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🧬 biologia

Deriving and Transferring the SPEARpesticide Bioindicator to a New Region: an Ecotoxicity-Based, Indigenous-Fauna Sensitivity Index Field-Validated in the Seomjin River, South Korea

Questo studio ha adattato con successo e validato sul campo un bioindicatore specifico per i pesticidi per il fiume Seomjin in Corea del Sud, integrando i dati di tossicità di 20 specie autoctone, dimostrando che il controllo dei gradienti di inquinamento organico rivela una robusta correlazione tra l'indice e l'esposizione ai pesticidi che le metriche di diversità standard non possono rilevare.

Jong-Hyeon Lee, Jang-Yeon Park, Su-Hyun Kim, Seung-Been Heo2026-10-23
🧬 biologia

Data-Efficient Personalization of Gait Biomechanics: The Predominant Contribution of Subject-Specific Waveform Shape

Questo studio dimostra che la personalizzazione della biomeccanica del cammino per i momenti articolari degli arti inferiori utilizzando dati limitati specifici del soggetto è guidata principalmente dall'adattamento della forma dell'onda temporale piuttosto che dell'ampiezza, risultando in significativi miglioramenti dell'accuratezza della previsione rispetto ai modelli basati sulla popolazione generale.

Syed Riyas Ahamed, Sandip Saha, Awani Bhushan2026-10-23
🧬 biologia

Intratumor Heterogeneity Through the Lens of Gene Regulatory Networks

Analizzando i dati scRNA-seq attraverso molteplici tipi di cancro e coorti di trattamento, questo studio inferisce reti di regolazione genica specifiche per il clone per dimostrare che i cloni tumorali esibiscono architetture regolatorie distinte legate alla fitness, dove il rimodellamento indotto dal trattamento guida la divergenza strutturale pur mantenendo la convergenza funzionale, rivelando infine reguloni conservati e variabili associati alla sopravvivenza del paziente.

Narein Rao, Nicolae Sapoval, Luay Nakhleh, Hamim Zafar2026-10-23
🧬 biologia

Inflammatory stimuli promote lipid accumulation in myelin-phagocytosing macrophages: effects of LXR, PPARγ and RXR agonists

Questo studio dimostra che gli stimoli infiammatori compromettono la rimozione della mielina promuovendo l'accumulo di lipidi nei macrofagi, un processo che può essere mitigato da agonisti dei recettori nucleari LXR, PPARγ e RXR, suggerendo questi recettori come potenziali target terapeutici per le lesioni del SNC che coinvolgono detriti lipidici.

Lorenzo Romero-Ramírez, Natalia Díaz-Rubio, Alejandro Arriero-Cabañero, Jörg Mey2026-10-23
🧬 biologia

Target-label design, not feature scarcity, drives cross-library transfer failure in CRISPRi/a guide-efficacy models

Questo studio dimostra che l'incapacità dei modelli di efficacia di CRISPRi/a di generalizzare tra diverse librerie di guide e linee cellulari è guidata principalmente dalla normalizzazione delle etichette all'interno del gene piuttosto che da una mancanza di caratteristiche della cromatina, poiché il riaddestramento con etichette continue armonizzate ha significativamente ripristinato le prestazioni di trasferimento.

Daniel Albuja2026-10-23
🧬 biologia

Functional analysis of mango MiFCA2 gene involved in the regulation of flowering and stress response in Arabidopsis

Questo studio caratterizza due geni FCA2 del mango (MiFCA2-SJ e MiFCA2-JH), dimostrando la loro localizzazione nucleare, l'interazione con proteine legate allo stress e i distinti ruoli nel promuovere la fioritura precoce sotto stress termico e nel modulare le risposte alla siccità e alla salinità attraverso la via di segnalazione dell'ABA.

Siyuan He, Yanshu Meng, Mingyang Shu, Zhixi He, Xiao Mo, Shuquan Chen, Wenjing Mo, Yuexing Zhang, Cong Luo, Xinhua He2026-10-23
🧬 biologia

The necessity of data-driven optimization of the number of principal components in scRNA-seq analysis - examples on real and simulated data

Questo studio dimostra che, sebbene i valori predefiniti fissi per il numero di componenti principali funzionino spesso, l'ottimizzazione basata sui dati è essenziale per l'analisi scRNA-seq a causa della variabilità degli intervalli ottimali tra i diversi dataset, e fornisce raccomandazioni pratiche per la selezione di tali metodi sulla base di una valutazione completa di dati reali e simulati.

Manja Grønberg, Alisa Pavel, Line Clemmensen2026-10-23
🧬 biologia

The reassembly of plant-pollinator interactions along tropical forest succession

Sebbene l'abbondanza degli impollinatori e la struttura della rete rimangano resilienti e facilitino il flusso di polline attraverso i paesaggi agricoli durante il recupero della foresta tropicale, il pieno ripristino delle interazioni specializzate pianta-impollinatore e della complessità della rete delle foreste primarie è significativamente ritardato, impiegando decenni per ricomporsi.

Ugo Diniz, Alexander Keller, Gunnar Brehm, Claus Rasmussen, Katharina Veltman, Santiago Erazo, Santiago Burneo, Marco Ts (…)2026-10-23
🧬 biologia

Restoring the p53--Nrf2--SIRT3--TFAM Axis via Therapeutic Epigenetic Shielding Reverses Bioenergetic Collapse and Nucleoid-Phagy Failure in Long COVID

Questo studio propone un framework di biologia dei sistemi dimostrando che il collasso bioenergetico e l'infiammazione cronica del Long COVID derivano dalla soppressione mediata da CD147 dell'asse p53--Nrf2--SIRT3--TFAM, che compromette la funzione mitocondriale e la nucleoid-fagia, ma che può essere invertita attraverso uno scudo epigenetico terapeutico per ripristinare questo cascata regolatoria.

Boominathan Lakshmanane2026-10-23
🧬 biologia

Predicting Macroscopic Axon Topology from Microscopic Kinematics: An Interactive Tracking and Random Walk Pipeline for Substrate-Dependent Cortical Neurospheres

Questo studio introduce una pipeline di tracciamento interattivo e cammino casuale che utilizza neurosfere corticali a controllo dimensionale per quantificare la cinematica assonale dipendente dal substrato, collegando con successo la dinamica di crescita microscopica alla topologia di rete macroscopica per predire l'architettura dei circuiti in vitro.

Chunghwan Kim, Myungbo Kim, Hanlin Cao, Tsung-yeh Hsieh, Yongjie Jessica Zhang, Tzahi Cohen-Karni, Victoria A. Webster-W (…)2026-10-23