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🧬 biologia

Integrative GC–MS Metabolite Profiling and Structure-Based Molecular Docking for Identification of Antibacterial Leads from Calotropis gigantea and Nyctanthes arbor-tristis

Questo studio identifica la *Nyctanthes arbor-tristis* come una fonte superiore di fitochimici antibatterici contro i patogeni multiresistenti, evidenziando l'α-tocoferolo-β-D-mannoside come un promettente candidato principale attraverso il profilo integrato GC-MS, saggi in vitro, predizione ADMET e docking molecolare.

Suparna C Chakraborty, Rohini Kulkarni2026-09-01
🧬 biologia

50µm ex vivo MRI reveals distant layer-specific hippocampal atrophy in early Alzheimer's disease

Utilizzando una risonanza magnetica ex vivo a ultra-alta risoluzione da 50 µm, questo studio rivela che la malattia di Alzheimer precoce (stadio di Braak II) è caratterizzata da un'atrofia distale e specifica per strato nelle regioni anteriori di CA1 e del subiculum, la quale è fortemente guidata dalla patologia tau nelle aree entorinali a monte piuttosto che dal carico di tau locale.

Yasmine Salman, Sandra O. Tomé, Nicolas Joudiou, Amanda Annettesdotter, Pulkit Khandelwal, Tevi M. Lawson, Catherine Beh (…)2026-09-01
🧬 biologia

Deciphering the Multi-Target Anti-Diabetic Mechanisms of Chrysin Using Integrated Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations

Questo studio impiega un approccio integrato di farmacologia di rete, docking molecolare e dinamica molecolare per elucidare che la crisina esercita effetti antidiabetici bersagliando simultaneamente proteine chiave come GSK3β e modulando percorsi critici quali PI3K/Akt e NF-κB per regolare il metabolismo del glucosio, l'infiammazione e lo stress ossidativo.

Ghanshyam Mapare, Sateesh Belemkar2026-09-01
🧬 biologia

A permutation-null artifact drives a conservation–divergence spectrum's signature trend, and phylogeny dominates a protein language model's per-position coupling signal

Questo articolo dimostra che la tipica tendenza negativa nello spettro conservazione–divergenza è in gran parte un artefatto del suo modello nullo di permutazione e che i segnali di accoppiamento per posizione dei modelli linguistici proteici sono guidati prevalentemente dalla filogenesi piuttosto che dal meccanismo funzionale, stabilendo un quadro rigoroso per l'esame incrociato di modelli black-box contro prove evolutive indipendenti.

Huazhang Shen2026-09-01
🧬 biologia

An Auditable Complexity Ladder for Mechanism-Level Experiments in Artificial Life

Questo articolo introduce un protocollo di scala della complessità a undici livelli e verificabile per esperimenti sui meccanismi di vita artificiale che garantisce affermazioni rigorose e riproducibili attraverso criteri di congelamento prospettici, ritenzione dei fallimenti, isolamento RNG byte-safe ed esplicitazione della gradazione delle prove, dimostrato tramite un modello di cellula minima pur divulgando in modo trasparente i limiti metodologici e gli errori analitici passati.

Huazhang Shen2026-09-01
🧬 biologia

Emergence of collective criticality from future-anticipation maximisation

Questo articolo propone che il principio della Massimizzazione dell'Anticipazione Futura (FAM), secondo cui gli individui massimizzano localmente la diversità degli stati percettivi futuri attraverso l'anticipazione reciproca, generi e mantenga spontaneamente dinamiche collettive di tipo critico e transizioni morfologiche nei gruppi animali senza richiedere una regolazione fine o regole di allineamento esplicite.

Takayuki Niizato2026-09-01
🧬 biologia

Basal expression predicts context-specific drug responses only where they are reproducible: a leakage-safe 47-line LOCO benchmark on Tahoe-100M

Questo benchmark pre-registrato e protetto da perdite di dati dimostra che la capacità dell'espressione del trascritto basale di predire le risposte ai farmaci specifiche per il contesto è fondamentalmente limitata dalla bassa riproducibilità del segnale target, con una predizione significativa che emerge solo per un piccolo sottoinsieme di farmaci in cui la risposta residua è sufficientemente affidabile.

Huazhang Shen2026-09-01
🧬 biologia

HADIA-KB: Evidence-Preserving Digital Knowledge Infrastructure for Jharkhand’s Traditional Rice Beer

HADIA-KB è un'infrastruttura di conoscenza digitale che preserva le evidenze, la quale aggrega e mappa i dati scientifici e culturali frammentati sulla birra di riso tradizionale del Jharkhand in un grafo riproducibile e con fonti documentate, evidenziando esplicitamente le lacune nella documentazione e le variazioni regionali piuttosto che consolidare tradizioni diverse in un unico racconto.

Mohammad Amir Khusru Amir2026-09-01✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biologia

GRP: A Representation-Aware Effective Geometry of Protein State Space

Questo articolo introduce GRP, un framework ispirato alla relatività generale che modella gli spazi di stato proteico come varietà geometriche sensibili alle coordinate per identificare invarianti stabili che collegano le rappresentazioni dell'IA ai vincoli biologici, dimostrando che pochi modi dominanti catturano la maggior parte della varianza conformazionale e che i percorsi biologici strutturati esibiscono proprietà di trasporto distinte rispetto ai modelli nulli.

Chuanyang Liu2026-09-01