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🧬 biologia

Genetic diversity, phylogeny, and population structure of Leishmania isolates from cutaneous leishmaniasis patients in Ethiopia

Questo studio rivela che la leishmaniosi cutanea in Etiopia è guidata da un'eziologia complessa e multispecifica dominata da *Leishmania aethiopica* geneticamente diversificata con segni di una recente espansione demografica, insieme a una significativa minoranza di isolati del complesso *L. donovani* e *L. tropica*, evidenziando la necessità di una sorveglianza molecolare potenziata per guidare la gestione clinica.

Girma Shumie, Jose Carlos Solana, Nigatu Negash, Arantxa Marco, Eshetu Molla, Galana Mamo Ayana, Adisu Asefa, Amanuel Al (…)2026-08-31
🧬 biologia

Splicing-derived dual-class MHC neoantigens as candidate biomarkers in melanoma anti-PD-1 response: a pre-registered three-cohort analysis

Questa analisi preregistrata su tre coorti dimostra che i neoantigeni derivati dallo splicing capaci di legare sia le molecole MHC di classe I che di classe II costituiscono un asse biomarcatore distinto e ortogonale al TMB che predice gli esiti di sopravvivenza nei pazienti con melanoma trattati con terapia anti-PD-1, giustificando una validazione prospettica.

Zulkarnain Sajid2026-08-31
🧬 biologia

Global genomic analysis reveals structured redundancy and complementarity in ex situ barley conservation

Integrando i dati genomici di oltre 36.000 accessioni di orzo provenienti da 14 banche del germoplasma, questo studio rivela che la conservazione ex situ globale costituisce un sistema interconnesso caratterizzato da una ridondanza diffusa e strutturata e da una bassa differenziazione tra le istituzioni, suggerendo rendimenti decrescenti da ulteriori campionamenti di genotipi simili.

Martin Mascher, Max Haupt, Paulina Bolc, Matilda Ciucă, Daniel Cristina, Gouripriya Davuluri, Anne Fiebig, Mika Hamaoka (…)2026-08-31
🧬 biologia

Downregulation of Acetyl-CoA Synthetase gene Triggers an Energy Crisis in Monascus fuliginosus M1: Impaired Hyphal Growth Coupled with Adaptive Sporulation Surge via Oxidative Phosphorylation Suppression

La down-regulation del gene dell'acetil-CoA sintetasi (ACS) in *Monascus fuliginosus* innesca una crisi energetica sopprimendo la fosforilazione ossidativa, il che inibisce la crescita miceliare e simultaneamente promuove la sporulazione come strategia di sopravvivenza adattiva.

Lin Lin, Na Zhang, Yuxuan Tian, Lingyu Zhao, Jie Bai2026-08-31
🧬 biologia

A Hybrid Computer Vision and AI Framework for Wildlife Hospital Patient Identification Systems: Kangaroo Facial Recognition as a Case Study

Questo studio propone e valuta un framework guidato dall'IA che integra la visione artificiale e il deep metric learning per automatizzare l'identificazione dei canguri grigi orientali negli ospedali per la fauna selvatica, offrendo una soluzione scalabile e non invasiva per superare i limiti degli attuali metodi di identificazione manuale.

Xin Yiing Loo, Xiaodan Dong, Steve Garlick2026-08-31
🧬 biologia

PRRI: Plasmid Resistance Risk Index Prioritizing Clinically Relevant Plasmid-Associated Antimicrobial Resistant Genes in the Human Gut

Lo studio introduce il Plasmid Resistance Risk Index (PRRI), un quadro di riferimento che dà priorità ai geni di resistenza antimicrobica associati ai plasmidi e clinicamente rilevanti nel microbioma intestinale umano, assegnando loro un punteggio in base a gravità e rarità, rivelando che un piccolo sottoinsieme di geni rari ad alto impatto pone un rischio di trasferimento significativo nonostante la bassa abbondanza complessiva.

Ankish Arya, Sankalp Patil, Prabhat Tripathi, Nidhi Dubey, Pritish Kumar Varadwaj2026-08-31
🧬 biologia

Phenotypic and Molecular Characterization of a Novel blaKPC-202 Variant, Capable of Reverting to blaKPC-2 In Vitro in a Clinical Klebsiella pneumoniae Isolate

Questo studio caratterizza un nuovo isolato di *Klebsiella pneumoniae* che ospita la variante *bla*KPC-20, la quale conferisce resistenza a ceftazidime–avibactam ed eteroresistenza al meropenem attraverso una singolare inserzione tandem di 30 bp che può tornare spontaneamente al genotipo *bla*KPC-2 in vitro, sottolineando la plasticità evolutiva degli enzimi KPC e la necessità di una sorveglianza potenziata.

Qing Chen, Kang Xu, Linlin Xu, Lianyan Xie, Shuzhen Xiao, Jingyong Sun2026-08-31
🧬 biologia

Do Pathology Foundation Models Learn Biology? Uncertainty-Based Evaluation on AML Cytomorphology

Questo studio dimostra che, sebbene i modelli di visione general-purpose possano superare i modelli di fondazione specifici per la patologia nelle metriche di clustering standard, la capacità di questi ultimi di catturare strutture biologicamente significative è meglio rivelata attraverso pattern di incertezza stabili che distinguono tra gli stati di maturazione cellulare nella leucemia mieloide acuta.

Aadil Bhat, Sajad Kawa, Mohammad Munzir2026-08-31
🧬 biologia

Chromosome-scale genome assembly and population genomic analysis of Phomopsis asparagi pathogen reveal genetic diversity among geographical populations

Questo studio presenta un assemblaggio genomico di alta qualità a scala cromosomica del patogeno dell'asparago *Phomopsis asparagi* e un'analisi genomica di popolazione completa degli isolati cinesi, rivelando una significativa diversità genetica e identificando geni candidati legati alla variazione fenotipica per supportare le future strategie di gestione della malattia.

Yu Shi, Chun-Xia Yang, Hao-Han Ning, Yi-Ran Wang, Yuan Wang, Guo-Bing Cui, Wu-Jun Gao, Shu-Fen Li2026-08-31
🧬 biologia

White Noise and Postural Control in Healthy Adults: Differential Effects in Virtual and Non- Virtual Environments

Questo studio rivela che, sebbene il rumore bianco stazionario abbia un impatto complessivo minimo sul controllo posturale negli adulti sani, i suoi effetti individuali variano significativamente tra gli ambienti non virtuali e quelli di realtà virtuale, con una tendenza alla stabilizzazione negli ambienti non VR e alla destabilizzazione in quelli VR.

Jule Kuechler, Neha Mehta, Elizabeth Coker, Marilyn Moffat, Anat V. Lubetzky2026-08-31