association studies

Questo studio stabilisce un quadro robusto che integra il fenotipizzazione multispettrale basata su UAV e gli studi di associazione genome-wide in serie temporali per identificare loci genetici dinamici e il gene candidato *Zm00001d048615* che regolano l'indice di area fogliare del mais, offrendo obiettivi preziosi per il miglioramento dell'architettura della chioma e della resa.

Xuyang Wang, Jiaojiao Ren, Penghao Wu2026-06-29
🧬 biology

Sustained transcription and permissive chromatin in murine spermiogenesis

Questo studio mette in discussione la visione consolidata secondo cui la spermiogenesi comporti un silenziamento trascrizionale globale, dimostrando che il genoma aploide rimane trascrizionalmente attivo e dinamicamente organizzato durante questa fase, rendendo necessaria una ridefinizione del differenziamento degli spermatidi tardivi come un periodo di specializzazione trascrizionale piuttosto che di spegnimento.

Bing Li, Yimin Lao, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Mengyuan Peng, Qi Zhang, Ming Yu, Lijuan He, Meiyang Liu, Mingqian Hu, Yuq (…)2026-06-29
🧬 biology

Daily symptom reports enable four-phase menstrual cycle tracking without wearables: Implications for equitable digital health

Questo studio dimostra che un modello ibrido di apprendimento automatico che utilizza la variabilità giornaliera dei sintomi auto-riportati può classificare accuratamente quattro fasi del ciclo mestruale senza l'ausilio di sensori indossabili, offrendo una soluzione scalabile ed equa per il monitoraggio della salute riproduttiva globale.

Bernhard Specht, Mohammad EL-Khozondar, Samaher Garbaya, Reinhard Schneider, Djamel Khadraoui, Zied Tayeb2026-06-29